РНКIII

RNAIII представляет собой стабильную регуляторную РНК длиной 514 нт, транскрибируемую P3 промотором Staphylococcus aureus, воспринимающей кворум. agr- системы ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}). Это основной эффектор регулона , agr который контролирует экспрессию многих генов S. aureus, кодирующих экзопротеины и белки, связанные с клеточной стенкой, а также других генов, кодирующих регуляторные белки. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} ) из 26 аминокислот S taphylococcus aureus Транскрипт RNAIII также кодирует пептид δ-гемолизина ( дельта-токсин (Hld). ^{[ 5 ]} РНКIII содержит множество стволовых петель, большинство из которых соответствуют последовательности Шайна-Дальгарно, участвующей в инициации трансляции регулируемых генов. ^{[ 5 ]} Некоторые из этих взаимодействий являются тормозящими, другие стимулирующими; к числу первых относится регуляторный белок Rot. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]} In vitro РНКIII экспрессируется постэкспоненциально, ингибируя трансляцию поверхностных белков, особенно белка А, одновременно стимулируя трансляцию экзопротеинов, многие из которых представляют собой ферменты, разрушающие ткани, или цитолизины . ^{[ 8 ]} Среди последних - важный фактор вирулентности, α-гемолизин (или альфа-токсин ) (Hla), чья трансляционная РНКIII активируется путем предотвращения образования ингибирующей обратной петли в hla лидере мРНК . ^{[ 9 ]}

Ссылки

^ Новик Р.П., Росс Х.Ф., Проян С.Дж., Корнблюм Дж., Крайсвирт Б., Могазе С. (октябрь 1993 г.). «Синтез факторов вирулентности стафилококка контролируется регуляторной молекулой РНК» . Журнал ЭМБО . 12 (10): 3967–75. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb06074.x . ПМК 413679 . ПМИД 7691599 .
^ Уотерс Л.С., Шторц Г. (февраль 2009 г.). «Регуляторные РНК бактерий» . Клетка . 136 (4): 615–28. дои : 10.1016/j.cell.2009.01.043 . ПМК 3132550 . ПМИД 19239884 .
^ Янзон Л., Арвидсон С. (май 1990 г.). «Роль гена дельта-лизина (hld) в регуляции генов вирулентности с помощью регулятора вспомогательного гена (agr) у Staphylococcus aureus» . Журнал ЭМБО . 9 (5): 1391–9. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb08254.x . ПМК 551825 . ПМИД 2328718 .
^ Новик Р.П. (июнь 2003 г.). «Аутоиндукция и сигнальная трансдукция в регуляции вирулентности стафилококка» . Молекулярная микробиология . 48 (6): 1429–49. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03526.x . ПМИД 12791129 . S2CID 6847208 .
^ Jump up to: ^а ^б Бенито Ю., Колб Ф.А., Ромби П., Лина Дж., Этьен Дж., Ванденеш Ф. (май 2000 г.). «Изучение структуры РНКIII, регуляторной РНК Staphylococcus aureus agr, и идентификация домена РНК, участвующего в репрессии экспрессии белка А» . РНК . 6 (5): 668–79. дои : 10.1017/S1355838200992550 . ПМЦ 1369947 . ПМИД 10836788 .
^ Гейзингер Э., Адхикари Р.П., Джин Р., Росс Х.Ф., Новик Р.П. (август 2006 г.). «Ингибирование трансляции гнили с помощью RNAIII, ключевая особенность функции agr» . Молекулярная микробиология . 61 (4): 1038–48. дои : 10.1111/j.1365-2958.2006.05292.x . ПМИД 16879652 . S2CID 229424 .
^ Буассе С., Гейссманн Т., Ханцингер Е., Фехтер П., Бендриди Н., Посседко М. и др. (июнь 2007 г.). «Staphylococcus aureus RNAIII координально подавляет синтез факторов вирулентности и регулятора транскрипции Rot по антисмысловому механизму» . Гены и развитие . 21 (11): 1353–66. дои : 10.1101/gad.423507 . ПМЦ 1877748 . ПМИД 17545468 .
^ Данман П.М., Мерфи Э., Хейни С., Паласиос Д., Такер-Келлог Г., Ву С. и др. (декабрь 2001 г.). «Идентификация генов Staphylococcus aureus, регулируемых локусами agr и/или sarA, на основе профилирования транскрипции» . Журнал бактериологии . 183 (24): 7341–53. дои : 10.1128/JB.183.24.7341-7353.2001 . ПМК 95583 . ПМИД 11717293 .
^ Морфельдт Э., Тейлор Д., фон Габейн А., Арвидсон С. (сентябрь 1995 г.). «Активация трансляции альфа-токсина в Staphylococcus aureus транс-кодируемой антисмысловой РНК, RNAIII» . Журнал ЭМБО . 14 (18): 4569–77. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00136.x . ПМЦ 394549 . ПМИД 7556100 .

Дальнейшее чтение

Шевалье С., Буассе С., Ромилли С., Маскида Б., Фехтер П., Гейссманн Т., Ванденеш Ф., Ромби П. (март 2010 г.). «РНК III Staphylococcus aureus связывается с двумя удаленными участками мРНК коа, останавливая трансляцию и способствуя деградации мРНК» . ПЛОС Патогены . 6 (3): e1000809. дои : 10.1371/journal.ppat.1000809 . ПМЦ 2837412 . ПМИД 20300607 .
Коэльо ЛР, Соуза РР, Феррейра Ф.А., Гимарайнш М.А., Феррейра-Карвалью Б.Т., Фигейреду А.М. (ноябрь 2008 г.). «Agr RNAIII по-разному регулирует индуцированное глюкозой образование биопленок в клинических изолятах Staphylococcus aureus» . Микробиология . 154 (Пт 11). Ридинг, Англия: 3480–3490. дои : 10.1099/mic.0.2007/016014-0 . ПМИД 18957601 .
Квик С.Ю., Джеймсон-Ли М., Вилларуз А.Е., Бах Т.Х., Хан Б.А., Стердевант Д.Е., Риклефс С.М., Ли М., Отто М. (октябрь 2008 г.). «Независимый от RNAIII контроль гена-мишени с помощью системы восприятия кворума agr: понимание эволюции регуляции вирулентности у Staphylococcus aureus» . Молекулярная клетка . 32 (1): 150–8. doi : 10.1016/j.molcel.2008.08.005 . ПМК 2575650 . ПМИД 18851841 .
Хантцингер Э., Буассе С., Савану С., Бенито Й., Гейссманн Т., Намане А., Лина Г., Этьен Дж., Эресманн Б., Эресманн С., Жакье А., Ванденеш Ф., Ромби П. (февраль 2005 г.). «РНК III стафилококка и эндорибонуклеаза III координально регулируют экспрессию генов спа» . Журнал ЭМБО . 24 (4): 824–35. дои : 10.1038/sj.emboj.7600572 . ПМК 549626 . ПМИД 15678100 .
Чабельская С., Бордо В., Фельден Б. (апрель 2014 г.). «Двойной РНК-регуляторный контроль фактора вирулентности золотистого стафилококка» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (8): 4847–58. дои : 10.1093/нар/gku119 . ПМК 4005698 . ПМИД 24510101 .

Внешние ссылки

Страница RNAIII на Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid7691599-1] Новик Р.П., Росс Х.Ф., Проян С.Дж., Корнблюм Дж., Крайсвирт Б., Могазе С. (октябрь 1993 г.). «Синтез факторов вирулентности стафилококка контролируется регуляторной молекулой РНК» . Журнал ЭМБО . 12 (10): 3967–75. дои : 10.1002/j.1460-2075.1993.tb06074.x . ПМК 413679 . ПМИД 7691599 .

[pmid19239884-2] Уотерс Л.С., Шторц Г. (февраль 2009 г.). «Регуляторные РНК бактерий» . Клетка . 136 (4): 615–28. дои : 10.1016/j.cell.2009.01.043 . ПМК 3132550 . ПМИД 19239884 .

[pmid2328718-3] Янзон Л., Арвидсон С. (май 1990 г.). «Роль гена дельта-лизина (hld) в регуляции генов вирулентности с помощью регулятора вспомогательного гена (agr) у Staphylococcus aureus» . Журнал ЭМБО . 9 (5): 1391–9. дои : 10.1002/j.1460-2075.1990.tb08254.x . ПМК 551825 . ПМИД 2328718 .

[4] Новик Р.П. (июнь 2003 г.). «Аутоиндукция и сигнальная трансдукция в регуляции вирулентности стафилококка» . Молекулярная микробиология . 48 (6): 1429–49. дои : 10.1046/j.1365-2958.2003.03526.x . ПМИД 12791129 . S2CID 6847208 .

[:0-5] Jump up to: ^а ^б Бенито Ю., Колб Ф.А., Ромби П., Лина Дж., Этьен Дж., Ванденеш Ф. (май 2000 г.). «Изучение структуры РНКIII, регуляторной РНК Staphylococcus aureus agr, и идентификация домена РНК, участвующего в репрессии экспрессии белка А» . РНК . 6 (5): 668–79. дои : 10.1017/S1355838200992550 . ПМЦ 1369947 . ПМИД 10836788 .

[6] Гейзингер Э., Адхикари Р.П., Джин Р., Росс Х.Ф., Новик Р.П. (август 2006 г.). «Ингибирование трансляции гнили с помощью RNAIII, ключевая особенность функции agr» . Молекулярная микробиология . 61 (4): 1038–48. дои : 10.1111/j.1365-2958.2006.05292.x . ПМИД 16879652 . S2CID 229424 .

[7] Буассе С., Гейссманн Т., Ханцингер Е., Фехтер П., Бендриди Н., Посседко М. и др. (июнь 2007 г.). «Staphylococcus aureus RNAIII координально подавляет синтез факторов вирулентности и регулятора транскрипции Rot по антисмысловому механизму» . Гены и развитие . 21 (11): 1353–66. дои : 10.1101/gad.423507 . ПМЦ 1877748 . ПМИД 17545468 .

[8] Данман П.М., Мерфи Э., Хейни С., Паласиос Д., Такер-Келлог Г., Ву С. и др. (декабрь 2001 г.). «Идентификация генов Staphylococcus aureus, регулируемых локусами agr и/или sarA, на основе профилирования транскрипции» . Журнал бактериологии . 183 (24): 7341–53. дои : 10.1128/JB.183.24.7341-7353.2001 . ПМК 95583 . ПМИД 11717293 .

[9] Морфельдт Э., Тейлор Д., фон Габейн А., Арвидсон С. (сентябрь 1995 г.). «Активация трансляции альфа-токсина в Staphylococcus aureus транс-кодируемой антисмысловой РНК, RNAIII» . Журнал ЭМБО . 14 (18): 4569–77. дои : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00136.x . ПМЦ 394549 . ПМИД 7556100 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]