Holin Superbamily III

Holin Superbamily III является суперсемейством интегральных мембранных транспортных белков . Это один из семи различных суперсемей Holin в общей сложности. В целом, считается, что эти белки играют роль в регулируемой гибели клеток, хотя функциональность варьируется между семействами и отдельными членами.

Члены суперсемейства Holin III получены из Pseudomonadota , Synergistota , Actinomycetota , Deinococcota и Archaea . Это суперсемейство включает в себя семь семей ТС:

Члены всех семей (за исключением семейства HOL-X; TC# 1.E.34 ), по-видимому, имеют три трансмембранных сегмента (TMS). Члены семьи Hol-X, похоже, имеют два предполагаемых TMS. Отсутствующие TMS в белках Family 34-это N-концевые TMS, что выявлено с помощью множественных выравниваний. ^{[ 1 ]} Эти семь семей имеют средние размеры 110, 96, 105, 112, 143, 159 и 108 амино -ацильных остатков (AAS) соответственно. Обратите внимание, что единственная семья с членами, которые, по прогнозам, имели только два TMS, - это то, что содержит самые большие гомологи; Это связано с гидрофильными расширениями. Средний размер белков во всей суперсемействе составляет 114 AA со стандартным отклонением O 23 AAS. ^{[ 1 ]}