Генетическая примесь

Генетическая примесь происходит, когда ранее изолированные популяции скрещиваются, в результате чего образуется популяция, происходящая из нескольких источников. Это может происходить между видами, например, у гибридов , или внутри видов, например, когда географически удаленные особи мигрируют в новые регионы. В результате генофонд представляет собой смесь исходных популяций. ^[1]^[2]^[3]

Примеры [ править ]

Климатические циклы способствуют генетическому смешению в холодные периоды и генетическому разнообразию в теплые периоды. ^[4] Естественные наводнения могут вызвать генетическую примесь в популяциях мигрирующих видов рыб. ^[5] Генетическая примесь может играть важную роль в успехе популяций, колонизирующих новую территорию и скрещивающихся с особями местных популяций. ^[6]

Картирование [ править ]

Картирование примесей — это метод картирования генов , который использует популяцию смешанного происхождения (смешанную популяцию) для поиска генетических локусов , которые способствуют различиям в заболеваниях или других фенотипах , обнаруженных между различными предковыми популяциями. Этот метод лучше всего применять к популяциям с недавним примесем двух популяций, которые ранее были генетически изолированы. Метод пытается сопоставить степень происхождения вблизи генетического локуса с фенотипом или интересующим заболеванием. Генетические маркеры, которые различаются по частоте между предковыми популяциями, необходимы по всему геному. ^[7]

Картирование примесей основано на предположении, что различия в частоте заболеваний или фенотипах частично обусловлены различиями в частоте генетических вариантов, вызывающих заболевания или фенотипов, между популяциями. В смешанной популяции эти причинные варианты чаще встречаются на хромосомных участках, унаследованных от той или иной предковой популяции. Первые результаты сканирования примесей были опубликованы в 2005 году, и с тех пор были картированы генетические факторы, способствующие множеству заболеваний и различиям в признаках. ^[8] К 2010 году были созданы картографические панели высокой плотности для афроамериканцев, латиноамериканцев/латиноамериканцев и уйгуров .

См. также [ править ]

Ссылки [ править ]

^ Корунес, Кэтрин Л.; Голдберг, Эми (11 марта 2021 г.). «Генетическая примесь человека» . ПЛОС Генетика . 17 (3). Публичная научная библиотека (PLoS): e1009374. дои : 10.1371/journal.pgen.1009374 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 7951803 .
^ Риус, М.; Дарлинг, Дж. А. (2014). «Насколько важна внутривидовая генетическая примесь для успеха колонизации популяций?». Тенденции в экологии и эволюции . 29 (4): 233–242. дои : 10.1016/j.tree.2014.02.003 . ПМИД 24636862 .
^ Ян, Мелинда А.; Фу, Цяомэй (март 2018 г.). «Взгляд на предысторию современного человека с использованием древних геномов». Тенденции в генетике . 34 (3): 184–196 6г. дои : 10.1016/j.tig.2017.11.008 . ПМИД 29395378 .
^ Lv X, Ченг J, Мэн Y, Чанг Y, Ся L, Вэнь Z, Ge D, Лю С, Ян Q (2018). «Разрозненное распространение и отчетливая внутривидовая диверсификация Eothenomys melanogaster в Южном Китае» . Эволюционная биология BMC . 18 (1): 50. дои : 10.1186/s12862-018-1168-3 . ПМЦ 5894153 . ПМИД 29636000 .
^ Джайсук, К.; Сенанан, В. (2018). «Влияние особенностей ландшафта на генетическую изменчивость популяции тропической речной рыбы, каменного гольяна, Garra cambodgiensis , в верхнем водосборном бассейне реки Нан, северный Таиланд» . ПерДж . 6 : е4487. дои : 10.7717/peerj.4487 . ПМЦ 5845392 . ПМИД 29568710 .
^ Кольбе Дж. Дж., Ларсон А., Лосос Дж. Б., де Кейруш К. (2008). «Примесь определяет генетическое разнообразие и дифференциацию популяций при биологической инвазии вида ящерицы» . Письма по биологии . 4 (4): 434–437. дои : 10.1098/rsbl.2008.0205 . ПМК 2610154 . ПМИД 18492644 .
^ Шрайвер, доктор медицины; и другие. (апрель 2003 г.). «Пигментация кожи, биогеографическое происхождение и картирование примесей». Генетика человека . 112 (4): 387–99. дои : 10.1007/s00439-002-0896-y . ПМИД 12579416 . S2CID 7877572 .
^ Винклер, Калифорния; Нельсон, ГВ; Смит, Миссури (2010). «Картирование примесей достигает совершеннолетия» . Анну Рев Геном Хум Генет . 11 : 65–89. doi : 10.1146/annurev-genom-082509-141523 . ПМЦ 7454031 . ПМИД 20594047 .

Дальнейшее чтение [ править ]

Болдинг (2007). «Словарь генетических терминов» . Справочник по статистической генетике, Том 1 . Джон Уайли и сыновья. ISBN 978-0-470-05830-5 .
Фоулкс (28 апреля 2009 г.). "Словарь терминов" . Прикладная статистическая генетика с R: для популяционных ассоциативных исследований . Спрингер. п. 250. ИСБН 978-0-387-89553-6 .
Камень; и другие. (2007). "Словарь терминов" . Гены, культура и эволюция человека: синтез . Уайли. ISBN 978-1-4051-5089-7 .
Кольбе Дж.Дж., Глор Р.Э., Скеттино Л.Р., Лара А.К., Лосос А.Л., Лосос Дж.Б. (2004) Увеличение генетической изменчивости во время биологического вторжения кубинской ящерицы . Природа 431: 171-181
Ленорман Т (2002). Поток генов и пределы естественного отбора . Тенденции экологии и эволюции. 17:183-189
Шрайнер 2013, «Обзор картирования примесей»

[Korunes_Goldberg_2021_p._e1009374-1] Корунес, Кэтрин Л.; Голдберг, Эми (11 марта 2021 г.). «Генетическая примесь человека» . ПЛОС Генетика . 17 (3). Публичная научная библиотека (PLoS): e1009374. дои : 10.1371/journal.pgen.1009374 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 7951803 .

[2] Риус, М.; Дарлинг, Дж. А. (2014). «Насколько важна внутривидовая генетическая примесь для успеха колонизации популяций?». Тенденции в экологии и эволюции . 29 (4): 233–242. дои : 10.1016/j.tree.2014.02.003 . ПМИД 24636862 .

[yan-fu-3] Ян, Мелинда А.; Фу, Цяомэй (март 2018 г.). «Взгляд на предысторию современного человека с использованием древних геномов». Тенденции в генетике . 34 (3): 184–196 6г. дои : 10.1016/j.tig.2017.11.008 . ПМИД 29395378 .

[4] Lv X, Ченг J, Мэн Y, Чанг Y, Ся L, Вэнь Z, Ge D, Лю С, Ян Q (2018). «Разрозненное распространение и отчетливая внутривидовая диверсификация Eothenomys melanogaster в Южном Китае» . Эволюционная биология BMC . 18 (1): 50. дои : 10.1186/s12862-018-1168-3 . ПМЦ 5894153 . ПМИД 29636000 .

[5] Джайсук, К.; Сенанан, В. (2018). «Влияние особенностей ландшафта на генетическую изменчивость популяции тропической речной рыбы, каменного гольяна, Garra cambodgiensis , в верхнем водосборном бассейне реки Нан, северный Таиланд» . ПерДж . 6 : е4487. дои : 10.7717/peerj.4487 . ПМЦ 5845392 . ПМИД 29568710 .

[6] Кольбе Дж. Дж., Ларсон А., Лосос Дж. Б., де Кейруш К. (2008). «Примесь определяет генетическое разнообразие и дифференциацию популяций при биологической инвазии вида ящерицы» . Письма по биологии . 4 (4): 434–437. дои : 10.1098/rsbl.2008.0205 . ПМК 2610154 . ПМИД 18492644 .

[Shriver-7] Шрайвер, доктор медицины; и другие. (апрель 2003 г.). «Пигментация кожи, биогеографическое происхождение и картирование примесей». Генетика человека . 112 (4): 387–99. дои : 10.1007/s00439-002-0896-y . ПМИД 12579416 . S2CID 7877572 .

[8] Винклер, Калифорния; Нельсон, ГВ; Смит, Миссури (2010). «Картирование примесей достигает совершеннолетия» . Анну Рев Геном Хум Генет . 11 : 65–89. doi : 10.1146/annurev-genom-082509-141523 . ПМЦ 7454031 . ПМИД 20594047 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]