Кейт Р. Розенблум

Кейт Р. Розенблум является членом Консорциума Энциклопедии элементов ДНК (ENCODE). Она является менеджером технических проектов и разработчиком программного обеспечения в Центре биомолекулярной науки и инженерии школы Джека Баскина Инженерной Калифорнийского университета в Санта-Крус (UCSC), США. Она была членом научно-консультативного совета проекта протеома человека. ^{[ 1 ]} и внес вклад в интеграцию и визуализацию данных в рамках консорциума GTEx , международного проекта, целью которого является понять, как генетические вариации формируют различия между тканями человека. ^{[ 2 ]}

Пилотный этап ENCODE , включающий разработку веб-браузера для отображения экспериментальных результатов, связанных с участками последовательности генома человека, был предпринят в UCSC. ^{[ 3 ]} Команда университета поддерживает и развивает браузер генома UCSC, чтобы предоставить общественности доступ к данным генома все большего числа животных, в основном позвоночных. Также могут быть включены данные, предоставленные пользователем. Это позволяет проводить сравнения и некоторую интерпретацию данных. Браузер был впервые выпущен в 2001 году, и каждый январь публикуется ежегодное обновление. ^{[ 4 ]}

Розенблум является автором или соавтором более 35 публикаций, в том числе:

Хайро Наварро Гонсалес, Энн С. Цвейг, Мэттью Л. Спейр, Дэниел Шмелтер, Кейт Р. Розенблум, Брайан Дж. Рэйни, Коннер С. Пауэлл, Луис Р. Нассар, Нэйтан Д. Молдинг, Кристофер М. Ли, Брайан Т Ли, Энджи С. Хинрикс, Аластер С. Файф , Джейсон Д. Фернандес, Марк Дикханс, Хирам Клоусон, Джонатан Каспер, Анна Бенет-Пажес, Галт П. Барбер, Дэвид Хаусслер, Роберт М. Кун, Максимилиан Хойсслер, В. Джеймс Кент (2021) База данных браузера генома UCSC: обновление 2021 года Исследования нуклеиновых кислот 49 Выпуск D1, страницы D1046–D1057
Консорциум GTEx (2020 г.) Атлас Консорциума GTEx по генетическим регуляторным эффектам в тканях человека. Наука 369 1318-1330
Кейт Р. Розенблум, Крикет А. Слоан, Венкат С. Маллади, Тимоти Р. Дрезер, Катрина Лернед, Ванесса М. Киркап, Мэтью К. Вонг, Морган Мэддрен, Жуйхуа Фанг, Стивен Г. Хейтнер, Брайан Т. Ли, Галт П. Барбер, Рэйчел А. Харт, Марк Диканс, Джеффри С. Лонг, Стивен П. Уайлдер, Энн С. Цвейг, Донна Карольчик, Роберт М. Кун, Дэвид Хаусслер, В. Джеймс Кент (2012) КОДИРОВАНИЕ данных в браузере генома UCSC: обновление 5-го года. Исследования нуклеиновых кислот 41 D56–D63

Ссылки

^ «Проект Человеческого Протеома – Управление» . Протеомная организация человека . Проверено 25 мая 2021 г.
^ Аге, Франсуа; Ардли, Кристин Г.; Лаппалайнен, Туули; Консорциум GTEx (2020). «Атлас генетических регуляторных эффектов консорциума GTEx в тканях человека» . Наука . 369 : 1318–1330. дои : 10.1126/science.aaz1776 . ПМЦ 7737656 .
^ Томас, диджей; Розенблум, КР; Клоусон, Х; и 14 других (2007). «Проект ENCODE в Калифорнийском университете в Санта-Крус» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (Проблема с базой данных): D663–7. дои : 10.1093/nar/gkl1017 . ПМЦ 1781110 . PMID 17166863 . Проверено 22 февраля 2015 г. {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )
^ Карольчик Донна, Донна; и 24 других (2014 г.). «База данных браузера генома UCSC: обновление 2014 г.» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Д1): Д764–Д770. дои : 10.1093/нар/gkt1168 . ПМК 1347506 . ПМИД 16381938 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

Эта статья биологе незавершена . о Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[HPP-1] «Проект Человеческого Протеома – Управление» . Протеомная организация человека . Проверено 25 мая 2021 г.

[Aguet_etal2020-2] Аге, Франсуа; Ардли, Кристин Г.; Лаппалайнен, Туули; Консорциум GTEx (2020). «Атлас генетических регуляторных эффектов консорциума GTEx в тканях человека» . Наука . 369 : 1318–1330. дои : 10.1126/science.aaz1776 . ПМЦ 7737656 .

[ENCODE_UCSC_pilot-3] Томас, диджей; Розенблум, КР; Клоусон, Х; и 14 других (2007). «Проект ENCODE в Калифорнийском университете в Санта-Крус» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (Проблема с базой данных): D663–7. дои : 10.1093/nar/gkl1017 . ПМЦ 1781110 . PMID 17166863 . Проверено 22 февраля 2015 г. {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[NAR2014update-4] Карольчик Донна, Донна; и 24 других (2014 г.). «База данных браузера генома UCSC: обновление 2014 г.» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Д1): Д764–Д770. дои : 10.1093/нар/gkt1168 . ПМК 1347506 . ПМИД 16381938 . {{cite journal}}: CS1 maint: числовые имена: список авторов ( ссылка )

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]