эксперимент HNC
HNCA — это трехмерный эксперимент с тройным резонансом ЯМР- , обычно используемый в области ЯМР белков . Название происходит от пути переноса намагниченности в эксперименте: намагниченность амидного протона аминокислотного остатка передается амидному азоту, а затем альфа-углеродам как исходного остатка, так и предыдущего остатка в аминокислотной последовательности белка. Напротив, дополнительный HNCOCA эксперимент передает намагниченность только альфа-углероду предыдущего остатка [1] . Эксперимент HNCA используется, часто в тандеме с HNCOCA, для сопоставления сигналов резонанса альфа-углерода с определенными остатками в белке. Для этого эксперимента требуется очищенный образец белка, приготовленный с помощью 13 С и 15 N Мечение изотопом в концентрации более 0,1 мМ обычно применяется только к рекомбинантным белкам .
Спектр, полученный в этом эксперименте, имеет три измерения: ось протона, 15 Ось N и 13 Ось С. Для остатка i пики появятся при {H N (i), N(i), C альфа (i)} и {H N (i), N(i), C альфа (i-1)}, а для дополнительные экспериментальные пики HNCOCA появляются только при {H N (i), N (i), C альфа (i-1)}. Вместе эти два эксперимента выявляют химический сдвиг альфа-углерода для каждого аминокислотного остатка в белке и предоставляют информацию, связывающую соседние остатки в последовательности белка.
Ссылки
[ редактировать ]Цитаты
[ редактировать ]- ^ Бакс А., Икура М. (май 1991 г.). «Эффективный метод 3D-ЯМР для корреляции резонансов протона и амида основной цепи 15N с альфа-углеродом предыдущего остатка в однородной форме. 15 Н/ 13 Белки, обогащенные C». J. Biomol. NMR . 1 (1): 99–104. doi : 10.1007/BF01874573 . PMID 1668719 .
Общие ссылки
[ редактировать ]ЯМР-спектроскопия белков: принципы и практика (1995) Джон Кавана, Уэйн Дж. Фэйрбразер, Артур Г. Палмер III, Николас Дж. Скелтон, Academic Press
 | Эта биофизике статья по незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта белках статья о незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |