Биономия
 | |
| Доступно в | Английский |
|---|---|
| URL-адрес | биономия |
| Коммерческий | Нет |
| Запущен | август 2018 г. |
| Текущий статус | Активный |
Биономия (ранее Bloodhound Tracker) [1] ) — это база данных и инструмент ввода в базу данных, который позволяет присвоить строки имен коллекционеров и систематиков, определяющих данные об образцах, уникальному лицу, которое собрало или идентифицировало образец. Если человек жив, это делается через его идентификатор ORCID , а если человек мертв, через его Викиданных идентификатор . Тем самым устраняется двусмысленность, когда два или более сборщиков имеют одинаковые имена; или когда один коллекционер работал под двумя именами или под одним именем, написанным двумя или более способами. Данные об образцах, связанные с Bionomia и используемые ею, представляют собой агрегированные данные GBIF . [2]
Этот механизм предоставления образцов данных возник в результате проекта [3] по инициативе Национального музея естественной истории в Париже (MNHN) в марте 2019 г. [4] и мотивировано (частично) «всемирной важностью коллекций естествознания, (которые) находятся под угрозой, потому что они критически недостаточно финансируются или недооцениваются. Фактором, способствующим этому очевидному пренебрежению, является отсутствие профессиональной системы вознаграждения, которая количественно определяет и иллюстрирует широту и глубину знаний, необходимых для сбора и идентификации образцов, их хранения, оцифровки их этикеток, мобилизации данных и улучшения этих данных по мере того, как заинтересованные стороны выявляют ошибки и упущения». [5] Это также мотивировано тем фактом, что важная работа систематиков по идентификации образцов в коллекциях по всему миру не получает признания, и эта неудача подводит как учреждения, так и систематиков. [6] В августе 2018 года была запущена Bionomia (под названием Bloodhound Tracker) в качестве заявки на участие в конкурсе Ebbe Nielsen Challenge . [7]
Другие документы, которые устанавливают основу, обоснование и цель Биономии: [8] [9] [10] [11]
Основная задача в Биономии — преобразовать строки имен различных коллекционеров и систематиков, определивших вид экземпляра, в уникальных людей. После этого записи об образцах растений и животных, содержащиеся в загрузках GBIF (на которые постоянно ссылаются DOI), вместе с полученными на их основе документами, [12] и связан с профилями людей Bionomia. Таким образом, таксономическую работу, фундаментальную для исследований растений, можно проследить как до головной организации, так и до систематика, связывая учреждение, систематика и созданную науку.
Таким образом, биономия, количественно оценивая вклад систематиков, позволяет учитывать их работу не только с точки зрения количества образцов, но и с точки зрения количества научных статей.
Содействие
[ редактировать ]Чтобы атрибутировать данные коллекции/идентификации в Bionomia и просмотреть данные профиля коллекционеров/идентификаторов, человеку необходимо войти на сайт Bionomia через идентификатор ORCID (желательно общедоступный).
Профили коллекционеров по умолчанию являются частными, что означает, что профиль любого живого человека, внесшего вклад в сбор данных об образцах, агрегированных GBIF, не может быть просмотрен до тех пор, пока конкретный сборщик/идентификатор не сделает свой профиль общедоступным. Частный профиль означает, что данные сборщика не видны и не проверяются другими. (Однако экземпляры можно приписать и этому человеку.)
При нажатии «Атрибут справки» для профиля появляются образцы записей GBIF со строками, составляющими часть имени человека. Иногда из строки коллекционера/идентификатора, даты, учреждения и страны, в которой он был собран, становится ясно, что образец следует отнести к данному лицу. Однако часто необходимо изучить все данные, записанные для образца, а также может быть фотография самого образца с достаточно высоким разрешением вместе со всеми его аннотациями за прошедшие годы. позволяющий принять или отклонить образец как собранный человеком. Когда кто-то исследует образец, он находится в самой базе данных GBIF, и когда кто-то замечает ошибку, можно уведомить о проблеме по электронной почте куратору учреждения, предоставившего данные.
Примеры
[ редактировать ]Живые люди
[ редактировать ]Например, Кевина Тиле профиль [13] по биономии показывает, что он определил (идентифицировал) около 11 291 ботанический образец как минимум из 12 стран, собрал около 4797 образцов, собранных как минимум из 4 стран, и что 21 из этих образцов (идентифицированных или собранных) был использован в 10 опубликованных статьях, и что по состоянию на 5 июня 2020 г. осталось еще 6% образцов, которые могли быть собраны или идентифицированы им, а могли и не быть. Нажимаем на вкладку «Специализации» [14] показывает, что он собрал 542 экземпляра Myrtaceae и 459 экземпляров Poaceae , идентифицировав при этом 3829 экземпляров Dilleniaceae и 2916 экземпляров Rhamnaceae . Вкладка «Депонировано по адресу» [15] показывает, что собранные им образцы разбросаны по 22 учреждениям.
Профиль Шелли Джеймс [16] показывает, что она определила 2836 ботанических образцов как минимум из 20 стран, собрала 3522 из 5 стран и что 4457 из идентифицированных или собранных ею образцов были использованы в 33 научных работах, в то время как Стилианос Хациманолис (систематик жуков) собрал 31 493 образца. выявлено как минимум в 38 странах, собрано 33 667 образцов как минимум из 15 стран, из которых 6 были использованы в 3 научных работах. [17]
Ранние коллекционеры
[ редактировать ]Мэри Энн МакХард , пионерка из Западной Австралии , которая собирала деньги для Фердинанда фон Мюллера (и чей профиль также общедоступен) [18] Считается, что она собрала по меньшей мере 2072 сохранившихся образца, и они до сих пор вносят вклад в научные знания, а 12 из ее образцов вошли в научную статью. [19]
Герман Беклер , [20] который собирал в Австралии между 1856 и 1862 годами, имеет 3179 дошедших до нас образцов, собранных им, некоторые из которых предположительно собраны в США (источник GBIF ) (таким образом, иллюстрируя мощь этого проекта/веб-сайта в том, что ошибки транскрипции и интерпретации, допущенные в базах данных, могут быть заметили и исправили.) Восемь его образцов были использованы в четырёх научных публикациях. [21] [22] [23] [24] [25]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шортхаус, Дэвид П. (15 июня 2020 г.). «Ребрендинг» . Биономия.нет . Проверено 19 июня 2020 г.
- ^ «Сеть ГБИФ» . www.gbif.org . Проверено 4 июня 2020 г.
- ^ «DataPOC MHNH: ИНСТРУМЕНТ ДЛЯ ИЗУЧЕНИЯ БОГАТСТВ ДАННЫХ, ПОЛУЧЕННЫХ В РЕЗУЛЬТАТАХ ЕСТЕСТВЕННО-НАУЧНЫХ ИССЛЕДОВАНИЙ» . datapoc.mnhn.fr . Проверено 4 июня 2020 г.
- ^ Бесомбес, К.; Шаню, С.; Иллиен, Г. (18 июня 2019 г.). «Люди коллекций: посредники взаимодействия?» . Информатика и стандарты в области биоразнообразия . 3 : е35268. дои : 10.3897/biss.3.35268 . ISSN 2535-0897 .
- ^ Шортхаус, ДП «Биономия: Обоснование» . bionomia.net . Проверено 4 июня 2020 г.
- ^ Макдейд, Луизиана; Мэддисон, ДР; Гуральник, Р.; Пивовар, штат Ха; Джеймсон, ML; Хелген, КМ; Херендин, PS; Хилл, А.; Вис, МЛ (2011). «Биология нуждается в современной системе оценивания профессиональной продуктивности» . Бионаука . 61 (8): 619–625. дои : 10.1525/bio.2011.61.8.8 . ISSN 1525-3244 .
- ^ Шортхаус, Дэвид П. «История» . bionomia.net . Проверено 18 июня 2020 г.
- ^ Вос, Р.; Бисерков Ю.; Балех, Б.; Борода, Н.; Блиссетт, М.; Бреннинкмейер, К.; ван Доорен, Т.; Идс, Д.; Гослайн, Г.; Жених, К.; Хаманн, Т. (16 июня 2014 г.). «Обогащенные данные о биоразнообразии как ресурс и услуга» . Журнал данных по биоразнообразию . 2 (2): е1125. дои : 10.3897/BDJ.2.e1125 . ISSN 1314-2828 . ПМЦ 4092319 . ПМИД 25057255 .
- ^ Жених, К.; Бесомбес, К.; Браун, Дж.; Шаню, С.; Георгиев Т.; Кирни, Н.; Марсер, А.; Николсон, Н.; Пейдж, Р.; Филлипс, С.; Райнер, Х. (13 июня 2019 г.). «Прогресс в авторитетном управлении именами людей для коллекций» . Информатика и стандарты в области биоразнообразия . 3 : е35074. дои : 10.3897/biss.3.35074 . ISSN 2535-0897 .
- ^ Шортхаус, Д.; Пейдж, Р. (8 августа 2019 г.). «Количественная оценка институционального охвата через человеческую сеть в коллекциях естествознания» . Информатика и стандарты в области биоразнообразия . 3 : е35243. дои : 10.3897/biss.3.35243 . ISSN 2535-0897 .
- ^ Пейдж, Р. (13 июня 2019 г.). «Викиданные и график знаний о биоразнообразии» . Информатика и стандарты в области биоразнообразия . 3 : е34742. дои : 10.3897/biss.3.34742 . ISSN 2535-0897 .
- ^ «ГБИФ: Ресурсы (Литература)» . www.gbif.org . Проверено 8 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Кевин Тиле» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Кевин Тиле: Специальности» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП «Кевин Тиле: хранится в» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Шелли Джеймс» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Стилианос Хациманолис» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Мэри Энн МакХард» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Ли, М.; Он, Дж.; Чжао, З.; Лю, Р.; Яо, М.; Ченг, Дж.; Се, Л. (9 марта 2020 г.). «Прогнозное моделирование распространения Clematis sect. Fruticella s. str. в условиях изменения климата показывает расширение ареала во время последнего ледникового максимума» . ПерДж . 8 : е8729. дои : 10.7717/peerj.8729 . ISSN 2167-8359 . ПМК 7067196 . ПМИД 32195054 .
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Герман Беклер» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Шортхаус, ДП (5 июня 2020 г.). «Герман Беклер: Цитаты» . bionomia.net . Проверено 5 июня 2020 г.
- ^ Адхикари, С.; Берк, IC; Эйгенброде, SD (26 мая 2020 г.). Фрид, Г. (ред.). «Биология и управление ромашкой майвидовой (Anthemis cotula L.) — обзор нового глобального захватчика» . Исследования сорняков . 60 (5): 313–322. Бибкод : 2020WeedR..60..313A . дои : 10.1111/wre.12426 . ISSN 0043-1737 .
- ^ Ли, М.; Он, Дж.; Чжао, З.; Лю, Р.; Яо, М.; Ченг, Дж.; Се, Л. (9 марта 2020 г.). «Прогнозное моделирование распространения Clematis sect. Fruticella s. str. в условиях изменения климата показывает расширение ареала во время последнего ледникового максимума» . ПерДж . 8 : е8729. дои : 10.7717/peerj.8729 . ISSN 2167-8359 . ПМК 7067196 . ПМИД 32195054 .
- ^ Рингельберг, Джей-Джей; Циммерманн, штат Невада; Уикс, А.; Лавин, М.; Хьюз, CE (2020). Моулс, А. (ред.). «Биомы как эволюционные арены: конвергенция и консерватизм в трансконтинентальном сочном биоме» . Глобальная экология и биогеография . 29 (7): 1100–1113. Бибкод : 2020GloEB..29.1100R . дои : 10.1111/geb.13089 . hdl : 20.500.11850/419357 . ISSN 1466-822X .
- ^ Каргер, Д.Н.; Кесслер, М.; Конрад, О.; Вайгельт, П.; Крефт, Х.; Кениг, К.; Циммерманн, штат Невада (2019). Гритнес, Ж.-А. (ред.). «Почему линии деревьев на островах ниже — климатические и биогеографические эффекты дают ответ» . Глобальная экология и биогеография . 28 (6): 839–850. Бибкод : 2019GloEB..28..839K . дои : 10.1111/geb.12897 . ISSN 1466-822X . S2CID 91900199 .