Центр биоинформатики UCPH

Центр биоинформатики — это междисциплинарное исследование в области биоинформатики при Копенгагенском университете (UCPH). Центр расположен в секции вычислительной биологии и РНК-биологии кафедры биологии факультета естественных наук .

Программы

Центр биоинформатики отвечает за магистерскую программу по биоинформатике.

Организация

В центре есть четыре разных подгруппы, каждая из которых посвящена разным темам:

• Группа микро-РНК: микро-РНК представляют собой небольшие молекулы РНК, играющие важную роль в регуляции экспрессии генов . Группа анализирует биологию микроРНК, используя вычислительные методы, и разрабатывает инструменты, полезные для биологов-экспериментаторов.
• Группа некодирующих РНК. Многие молекулы РНК играют в клетке функциональную роль, отличную от классической роли матрицы для синтеза белка . Группа работает над предсказанием вторичной структуры и множественным выравниванием некодирующих РНК .
• группа разрабатывает статистические и биоинформатические методы для анализа регуляции транскрипции эукариотических Группа анализа промотора : генов . Это включает моделирование эпигенетики , сайтов связывания транскрипционных факторов , основных промоторов и сайтов начала транскрипции.
• Группа структур: группа разрабатывает белков и РНК методы прогнозирования трехмерной структуры на основе графических моделей и байесовских сетей , статистики направлений и методов Монте-Карло для цепей Маркова . Группа также является ведущим направлением исследований в области вероятностных методов программирования для предсказания структуры белков.

Люди

Центр возглавляет Андерс Крог стал пионером в использовании скрытых марковских моделей в биоинформатике , который вместе с Дэвидом Хаусслером . В состав центра также входят шесть постдоков и около 17 аспирантов .

Внешние ссылки

• Сайт центра биоинформатики