Международная лаборатория мозга

Международная лаборатория мозга (IBL) — это совместная исследовательская группа, целью которой является разработка первой глобальной модели принятия решений на мышах. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} На первом этапе члены IBL записывают сотни тысяч нейронов практически во всех структурах мозга мышей, выполняющих одно и то же решение. IBL был официально запущен в сентябре 2017 года. ^{[ 3 ]}^{[ 4 ]} благодаря гранту в размере 10 миллионов долларов от Фонда Саймонса и гранту в 10 миллионов фунтов стерлингов от Wellcome Trust .

Первой важной научной вехой проекта является разработка архитектуры данных с открытым исходным кодом для крупномасштабного сотрудничества в области нейробиологии. ^{[ 5 ]} и тиражирование поведения во всех экспериментальных лабораториях. ^{[ 6 ]} В конце 2019 года IBL опубликовала поведенческие данные, содержащие около 3 миллионов вариантов выбора мышей. ^{[ 6 ]} Следующий этап включает в себя составление карты активности всего мозга. Эту карту активности получают с помощью зондов Neuropixels , которые позволяют регистрировать до 300-1000 нейронов одновременно. ^{[ 7 ]} другие технологии записи, такие как визуализация кальция На втором этапе будут использоваться . Эти данные затем будут проанализированы и интегрированы для создания общемозговой модели принятия решений.

Источник

IBL была основана в 2016 году Закари Майненом (Центр неизведанного Шампалимо), Михаэлем Хауссером ( Университетский колледж Лондона ) и Александром Пуже ( Женевский университет ). Эти ученые утверждали в статье, опубликованной в том же году. ^{[ 8 ]} что, учитывая сложность вопросов нейробиологии и масштаб технических задач, маловероятно, что исследований, проводимых отдельными лабораториями, будет достаточно, чтобы понять, как работает мозг. Вдохновленные замечательным успехом крупномасштабного сотрудничества в области физики, такого как ЦЕРН или LIGO , они предложили создать аналогичное целенаправленное сотрудничество в области нейробиологии, основанное на нескольких основных принципах:

Общая амбициозная, но реалистичная цель (например, модель принятия решений на уровне всего мозга у одного вида),
Тесная координация между теоретиками и экспериментаторами.
Стандартизация поведенческих задач, аппаратного обеспечения и анализа данных для обеспечения воспроизводимости и возможности объединения данных.
Открытый доступ к данным и ресурсам внутри и за пределами сотрудничества, а также
Относительно плоская иерархия и совместный процесс принятия решений.

Эти принципы лежат в основе сотрудничества IBL. ^{[ 1 ]}

Членство

В 2016 году к Майнену, Хауссеру и Пуже присоединились

Ларри Эбботт (Колумбийский университет)
Дора Ангелаки (Нью-Йоркский университет)
Маттео Карандини ( Университетский колледж Лондона )
Энн Черчленд (Калифорнийский университет в Лос-Анджелесе)
Ян Дань (Калифорнийский университет в Беркли)
Питер Даян ( Институт Макса Планка, Тюбинген )
Софи Денев ( Высшая нормальная школа )
Ила Фите (Массачусетский технологический институт)
Сурья Гангули (Стэнфордский университет)
Кеннет Харрис ( Университетский колледж Лондона )
Питер Лэтэм ( Университетский колледж Лондона )
Соня Хофер ( Университетский колледж Лондона )
Том Мрсик-Флогель ( Университетский колледж Лондона )
Лиам Панински (Колумбийский университет)
Джонатан Пиллоу (Принстонский университет)
Илана Виттен (Принстонский университет)
Tony Zador ( Cold Spring Harbor Laboratory )

Дэвид Танк и Карлос Броуди (оба из Принстонского университета) присоединились к нему в 2016 году, но вышли из него в 2017 году из-за конфликта интересов. Ник Стейнмец ( Вашингтонский университет ) присоединился к нам в 2019 году, а Татьяна Энгель ( Лаборатория Колд-Спринг-Харбор ) — в 2020 году.

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Эбботт, Ларри Ф.; Ангелаки, Дора Э.; Карандини, Маттео; Черчленд, Энн К.; Дэн, Ян; Даян, Питер; Денев, Софи; Фите, Ила; Гангули, Сурья; Харрис, Кеннет Д.; Хойссер, Михаэль (2017). «Международная лаборатория систем и вычислительной нейронауки» . Нейрон . 96 (6): 1213–1218. дои : 10.1016/j.neuron.2017.12.013 . ПМК 5752703 . ПМИД 29268092 .
^ Фогт, Нина (06 января 2020 г.). «Коллаборативная нейробиология» . Природные методы . 17 (1): 22. дои : 10.1038/s41592-019-0706-2 . ISSN 1548-7105 . ПМИД 31907482 .
^ Образец, Ян (19 сентября 2017 г.). «Амбициозный нейробиологический проект по исследованию того, как мозг принимает решения» . Хранитель . ISSN 0261-3077 . Проверено 31 января 2020 г.
^ Эбботт, Элисон (21 сентября 2017 г.). «Исследователи объединяются в поисках «стандартной модели» мозга» . Новости природы . 549 (7672): 319–320. Бибкод : 2017Natur.549..319A . дои : 10.1038/549319а . ПМИД 28933448 .
^ Бонакки, Никколо; Шапюи, Гаэль; Черчленд, Энн; Харрис, Кеннет Д.; Хантер, Макс; Россант, Сирил; Сасаки, Махо; Шен, Шан; Штейнмец, Николас А.; Уокер, Эдгар Ю.; Зима, Оливье; Уэллс, Майлз (2020). «Архитектура данных и визуализация для крупномасштабного сотрудничества в области нейробиологии» . bioRxiv : 827873. doi : 10.1101/827873 .
^ Перейти обратно: ^а ^б Международная лаборатория мозга (2020). «Стандартизированный и воспроизводимый метод измерения принятия решений у мышей» . биоRxiv . дои : 10.1101/2020.01.17.909838 .
^ "Дом" . Нейропиксели . Проверено 26 апреля 2020 г.
^ Майнен, Закари Ф.; Хойссер, Михаэль; Пуже, Александр (2016). «Лучший способ взломать мозг» . Природа . 539 (7628): 159–161. Бибкод : 2016Natur.539..159M . дои : 10.1038/539159а . ISSN 0028-0836 . ПМИД 27830818 .

Внешние ссылки

Официальный сайт

[:1-1] Перейти обратно: ^а ^б Эбботт, Ларри Ф.; Ангелаки, Дора Э.; Карандини, Маттео; Черчленд, Энн К.; Дэн, Ян; Даян, Питер; Денев, Софи; Фите, Ила; Гангули, Сурья; Харрис, Кеннет Д.; Хойссер, Михаэль (2017). «Международная лаборатория систем и вычислительной нейронауки» . Нейрон . 96 (6): 1213–1218. дои : 10.1016/j.neuron.2017.12.013 . ПМК 5752703 . ПМИД 29268092 .

[2] Фогт, Нина (06 января 2020 г.). «Коллаборативная нейробиология» . Природные методы . 17 (1): 22. дои : 10.1038/s41592-019-0706-2 . ISSN 1548-7105 . ПМИД 31907482 .

[3] Образец, Ян (19 сентября 2017 г.). «Амбициозный нейробиологический проект по исследованию того, как мозг принимает решения» . Хранитель . ISSN 0261-3077 . Проверено 31 января 2020 г.

[4] Эбботт, Элисон (21 сентября 2017 г.). «Исследователи объединяются в поисках «стандартной модели» мозга» . Новости природы . 549 (7672): 319–320. Бибкод : 2017Natur.549..319A . дои : 10.1038/549319а . ПМИД 28933448 .

[5] Бонакки, Никколо; Шапюи, Гаэль; Черчленд, Энн; Харрис, Кеннет Д.; Хантер, Макс; Россант, Сирил; Сасаки, Махо; Шен, Шан; Штейнмец, Николас А.; Уокер, Эдгар Ю.; Зима, Оливье; Уэллс, Майлз (2020). «Архитектура данных и визуализация для крупномасштабного сотрудничества в области нейробиологии» . bioRxiv : 827873. doi : 10.1101/827873 .

[:0-6] Перейти обратно: ^а ^б Международная лаборатория мозга (2020). «Стандартизированный и воспроизводимый метод измерения принятия решений у мышей» . биоRxiv . дои : 10.1101/2020.01.17.909838 .

[7] "Дом" . Нейропиксели . Проверено 26 апреля 2020 г.

[8] Майнен, Закари Ф.; Хойссер, Михаэль; Пуже, Александр (2016). «Лучший способ взломать мозг» . Природа . 539 (7628): 159–161. Бибкод : 2016Natur.539..159M . дои : 10.1038/539159а . ISSN 0028-0836 . ПМИД 27830818 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]