Путь неблагоприятного исхода

Путь неблагоприятного исхода ( АОП ) представляет собой структурированное представление биологических событий, приводящих к неблагоприятным последствиям , и считается актуальным для оценки риска. ^[1]^[2]^[3] АОП линейно связывает существующие знания вдоль одной или нескольких серий причинно связанных ключевых событий ( КЭ ) между двумя точками — молекулярным инициирующим событием ( МИЭ ) и неблагоприятным исходом ( АО ), которые происходят на уровне биологической организации, релевантном для оценка риска. ^[2] Связь между событиями описывается связями ключевых событий ( KER ), которые описывают причинно-следственные связи между ключевыми событиями.

АОП важны для расширения использования механистических токсикологических данных для оценки риска и нормативных приложений с недавним применением в других дисциплинах, таких как климатология. ^[2]^[4]^[5]^[6]

Фон

В 2012 году Организация экономического сотрудничества и развития (ОЭСР) запустила новую программу по разработке путей неблагоприятного исхода. В руководящем документе подробно описывается, как следует разрабатывать, анализировать, согласовывать и публиковать АОП на уровне ОЭСР. ^[7] Рабочий процесс разработки и проверки АОП должен осуществляться с помощью веб-инструмента управления ИТ: базы знаний о путях неблагоприятных исходов (AOP-KB). ^[8] который в настоящее время все еще находится в стадии разработки. Это удобный инструмент на основе Wiki, обеспечивающий интерфейс с открытым исходным кодом для совместного использования существующих АОП и создания новых АОП. AOP-KB дает научному сообществу возможность вводить, делиться и обсуждать свои знания, связанные с АОП, в одном центральном информационном центре.AOP-KB позволяет создавать АОП путем ввода и последующего связывания информации о MIE, KE, АО и химических инициаторах .Зная, что элементы маршрута не обязательно уникальны для одного АОП, к существующим знаниям добавляется ценность за счет облегчения повторного использования информации MIE, KE и AO в нескольких АОП, что предотвращает избыточность и делает коллективные знания об этих объектах доступными во всех АОП, в которых они появляются.

AOP-KB представляет собой комбинацию индивидуально разработанных приложений, синхронизированных и организованных таким образом, что дает пользователям возможность собирать, просматривать, просматривать и комментировать АОП, которыми делится сообщество заинтересованных сторон АОП.

Проект AOP-KB представляет собой инициативу Организации экономического сотрудничества и развития , которая реализуется в тесном сотрудничестве между Объединенным исследовательским центром Европейской комиссии , Агентством по охране окружающей среды США и Центром инженерных исследований и разработок . Армейского корпуса США инженеров для целей программы Организации экономического сотрудничества и развития по развитию АОП. ^[3]

АОП также недавно был применен для лучшего понимания воздействия стрессоров, связанных с климатом, что еще больше расширило потенциал АОП на другие научные дисциплины. ^[6]

Более поздние разработки были сосредоточены на анализе сетей АОП. ^[9] и количественная оценка KER с целью разработки математических моделей АОП, иногда называемых количественными АОП. ^[10]

Научные семинары, проведенные для продвижения концепции АОП:

2013
- 23–25 января, Балтимор, США. Обмен опытом для продвижения практического применения токсикологии на основе путей: механизм действия токсичности для печени. ^[11]

2014
- 2–7 марта, Сомма Ломбардо, Италия. Продвижение путей неблагоприятных исходов (AOP) для комплексных токсикологических и нормативных приложений. ^[12]
- 24 августа, Прага, Чехия AOPs 101: Как и почему разрабатывать и использовать ^[13]
- 3–5 сентября, Бетесда, США. Семинар «Пути неблагоприятных исходов: от исследований к регулированию», проводимый Межведомственным центром NTP по оценке альтернативных токсикологических методов (NICEATM) и Комитетом врачей за ответственную медицину. Материалы семинара, включая ссылки на видеотрансляции пленарных заседаний и резюме обсуждений секционных групп, доступны на сайте НТП. ^[14]

Ссылки

^ Национальный исследовательский совет; Отдел исследований Земли и жизни; Совет по экологическим исследованиям и токсикологии; Институт исследований лабораторных животных; Комитет по тестированию и оценке токсичности агентов окружающей среды (2007 г.). Тестирование на токсичность в 21 веке: видение и стратегия . Вашингтон: Национальная академическая пресса. ISBN 978-0-309-15173-3 .
^ Jump up to: ^а ^б ^с Анкли Г.Т., Беннетт Р.С., Эриксон Р.Дж., Хофф Дж.Д., Хорнунг М.В., Джонсон Р.Д. и др. (март 2010 г.). «Пути неблагоприятных исходов: концептуальная основа для поддержки экотоксикологических исследований и оценки рисков» . Экологическая токсикология и химия . 29 (3): 730–741. дои : 10.1002/etc.34 . ПМИД 20821501 . S2CID 26011816 .
^ Jump up to: ^а ^б «Пути неблагоприятного исхода, молекулярный скрининг и токсикогеномика» . ОЭСР.
^ Крамер В.Дж., Эттерсон М.А., Хекер М., Мерфи К.А., Роэсияди Дж., Спейд DJ и др. (январь 2011 г.). «Пути неблагоприятных последствий и оценка экологического риска: переход к последствиям на уровне населения» . Экологическая токсикология и химия . 30 (1): 64–76. дои : 10.1002/etc.375 . ПМИД 20963853 . S2CID 40565681 .
^ Шульц Т.В. (2010). «Глава 14: Пути неблагоприятного исхода: способ связать химическую структуру с токсикологическими опасностями in vivo». В Кронин М., Мэдден Дж. (ред.). Принципы и приложения кремниевой токсикологии . Проблемы токсикологии. Кембридж: Королевское химическое общество. стр. 346–371. дои : 10.1039/9781849732093-00346 . ISBN 978-1-84973-209-3 . Архивировано из оригинала 29 ноября 2014 г. Проверено 16 сентября 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б Дакер Дж., Фалькенберг ЖЖ (2020). «Как тихоокеанская устрица реагирует на закисление океана: разработка и применение метода неблагоприятных последствий, основанного на метаанализе» . Границы морской науки . 7 : 597441. doi : 10.3389/fmars.2020.597441 .
^ «Развитие АОП» (PDF) . oecd.org . ОЭСР.
^ «База знаний о путях неблагоприятного исхода (AOP-KB)» .
^ Спину Н., Бал-Прайс А., Кронин М.Т., Енох С.Дж., Мэдден Дж.К., Worth AP (октябрь 2019 г.). «Разработка и анализ сети путей неблагоприятного исхода нейротоксичности человека» . Архив токсикологии . 93 (10): 2759–2772. дои : 10.1007/s00204-019-02551-1 . ПМИД 31444508 . S2CID 201283568 .
^ Пайни А., Кампия I, Кронин М.Т., Астуриол Д., Чериани Л., Экснер Т.Э. и др. (февраль 2022 г.). «На пути к структуре qAOP для прогнозной токсикологии – связь данных с решениями» . Вычислительная токсикология . 21 : 100195. doi : 10.1016/j.comtox.2021.100195 . ПМЦ 8850654 . ПМИД 35211660 .
^ Уиллетт С., Каверли Рэй Дж., Гояк К.О., Минсаваж Дж., Уэстморленд С., Андерсен М. и др. (2014). «Накопление общего опыта для продвижения практического применения токсикологии на основе путей: механизм действия токсичности для печени» . Альтекс . 31 (4): 500–519. дои : 10.14573/altex.1401281 . ПМЦ 4779550 . ПМИД 24535319 .
^ Продвижение путей неблагоприятного исхода (AOP) для комплексных токсикологических и нормативных приложений . Мастерская. Сомма Ломбардо, Италия. Март 2014 г. Архивировано из оригинала 19 ноября 2014 г. Проверено 16 сентября 2014 г.
^ «АОП 101: Как и почему разрабатывать и использовать» . Проверено 17 сентября 2014 г.
^ «Пути неблагоприятных исходов: от исследований к регулированию» . НТП . Проверено 16 сентября 2014 г.

Внешние ссылки

[1] Национальный исследовательский совет; Отдел исследований Земли и жизни; Совет по экологическим исследованиям и токсикологии; Институт исследований лабораторных животных; Комитет по тестированию и оценке токсичности агентов окружающей среды (2007 г.). Тестирование на токсичность в 21 веке: видение и стратегия . Вашингтон: Национальная академическая пресса. ISBN 978-0-309-15173-3 .

[Ankley_2010-2] Jump up to: ^а ^б ^с Анкли Г.Т., Беннетт Р.С., Эриксон Р.Дж., Хофф Дж.Д., Хорнунг М.В., Джонсон Р.Д. и др. (март 2010 г.). «Пути неблагоприятных исходов: концептуальная основа для поддержки экотоксикологических исследований и оценки рисков» . Экологическая токсикология и химия . 29 (3): 730–741. дои : 10.1002/etc.34 . ПМИД 20821501 . S2CID 26011816 .

[Adverse_Outcome_Pathways,_Molecular_Screening_and_Toxicogenomics-3] Jump up to: ^а ^б «Пути неблагоприятного исхода, молекулярный скрининг и токсикогеномика» . ОЭСР.

[4] Крамер В.Дж., Эттерсон М.А., Хекер М., Мерфи К.А., Роэсияди Дж., Спейд DJ и др. (январь 2011 г.). «Пути неблагоприятных последствий и оценка экологического риска: переход к последствиям на уровне населения» . Экологическая токсикология и химия . 30 (1): 64–76. дои : 10.1002/etc.375 . ПМИД 20963853 . S2CID 40565681 .

[5] Шульц Т.В. (2010). «Глава 14: Пути неблагоприятного исхода: способ связать химическую структуру с токсикологическими опасностями in vivo». В Кронин М., Мэдден Дж. (ред.). Принципы и приложения кремниевой токсикологии . Проблемы токсикологии. Кембридж: Королевское химическое общество. стр. 346–371. дои : 10.1039/9781849732093-00346 . ISBN 978-1-84973-209-3 . Архивировано из оригинала 29 ноября 2014 г. Проверено 16 сентября 2014 г.

[Ducker_and_Falkenberg_2020-6] Jump up to: ^а ^б Дакер Дж., Фалькенберг ЖЖ (2020). «Как тихоокеанская устрица реагирует на закисление океана: разработка и применение метода неблагоприятных последствий, основанного на метаанализе» . Границы морской науки . 7 : 597441. doi : 10.3389/fmars.2020.597441 .

[7] «Развитие АОП» (PDF) . oecd.org . ОЭСР.

[AOP-KB-8] «База знаний о путях неблагоприятного исхода (AOP-KB)» .

[9] Спину Н., Бал-Прайс А., Кронин М.Т., Енох С.Дж., Мэдден Дж.К., Worth AP (октябрь 2019 г.). «Разработка и анализ сети путей неблагоприятного исхода нейротоксичности человека» . Архив токсикологии . 93 (10): 2759–2772. дои : 10.1007/s00204-019-02551-1 . ПМИД 31444508 . S2CID 201283568 .

[10] Пайни А., Кампия I, Кронин М.Т., Астуриол Д., Чериани Л., Экснер Т.Э. и др. (февраль 2022 г.). «На пути к структуре qAOP для прогнозной токсикологии – связь данных с решениями» . Вычислительная токсикология . 21 : 100195. doi : 10.1016/j.comtox.2021.100195 . ПМЦ 8850654 . ПМИД 35211660 .

[11] Уиллетт С., Каверли Рэй Дж., Гояк К.О., Минсаваж Дж., Уэстморленд С., Андерсен М. и др. (2014). «Накопление общего опыта для продвижения практического применения токсикологии на основе путей: механизм действия токсичности для печени» . Альтекс . 31 (4): 500–519. дои : 10.14573/altex.1401281 . ПМЦ 4779550 . ПМИД 24535319 .

[Advancing_Adverse_Outcome_Pathways_(AOP)_for_Integrated_Toxicology_and_Regulatory_Applications-12] Продвижение путей неблагоприятного исхода (AOP) для комплексных токсикологических и нормативных приложений . Мастерская. Сомма Ломбардо, Италия. Март 2014 г. Архивировано из оригинала 19 ноября 2014 г. Проверено 16 сентября 2014 г.

[AOP-prague-13] «АОП 101: Как и почему разрабатывать и использовать» . Проверено 17 сентября 2014 г.

[Adverse_Outcome_Pathways:_From_Research_to_Regulation-14] «Пути неблагоприятных исходов: от исследований к регулированию» . НТП . Проверено 16 сентября 2014 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]