Клык циркирус
| Клык циркирус | |
|---|---|
Классификация вирусов 
| |
| (не вмешательство): | Вирус |
| Область : | Моноднавирия |
| Королевство: | Shotokuvirae |
| Филум: | Cressdnaviricota |
| Сорт: | Arfiviricetes |
| Заказ: | Cirlivirals |
| Семья: | Circoviridae |
| Род: | Циркирус |
| Разновидность: | Клык циркирус
|
Canine Circovirus (CACV или DOGCV), сначала изолированный в 2012 году, представляет собой небольшой неразвитый, икосаэдрический, одноцепочечный ДНК-вирус, который заражает исключительно диких собак и диких Canids. Это член семейства Circoviridae и род Circovirus . В настоящее время существует 11 видов известных циркирусов, которые были идентифицированы, которые влияют на широкий спектр птиц и млекопитающих. Как видно из всех тщательно изученных цировирусов, диаметр колеблется между приблизительно 15 и 25 нанометрами. [ 1 ] Количество икосаэдрической триангуляции составляет 1, может быть наименьший размер вирусного капсида, в котором существует в общей сложности 60 белковых субъединиц, которые составляют капсид. CACV не следует путать с собачьим коронавирусом , еще одним агентом, вызывающим диарею в семействе Coronaviridae , или циркурусами свиней , которые являются членами того же рода, что и CACV, но только у свиней. CACV (геном 1) был первым циркувирусом , который был идентифицирован, который заражает виды млекопитающих, кроме свиней.
Геном
[ редактировать ]Геном CACV состоит из одной круглой цепи ДНК длиной 2 063 нуклеотидов. ДНК в целом состоит из четырех азотистых оснований: аденин (а), тимин (Т), цитозин (С) и гуанин (г), в которых пара с парами t и g с C через комплементарные нити в двойной стойкой ДНК и Иногда в одноцепочечной ДНК с специфической последовательности, которая способствует спариванию оснований одинаковой цепи. CACV демонстрирует это поведение в форме структур Stemloop. Паразы основания нуклеотидного нуклеотида гуанинового цитозина составляет чуть более половины общих пар, которые присутствуют в CACV, и наиболее распространенные динуклеотиды (когда соседние нуклеотиды на одной и той же цепи связываются ковалентно друг с другом), наблюдаются TG и GG. [ 2 ] Геном состоит из двух кодирования и двух некодирующих разделов. Есть только две рамки с открытым считыванием (ORF), которые кодируют конкретные вирусные репликазы и капсидные белки. Белки вирусной репликазы состоят из 303 аминокислот, а вирусный капсид построен из 270 аминокислот. Ген, кодирующий капсид, содержит последовательность для 30 аминокислот аргинина, происходящих из амино -концеза. Этот необычный растяжение предполагается, что важно для связывания ДНК. Две межгенные некодирующие части генома состоят из 135 и 203 нуклеотидов. Эти области содержат отличительные последовательности для структур STEMLOOP, в которых однопользовая ДНК сочетается, и в конце образуется кольцо, а также сегменты палиндромов. Существует одна некодирующая область между двумя ORF, которая содержит структуру Stemloop, и последовательность Tagtattac, используемая для инициации репликации генома. Происхождение сайта репликации (ORI) расположено в межгенной области между двумя областями кодирования на 5 -дюймовом конце. Палиндромические последовательности являются важной особенностью. Интересно примечание о геноме CACV заключается в том, что одна из межгенных некодирующих областей разделяет 91% нуклеотидную идентичность с вирусом Тено -крутящего момента сосновой мартен от семейства Anelloviridae, что свидетельствует о возможной эволюционной взаимосвязи между двумя вирусами.
Репликация генома
[ редактировать ]
Репликация круга [ 3 ] является методом реплицирования геномов, который чаще всего наблюдается в круглых плазмидах и геномах бактерий и вирусов. Важным димером белка, который необходимо кодировать в ДНК, - это белок репликации, репутатор репутации расщепляет местоположение ДНК, воздействующей на свободный 3 'OH для вирусной или клеточной полимеразы, чтобы действовать. Репликация ДНК происходит в ядре клетки, в которой этот вирус достаточно мал, чтобы войти.
Симптомы
[ редактировать ]В целом известно, что циркирусы ответственны за потенциально смертельные заболевания у птиц, свиней, летучих мышей, собак, ночек и людей. В настоящее время нет литературы по потенциальной вакцине против вируса для собак, но есть одна для циркируса свиньи. Симптомы CACV включают геморрагический энтит, который связан с внезапным появлением ослабленного аппетита, рвоты и кровавой диареи. Кроме того, микроскопический анализ выявил васкулит или воспаление кровеносных сосудов, а также лимффоидный некроз (неудача) у пораженных животных. Органы, которые, как было показано, присутствуют ДНК CACV, включают кишечник, селезенку, легкие, мозг, печень и лимфатические узлы.
Коинфекции также являются распространенным явлением у животных, страдающих CACV. Canine Destempter и Parvovirus (Genotype 2) были наиболее распространенными со-инфекторами в группе домашних собак и других диких Canids, изученных в 2016 году Zaccaria et al. [ 4 ] Также подозревается, что молодые люди могут быть более подверженными риску развития опасных для жизни симптомов, чем взрослые животные, но это утверждение еще не может быть сделано с научной точки зрения из-за смещения отбора проб. Лечение от CACV в настоящее время неизвестно, а лечение не является специфичным.
Тематические исследования
[ редактировать ]В статье, опубликованной в 2013 году Li et al. [ 5 ] Молодой (1 год) печень домашней собаки была проанализирована на наличие инфекционного агента. Первоначально собака была доставлена в Калифорнийский университет, ветеринарную медицинскую больницу Дэвиса из -за увеличения распространенности рвоты, диареи и крови в стуле (гематохезия). Собака в конечном итоге была усыновлена, и владелец согласился с проведением посмертных тестов. Обычные тесты для более распространенных инфекционных агентов, таких как парвовирус, коронавирус и специфические типы бактерий, были отрицательными. Кровоизлияние по всем желудочно -кишечным тракту и почках было показано вместе с другими гистологическими нарушениями. Были взяты образцы ткани печени, и были секвенированы вирусные нуклеиновые кислоты, которые содержали специфические паттерны, характерные для циркувируса, что дает доказательства того, что CACV является единственной причиной смерти.
В той же статье было проанализировано фекальное вещество когортного образца собак с диареей и без них, используя методы ПЦР в реальном времени для определения процентной распространенности цирровируса. Не было никакой существенной разницы между идентификацией ДНК CACV у собак с диареей по сравнению с тем, без тех, кто без, однако, были обнаружены дополнительные данные. В рамках группы собак, которые дали положительный результат на CACV, 68% из них имели другие коинфекции различных заболеваний.
Были другие статьи в журнале, в которых рассматривались кажущаяся связь между CACV и другими агентами коинфекции. Thaiwong et al. [ 6 ] В 2016 году представил публикацию в отношении инцидента с двойной инфекцией CACV и собак -парвовируса в размножающейся колонии собак. Две вспышки болезней произошли в Мичигане в 2013 и 2014 годах, когда группа связанных с ними папильонских собак заболела, а некоторые умерли в ближайшее время (в течение 1 недели) после того, как начали проявляться симптомы. Тела умерших собак были приняты для некроскопии. Кишечная, селезенка и лимфатические узлы были наиболее поражены деформациями, такими как сегментальный коллапс слизистой оболочки, укорочение виллинга, лимфоидный некроз, лимфоцитолиз, мультифокальное гранулематозное воспаление и гистиоцитоз. Эти события привели к общей недостаточке органов и производству необычных выделений слизи. Анализ ПЦР и секвенирование обработанных тканей органов выявили большое количество ДНК CACV и ДНК и антигенов собаки.
Другие исследования упомянули о наличии CACV в других странах, кроме Соединенных Штатов. Дополнительная статья Decaro et al. [ 7 ] Подчеркивает прорыв заболевания энтита в мусоре щенков в южной Италии. Две собаки погибли в течение недели после инфекции, в то время как остальные были больны, но могли выздороветь. Одно из тел прошло лабораторный анализ и некроскопию для определения инфекционного агента (ов). Используя методы ОТ-ПЦР и секвенирование, образцы печени и кишечника были положительными на наличие гена репликазы CACV. Все остальные патогенные микроорганизмы, которые были проверены на отрицание. Распространенность CACV на Тайване [ 8 ] Также был изучен, в которых собаки с диареей были примерно в три раза чаще инфицированы CACV, чем здоровые собаки. Это контрастировало с исследованием, проводимым Li et al. [ 9 ] В США, в которых собаки с диареей не с большей вероятностью были CACV -позитивными.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Розарий, друг; Брейтарт, мой ; Харрач, Балазс; Галджин, Хоаким; Dulwt, Эрик; Опять Филипп; Varsani, Arvind (2017-05–01). Создание семьи . Архив вирусологии 162 : 1447–1463. doi : /s00705-017-017-3 10.1007 ISSN 0304-8 PMID 28155197 .
- ^ Капур, Амит; Дюбови, Эдвард Дж.; Энрикез-Ривера, Хосе Ангел; Липкин, В. Ян (2012-06-15). «Полная последовательность генома первого собачьего цирковируса» . Журнал вирусологии . 86 (12): 7018. DOI : 10.1128/JVI.00791-12 . ISSN 0022-538X . PMC 3393582 . PMID 22628401 .
- ^ Руис-Масон, JA; Machón, C.; Торни, м.; Солнечная, Г. из; Bordeaux-Ruiseco, L.; Coll, M. (2015-02-20). "Репликация плазмиды катящегося круга " Микробиологический спектр 3 (1): PLAS - 0035–2014. два 10.1128/microbiolspec.plas-0035-2014: HDL 10261/111631: ISSN 2165-0 26104557PMID
- ^ Заккария, Гендалина; Малатеста, Даниэла; Scipioni, Габриэлла; Феличе, Элизабетта Ди; Камполо, Марко; Casaccia, Клаудия; Савини, Джованни; Сабатино, Дарья Ди; Лоруссо, Алессио (2016). "Цирковирус в домашних и диких плотоядных животных: важный оппортунистический агент?" Полем Вирусология . 490 : 69–74. Doi : 10.1016/j.virol.2016.01.007 . PMID 26848830 .
- ^ Ли, Линлин; МакГроу, Сабрина; Чжу, Кевин; Leutenegger, Christian M.; Marks, Stanley L.; Кубиски, Стивен; Гаффни, Патриция; JR, Florante N. Dela Cruz; Ван, Чунлин (2013). «Циквирус в тканях собак с васкулитом и кровоизлиянием» . Возникающие инфекционные заболевания . 19 (4): 534–541. doi : 10.3201/eid1904.121390 . PMC 3647419 . PMID 23628223 .
- ^ Thaiwong, T.; Wise, A. G.; Maes, R. K.; Mullaney, T.; Kiupel, M. (2016-05-06). "Canine Circovirus 1 (CaCV-1) and Canine Parvovirus 2 (CPV-2)". Veterinary Pathology. 53 (6): 1204–1209. doi:10.1177/0300985816646430. PMID 27154544.
- ^ Decaro, Nicola; Martella, Vito; Desario, Costantina; Lanave, Gianvito; Circella, Elena; Cavalli, Alessandra; Elia, Gabriella; Camero, Michele; Buonavoglia, Canio (2014-08-22). "Genomic Characterization of a Circovirus Associated with Fatal Hemorrhagic Enteritis in Dog, Italy". PLOS ONE. 9 (8): e105909. Bibcode:2014PLoSO...9j5909D. doi:10.1371/journal.pone.0105909. ISSN 1932-6203. PMC 4141843. PMID 25147946.
- ^ Hsu, Han-Siang; Lin, Ting-Han; Wu, Hung-Yi; Lin, Lee-Shuan; Chung, Cheng-Shu; Chiou, Ming-Tang; Lin, Chao-Nan (2016-06-17). "High detection rate of dog circovirus in diarrheal dogs". BMC Veterinary Research. 12 (1): 116. doi:10.1186/s12917-016-0722-8. ISSN 1746-6148. PMC 4912760. PMID 27315792.
- ^ Li, Linlin; McGraw, Sabrina; Zhu, Kevin; Leutenegger, Christian M.; Marks, Stanley L.; Kubiski, Steven; Gaffney, Patricia; Jr, Florante N. Dela Cruz; Wang, Chunlin (2013). "Circovirus in Tissues of Dogs with Vasculitis and Hemorrhage". Emerging Infectious Diseases. 19 (4): 534–541. doi:10.3201/eid1904.121390. PMC 3647419. PMID 23628223.