Альфаторкевирус

Альфаторкевирус
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Семья:	Анелловирусиды
Род:	Альфаторкевирус

Alphatorquevirus — род вирусов Anelloviridae семейства II , относящихся к группе по Балтиморской классификации . Он включает в себя многочисленные виды вируса, который ранее был известен как TTV (вирус, передающийся при переливании крови), вирус Torque Teno, SENV (старший вирус), SANBAN и другие. ^[1] Род включает 26 видов.

Таксономия

Род включает следующие виды: ^[2]

История

TTV впервые был описан у японского пациента в 1997 году ученым-исследователем Т. Нисидзавой. ^[3] Вирус примерно чрезвычайно распространен даже у здоровых людей — в некоторых странах его распространенность достигает 100%, а у 10% доноров крови в Великобритании и США — он не вызывает симптомов гепатита , его часто обнаруживают у пациентов с заболеваниями печени. . Хотя сам по себе ^[4] Считается, что по большей части инфекция TTV протекает бессимптомно .

Первоначально обнаруженный у японских пациентов с гепатитом неизвестной этиологии, ТТВ был обнаружен в различных популяциях без доказанной патологии, включая доноров крови. Этот новый вирус был первоначально обнаружен в 1997 году с помощью анализа репрезентативных различий (RDA) в плазме японского пациента (начальные буквы ТТ) с посттрансфузионным гепатитом . Последовательность (N22) длиной 500 нуклеотидов (нт) была впервые охарактеризована и в дальнейшем расширена примерно до 3700 нт (клон ТА278). ^[5] В то время анализ последовательности показал, что TTV относится к семейству Parvoviridae . В конце 1998 г. два независимых исследования продемонстрировали наличие дополнительной GC-богатой области размером около 120 нт, что привело к открытию кольцевой природы генома TTV (~3800 нт). Это открытие установило связь TTV с семейством Circoviridae . ^[6]

Этимология

Первоначально вирус был назван TTV в честь пациента с инициалами ТТ. Позднее было принято название вируса Torque (ожерелье) тено (от латинского tenuis — «тонкий»), поскольку оно сохранило первоначальную аббревиатуру. ^[7]

Вирусное распространение

Большое количество эпидемиологических исследований позволило четко указать на глобальное распространение вируса ( Африка , Северная и Южная Америка , Азия , Европа , Океания ) среди сельского и городского населения. Несмотря на то, что связь ТТВ-инфекции с данной патологией не доказана, была выдвинута гипотеза о связи вирусной нагрузки с иммунным статусом хозяина. Более того, хотя первоначально предполагалось, что передача инфекции происходит только при переливании крови, ^[8] Глобальное распространение вируса в популяциях и его обнаружение в различных биологических образцах (плазма, слюна, фекалии и т. д.) предполагают комбинированные способы диффузии, в частности распространение капельками слюны. ^[9] Также предполагалась передача половым путем. ^[10]

Родственные вирусы были обнаружены у шимпанзе, человекообразных обезьян, африканских обезьян, тупайй, кур, свиней, коров, овец и собак. ^[11]

Сообщалось о вертикальной передаче инфекции у свиней. ^[12]^[13]

Геном

TTV Геном представляет собой кольцевой одноцепочечный участок ДНК с отрицательным смыслом длиной примерно 3,8 т.п.н.; это вирус без оболочки с диаметром вириона около 40 нм. Несмотря на некоторое сходство с членами группы Circoviridae , ему не хватает гомологии последовательности ни с одним из известных вирусов. Он отнесен к семейству Anelloviridae .

Его геном содержит 2 большие открытые рамки считывания , кодирующие 770 и 202 аминокислоты , а также несколько более мелких ORF. Геномная область -154/-76 содержит критический промотор.

Изоляты были разделены на пять основных клад, пронумерованных от 1 до 5. Геногруппа 3 TTV также включает 8 штаммов вируса, известных как от SENV-A до H.

Клинический

В настоящее время не считается, что эти вирусы вызывают заболевания у людей. Заражение этими вирусами имеет тенденцию приводить к пожизненной виремии, и их возможная связь с заболеванием еще изучается. Более высокие, чем обычно, вирусные нагрузки были связаны с тяжелыми идиопатическими воспалительными миопатиями, раком и волчанкой.

Исследование фекалий 135 бразильцев с гастроэнтеритом выявило наличие вируса у 121 (91%). ^[14] Наличие нескольких генотипов было обычным явлением.

Сообщалось о присутствии этого вируса при остром повреждении легких и обострениях идиопатического фиброза легких. ^[15]

Сообщалось о повышении вирусной нагрузки в случаях врожденного дефицита маннозосвязывающего лектина. ^[16]

Сообщалось о возможном случае апластической анемии на фоне гепатита. ^[17]

Сообщалось об одном случае посттрансплантационного гепатита. ^[18]

Была предложена связь с раком головы/шеи. ^[19]

Было показано, что вирусная нагрузка TTV увеличивается у пациентов с иммуносупрессией. Повышенные уровни TTV наблюдались, например, при сепсисе . ^[20]

Поскольку TTV распространен повсеместно, а репликация вируса коррелирует с иммунным статусом, TTV изучается как многообещающий маркер для оценки глобальной функциональной иммунной компетентности у реципиентов трансплантатов. ^[21]

Репликация

О репликации TTV известно немного, однако, согласно исследованиям цирковирусов на животных, необходима двухцепочечная структура репликации. В некоторых исследованиях описано присутствие двухцепочечной ДНК TTV в различных тканях и органах, что позволяет предположить активную репликацию в этих локализациях. ^[22] Эти данные также сводят к минимуму гипотетическое влияние TTV на заболевания печени. в настоящее время нет Других данных по TLMV (TTV-подобному мини-вирусу – штамму, поражающему человека) .

Ссылки

^ Бьяджини П. (2009). «Классификация TTV и родственных вирусов (анелловирусов)». ТТ-вирусы . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Том. 331. С. 21–33. дои : 10.1007/978-3-540-70972-5_2 . ISBN 978-3-540-70971-8 . ПМИД 19230555 .
^ «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 23 мая 2021 г.
^ Нисидзава, Т; Окамото, Х; Кониси, К; Ёсидзава, Х; Миякава, Ю; Маюми, М. (8 декабря 1997 г.). «Новый ДНК-вирус (TTV), связанный с повышенным уровнем трансаминаз при посттрансфузионном гепатите неизвестной этиологии». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 241 (1): 92–7. дои : 10.1006/bbrc.1997.7765 . ПМИД 9405239 .
^ Бьяджини, П.: «Цирковирусы человека», страницы 95-101. Ветеринарная микробиология, 2004.
^ Нисидзава, Т.; Окамото, Х.; Кониси, К.; Ёсидзава, Х.; Миякава, Ю.; Маюми, М. (1997). «Новый ДНК-вирус (TTV), связанный с повышенным уровнем трансаминаз при посттрансфузионном гепатите неизвестной этиологии». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 241 (1): 92–97. дои : 10.1006/bbrc.1997.7765 . ПМИД 9405239 .
^ Мията, Х.; Цунода, Х.; Кази, А.; Ямада, А.; Хан, Массачусетс; Юнг, Би Джей; Мураками Дж.; Камахора, Т.; Шираки, К.; Хино, С. (1999). «Идентификация новой 113-нуклеотидной области, богатой GC, для завершения кольцевого одноцепочечного генома ДНК вируса ТТ, первого цирковируса человека» . Дж. Вирол . 73 (5): 3582–3586. doi : 10.1128/JVI.73.5.3582-3586.1999 . ПМЦ 104131 . ПМИД 10196248 .
^ «Сайт ААББ» (PDF) . Проверено 25 декабря 2017 г.
^ Бьяджини, П.; Галлиан, П.; Канталюб, JF; Де Микко, П.; де Ламбаллери, X. (1998). «Наличие вируса ТТ у французских доноров крови и потребителей наркотиков, вводимых внутривенно». Дж. Гепатол . 29 (4): 684–685. дои : 10.1016/s0168-8278(98)80167-0 . ПМИД 9824281 .
^ Галлиан, П.; Бьяджини, П.; Чжун, С.; Луисси, М.; Йео, В.; Канталюб, JF; Аттуи, Х.; де Микко, П.; Джонсон, ПиДжей; де Ламбаллери, X. (2000). «Вирус ТТ: исследование молекулярной эпидемиологии и передачи генотипов 1, 2 и 3». Дж. Клин. Вирол . 17 (1): 43–49. дои : 10.1016/s1386-6532(00)00066-4 . ПМИД 10814938 .
^ Чжэн, МЮ; Лин, Ю; Ли, диджей; Руан, HB; Чен, Ю; Ву, ТТ (2010). «Коинфекция TTV и ВПЧ в мазках шейки матки пациентов с поражениями шейки матки в прибрежной зоне провинции Чжэцзян». Чжунхуа Ши Янь Хэ Линь Чуан Бин ду Сюэ За Чжи . 24 (2): 110–112. ПМИД 21110428 .
^ Хино, С; Мията, Х (2007). «Вирус Torque Teno (TTV): текущий статус». Преподобный Мед Вирол . 17 (1): 45–57. дои : 10.1002/rmv.524 . PMID 17146841 . S2CID 25965110 .
^ Мартинес-Гино, л; Кекарайнен, Т; Сегалес, Дж (2009). «Доказательства вертикальной передачи вируса Torque teno (TTV) у свиней». Териогенология . 71 (9): 1390–1395. doi : 10.1016/j.theriogenology.2009.01.010 . ПМИД 19249089 .
^ Поццуто, Т; Мюллер, Б; Михан, Б; Ринглер, СС; Макинтош, Калифорния; Эллис, Дж.А.; Манкерц, А; Краковка, С (2009). « Внутриутробная передача теновирусов торка свиней». Ветеринарный микробиол . 137 (3–4): 375–379. дои : 10.1016/j.vetmic.2009.02.001 . ПМИД 19282113 .
^ Пиньо-Насименто, Калифорния; Лейте, JP; Ниль, К; Диниз-Мендес, Л (2011). «Вирус Torque Teno в образцах фекалий пациентов с гастроэнтеритом: распространенность, распределение геногрупп и вирусная нагрузка». Джей Мед Вирол . 83 (6): 1107–11. дои : 10.1002/jmv.22024 . ПМИД 21503927 . S2CID 2296541 .
^ Wootton SC, Kim DS, Kondoh Y, Chen E, Lee JS, Song JW, Huh JW, Taniguchi H, Chiu C, Boushey H, Lancaster LH, Wolters PJ, Derisi J, Ganem D, Collard HR (2011) Вирусная инфекция при обострении идиопатического легочного фиброза. Am J Respir Crit Care Med.
^ Магги Ф., Пиффери М., Микелуччи А., Альбани М., Сбранти С., Ланини Л., Сими П., Маккиа П., Пистелло М., Бендинелли М. (2011)Размер нагрузки виремии вируса Torque тено у пациентов с выбранными врожденными дефектами врожденного иммунитета. Клин Вакцина Иммунол. 18(4):692–694.
^ Ишимура М., Ога С., Итияма М., Кусухара К., Такада Х., Хара Т., Такахаши М., Окамото Х. (2010)Апластическая анемия, связанная с гепатитом, во время первичной инфекции генотипа 1a Torque Teno Virus.Eur J Педиатр. Июль 2010 г.; 169 (7): 899–902.
^ Пьяджио Ф, Доди Ф, Боттино Г, Андорно Е, Джентиле Р, Феррари С, Барабино Г , Джанноне А, Иммордино Г, Миджино М, Магони Росси А, Моралья Е, Гаслоли Г, Джелли М, Ферранте Р, Морелли Н, Казачча М., Валенте У. (2009)Вирус Torque Teno — причина вирусного заболевания печени после трансплантации печени: отчет о случае. Трансплантационный процесс 41(4):1378–1379.
^ Хеттманн, А; Демчак, А; Бах, А; Декси, Г; Денкс, А; Палинко, Д; Рово, Л; Надь, К; Минаровиц, Дж; Такач, М (2016). «Обнаружение и филогенетический анализ вируса Torque Teno в образцах слюны и биопсии опухолей пациентов с карциномой головы и шеи» . Интервирусология . 59 (2): 123–129. дои : 10.1159/000452974 . ПМИД 27924796 .
^ Уолтон, Эндрю Х.; Мюнцер, Джаред Т.; Раше, Дэвид; Бумер, Джонатан С.; Сато, Брайан; Браунштейн, Бернард Х.; Пашо, Александр; Брукс, Терренс Л.; Дейч, Елена; Шеннон, Уильям Д.; Грин, Джонатан М.; Сторч, Грегори А.; Хочкисс, Ричард С. (11 июня 2014 г.). «Реактивация множественных вирусов у пациентов с сепсисом» . ПЛОС ОДИН . 9 (6): e98819. Бибкод : 2014PLoSO...998819W . дои : 10.1371/journal.pone.0098819 . ПМК 4053360 . ПМИД 24919177 .
^ Якш, Питер; Кунди, Майкл; Гёрцер, Ирен; Муракози, Габриэлла; Ламберс, Кристофер; Бенаццо, Альберто; Хетценекер, Конрад; Клепетко, Вальтер; Пуххаммер-Штокль, Элизабет (5 ноября 2018 г.). «Вирус Torque Teno как новый биомаркер, нацеленный на эффективность иммуносупрессии после трансплантации легких» . Журнал инфекционных болезней . 218 (12): 1922–1928. дои : 10.1093/infdis/jiy452 . ПМИД 30053048 .
^ Окамото, Х.; Нисидзава, Т.; Такахаши, М.; Асабе, С.; Цуда, Ф.; Ёсикава, А. (2001a). «Гетерогенное распределение tt-вируса разных генотипов во многих тканях инфицированных людей» . Вирусология . 288 (2): 358–368. дои : 10.1006/виро.2001.1097 . ПМИД 11601907 .

Внешние ссылки

Таксономия вирусов ICTV, 2009 г. [1]
Таксономия UniProt [2]
Анелловирус Национальной медицинской библиотеки США в медицинских предметных рубриках (MeSH)
ICTVdb
ViralZone : Альфаторкевирус

[pmid19230555-1] Бьяджини П. (2009). «Классификация TTV и родственных вирусов (анелловирусов)». ТТ-вирусы . Актуальные темы микробиологии и иммунологии. Том. 331. С. 21–33. дои : 10.1007/978-3-540-70972-5_2 . ISBN 978-3-540-70971-8 . ПМИД 19230555 .

[2] «Таксономия вирусов: выпуск 2020 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2021 года . Проверено 23 мая 2021 г.

[Nishizawa1997-3] Нисидзава, Т; Окамото, Х; Кониси, К; Ёсидзава, Х; Миякава, Ю; Маюми, М. (8 декабря 1997 г.). «Новый ДНК-вирус (TTV), связанный с повышенным уровнем трансаминаз при посттрансфузионном гепатите неизвестной этиологии». Связь с биохимическими и биофизическими исследованиями . 241 (1): 92–7. дои : 10.1006/bbrc.1997.7765 . ПМИД 9405239 .

[4] Бьяджини, П.: «Цирковирусы человека», страницы 95-101. Ветеринарная микробиология, 2004.

[5] Нисидзава, Т.; Окамото, Х.; Кониси, К.; Ёсидзава, Х.; Миякава, Ю.; Маюми, М. (1997). «Новый ДНК-вирус (TTV), связанный с повышенным уровнем трансаминаз при посттрансфузионном гепатите неизвестной этиологии». Биохим. Биофиз. Рез. Коммун . 241 (1): 92–97. дои : 10.1006/bbrc.1997.7765 . ПМИД 9405239 .

[6] Мията, Х.; Цунода, Х.; Кази, А.; Ямада, А.; Хан, Массачусетс; Юнг, Би Джей; Мураками Дж.; Камахора, Т.; Шираки, К.; Хино, С. (1999). «Идентификация новой 113-нуклеотидной области, богатой GC, для завершения кольцевого одноцепочечного генома ДНК вируса ТТ, первого цирковируса человека» . Дж. Вирол . 73 (5): 3582–3586. doi : 10.1128/JVI.73.5.3582-3586.1999 . ПМЦ 104131 . ПМИД 10196248 .

[7] «Сайт ААББ» (PDF) . Проверено 25 декабря 2017 г.

[8] Бьяджини, П.; Галлиан, П.; Канталюб, JF; Де Микко, П.; де Ламбаллери, X. (1998). «Наличие вируса ТТ у французских доноров крови и потребителей наркотиков, вводимых внутривенно». Дж. Гепатол . 29 (4): 684–685. дои : 10.1016/s0168-8278(98)80167-0 . ПМИД 9824281 .

[9] Галлиан, П.; Бьяджини, П.; Чжун, С.; Луисси, М.; Йео, В.; Канталюб, JF; Аттуи, Х.; де Микко, П.; Джонсон, ПиДжей; де Ламбаллери, X. (2000). «Вирус ТТ: исследование молекулярной эпидемиологии и передачи генотипов 1, 2 и 3». Дж. Клин. Вирол . 17 (1): 43–49. дои : 10.1016/s1386-6532(00)00066-4 . ПМИД 10814938 .

[Zheng2010-10] Чжэн, МЮ; Лин, Ю; Ли, диджей; Руан, HB; Чен, Ю; Ву, ТТ (2010). «Коинфекция TTV и ВПЧ в мазках шейки матки пациентов с поражениями шейки матки в прибрежной зоне провинции Чжэцзян». Чжунхуа Ши Янь Хэ Линь Чуан Бин ду Сюэ За Чжи . 24 (2): 110–112. ПМИД 21110428 .

[Hino2007-11] Хино, С; Мията, Х (2007). «Вирус Torque Teno (TTV): текущий статус». Преподобный Мед Вирол . 17 (1): 45–57. дои : 10.1002/rmv.524 . PMID 17146841 . S2CID 25965110 .

[Martínez-Guinó2009-12] Мартинес-Гино, л; Кекарайнен, Т; Сегалес, Дж (2009). «Доказательства вертикальной передачи вируса Torque teno (TTV) у свиней». Териогенология . 71 (9): 1390–1395. doi : 10.1016/j.theriogenology.2009.01.010 . ПМИД 19249089 .

[Pozzuto2009-13] Поццуто, Т; Мюллер, Б; Михан, Б; Ринглер, СС; Макинтош, Калифорния; Эллис, Дж.А.; Манкерц, А; Краковка, С (2009). « Внутриутробная передача теновирусов торка свиней». Ветеринарный микробиол . 137 (3–4): 375–379. дои : 10.1016/j.vetmic.2009.02.001 . ПМИД 19282113 .

[Pinho-Nascimento2011-14] Пиньо-Насименто, Калифорния; Лейте, JP; Ниль, К; Диниз-Мендес, Л (2011). «Вирус Torque Teno в образцах фекалий пациентов с гастроэнтеритом: распространенность, распределение геногрупп и вирусная нагрузка». Джей Мед Вирол . 83 (6): 1107–11. дои : 10.1002/jmv.22024 . ПМИД 21503927 . S2CID 2296541 .

[Wootton2011-15] Wootton SC, Kim DS, Kondoh Y, Chen E, Lee JS, Song JW, Huh JW, Taniguchi H, Chiu C, Boushey H, Lancaster LH, Wolters PJ, Derisi J, Ganem D, Collard HR (2011) Вирусная инфекция при обострении идиопатического легочного фиброза. Am J Respir Crit Care Med.

[16] Магги Ф., Пиффери М., Микелуччи А., Альбани М., Сбранти С., Ланини Л., Сими П., Маккиа П., Пистелло М., Бендинелли М. (2011)Размер нагрузки виремии вируса Torque тено у пациентов с выбранными врожденными дефектами врожденного иммунитета. Клин Вакцина Иммунол. 18(4):692–694.

[Ishimura2010-17] Ишимура М., Ога С., Итияма М., Кусухара К., Такада Х., Хара Т., Такахаши М., Окамото Х. (2010)Апластическая анемия, связанная с гепатитом, во время первичной инфекции генотипа 1a Torque Teno Virus.Eur J Педиатр. Июль 2010 г.; 169 (7): 899–902.

[18] Пьяджио Ф, Доди Ф, Боттино Г, Андорно Е, Джентиле Р, Феррари С, Барабино Г , Джанноне А, Иммордино Г, Миджино М, Магони Росси А, Моралья Е, Гаслоли Г, Джелли М, Ферранте Р, Морелли Н, Казачча М., Валенте У. (2009)Вирус Torque Teno — причина вирусного заболевания печени после трансплантации печени: отчет о случае. Трансплантационный процесс 41(4):1378–1379.

[Hettmann2016-19] Хеттманн, А; Демчак, А; Бах, А; Декси, Г; Денкс, А; Палинко, Д; Рово, Л; Надь, К; Минаровиц, Дж; Такач, М (2016). «Обнаружение и филогенетический анализ вируса Torque Teno в образцах слюны и биопсии опухолей пациентов с карциномой головы и шеи» . Интервирусология . 59 (2): 123–129. дои : 10.1159/000452974 . ПМИД 27924796 .

[20] Уолтон, Эндрю Х.; Мюнцер, Джаред Т.; Раше, Дэвид; Бумер, Джонатан С.; Сато, Брайан; Браунштейн, Бернард Х.; Пашо, Александр; Брукс, Терренс Л.; Дейч, Елена; Шеннон, Уильям Д.; Грин, Джонатан М.; Сторч, Грегори А.; Хочкисс, Ричард С. (11 июня 2014 г.). «Реактивация множественных вирусов у пациентов с сепсисом» . ПЛОС ОДИН . 9 (6): e98819. Бибкод : 2014PLoSO...998819W . дои : 10.1371/journal.pone.0098819 . ПМК 4053360 . ПМИД 24919177 .

[21] Якш, Питер; Кунди, Майкл; Гёрцер, Ирен; Муракози, Габриэлла; Ламберс, Кристофер; Бенаццо, Альберто; Хетценекер, Конрад; Клепетко, Вальтер; Пуххаммер-Штокль, Элизабет (5 ноября 2018 г.). «Вирус Torque Teno как новый биомаркер, нацеленный на эффективность иммуносупрессии после трансплантации легких» . Журнал инфекционных болезней . 218 (12): 1922–1928. дои : 10.1093/infdis/jiy452 . ПМИД 30053048 .

[22] Окамото, Х.; Нисидзава, Т.; Такахаши, М.; Асабе, С.; Цуда, Ф.; Ёсикава, А. (2001a). «Гетерогенное распределение tt-вируса разных генотипов во многих тканях инфицированных людей» . Вирусология . 288 (2): 358–368. дои : 10.1006/виро.2001.1097 . ПМИД 11601907 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]