Карты мозга

Карты мозга
Содержание
Описание	Интерактивный цифровой атлас мозга высокого разрешения с возможностью масштабирования
Типы данных ; захвачен	Нейроанатомия , Гистология
Организмы	Включает в себя: человека, обезьяну, кошку, мышь, опоссума, золотую рыбку, утконоса, собаку, сову, курицу, крысу и многое другое.
Доступ
Веб-сайт	http://brainmaps.org/
Разнообразный
Лицензия	Авторские права на все наборы изображений принадлежат их владельцам, если они не указаны, кампусу Калифорнийского университета в Риджентс в Дэвисе .

BrainMaps — это финансируемый Национальным институтом здравоохранения интерактивный масштабируемый цифровой атлас мозга с высоким разрешением и виртуальный микроскоп как приматов, так и неприматов , который основан на более чем 140 миллионах мегапикселей (140 терабайт) отсканированных изображений последовательных срезов мозга и интегрирован с высокоскоростная база данных для запроса и получения данных о структуре и функциях мозга через Интернет.

В настоящее время представлены полные наборы данных атласа мозга 16 видов; некоторые из них: Macaca mulatta , Chlorocebus aethiops , Felis silvestris catus , Mus musculus , Rattus norvegicus и Tyto alba .

проекта Главным исследователем был из Калифорнийского университета в Дэвисе нейробиолог Тед Джонс с 2005 по 2011 год, после чего эту роль взял на себя У. Мартин Усри.

Описание

BrainMaps использует форматы изображений с различным разрешением для представления больших изображений мозга, а также внешний пользовательский интерфейс dHTML/Javascript для навигации по изображениям, оба похожи на то, как Google Maps работает с геопространственными данными.

BrainMaps — это одна из самых массивных онлайн-баз данных и хранилищ изображений в области нейробиологии, которая включает в себя атлас всего мозга с самым высоким разрешением, когда-либо созданный. ^[2]^[3]

Расширения интерактивной трехмерной визуализации были разработаны с помощью OpenGL . настольных приложений на основе ^[4] Бесплатно доступные инструменты анализа изображений позволяют конечным пользователям собирать данные онлайн-изображений на субнейронном уровне. BrainMaps использовалась в обоих исследованиях. ^[5]^[6] и дидактические установки.

Дополнительные изображения

Массивные изображения мозга форматируются как пирамиды изображений с различным разрешением, что обеспечивает быструю навигацию за счет загрузки небольших фрагментов изображения вместо всего изображения.
Наборы данных в зависимости от видов в BrainMaps.

См. также

Ссылки

^ Условия использования , BrainMaps.org Дата доступа: 11 февраля 2014 г.
^ Микула, С; Тротц I; Стоун Дж.М.; Джонс Э.Г. (2007). «Картирование мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия через Интернет» . НейроИмидж . 35 (1): 9–15. doi : 10.1016/j.neuroimage.2006.11.053 . ПМК 1890021 . ПМИД 17229579 .
^ Микула, С; Стоун Дж.М.; Джонс Э.Г. (2008). «BrainMaps.org — Интерактивные цифровые атласы мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия» . Мозги Разум Медиа . 3 : бмм1426. ПМК 2614326 . ПМИД 19129928 .
^ Троттс, я; Микула С; Джонс Э.Г. (2007). «Интерактивная визуализация стеков изображений с разным разрешением в 3D» . НейроИмидж . 35 (3): 1038–43. doi : 10.1016/j.neuroimage.2007.01.013 . ПМЦ 2492583 . ПМИД 17336095 .
^ Микула, С; Менеджер по связям с общественностью; Джонс Э.Г. (2007). «Таламус однопроходных: цито- и миелоархитектура и химическая нейроанатомия» . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 363 (1502): 2415–40. дои : 10.1098/rstb.2007.2133 . ПМК 2606803 . ПМИД 17553780 .
^ Микула, С; Пэрриш СК; Триммер JS; Джонс Э.Г. (2009). «Полная трехмерная визуализация стриосом приматов с помощью иммуноокрашивания KChIP1» . Джей Комп Нейрол . 514 (5): 507–17. дои : 10.1002/cne.22051 . ПМЦ 2737266 . ПМИД 19350670 .

Внешние ссылки

BrainMaps.org (официальный сайт)
BrainMaps опубликованы в журнале Science Magazine
Изображения BrainMaps представлены в статье журнала Discover Magazine «10 неразгаданных тайн мозга».
Публикации, связанные с BrainMaps (архивировано 9 мая 2012 г.)

[1] Условия использования , BrainMaps.org Дата доступа: 11 февраля 2014 г.

[2] Микула, С; Тротц I; Стоун Дж.М.; Джонс Э.Г. (2007). «Картирование мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия через Интернет» . НейроИмидж . 35 (1): 9–15. doi : 10.1016/j.neuroimage.2006.11.053 . ПМК 1890021 . ПМИД 17229579 .

[3] Микула, С; Стоун Дж.М.; Джонс Э.Г. (2008). «BrainMaps.org — Интерактивные цифровые атласы мозга высокого разрешения и виртуальная микроскопия» . Мозги Разум Медиа . 3 : бмм1426. ПМК 2614326 . ПМИД 19129928 .

[4] Троттс, я; Микула С; Джонс Э.Г. (2007). «Интерактивная визуализация стеков изображений с разным разрешением в 3D» . НейроИмидж . 35 (3): 1038–43. doi : 10.1016/j.neuroimage.2007.01.013 . ПМЦ 2492583 . ПМИД 17336095 .

[5] Микула, С; Менеджер по связям с общественностью; Джонс Э.Г. (2007). «Таламус однопроходных: цито- и миелоархитектура и химическая нейроанатомия» . Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci . 363 (1502): 2415–40. дои : 10.1098/rstb.2007.2133 . ПМК 2606803 . ПМИД 17553780 .

[6] Микула, С; Пэрриш СК; Триммер JS; Джонс Э.Г. (2009). «Полная трехмерная визуализация стриосом приматов с помощью иммуноокрашивания KChIP1» . Джей Комп Нейрол . 514 (5): 507–17. дои : 10.1002/cne.22051 . ПМЦ 2737266 . ПМИД 19350670 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]