Salibacterium
| Salibacterium | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Домен: | |
| Филум: | |
| Сорт: | |
| Заказ: | |
| Семья: | |
| Род: | Salibacterium Vishnuvardhan et al. 2015 [ 1 ]
|
| Тип видов | |
| Salibacterium Halotolerans [ 1 ] | |
| Разновидность | |
|
S. Halochares [ 1 ] | |
Salibacterium -это род грамположительных бактерий из семейства Bacillaceae . [ 1 ] [ 3 ] [ 4 ] Типовым видом является Salibacterium Halotolerans . [ 1 ]
Salibacterium anidingense и Salibacterium salarium были ранее видами, принадлежащими Bacillus , роду, который был признан обширным полифилию и был ограничен недавними филогенетическими исследованиями, включающими только виды, тесно связанные с Bacillus subtilis и Bacillus cereus . [ 5 ] [ 6 ]
Название Salibacterium получено из префикса «-сали» (от латинского существительного Sal/Salis , что переводится как «соль» ) и суффикса «-бактерий» (от латинской бактерии существительной , ссылается на стержень). [ 6 ] Вместе Salibacterium переводится на стержень из соли.
Биохимические характеристики и молекулярные подписи [ 6 ]
[ редактировать ]Члены этого рода являются аэробными или факультативно анаэробными . Большинство членов не мотильны, за исключением S. anidingense , который демонстрирует подвижность посредством перитрихозной жгутики. Некоторые члены образуют эндоспоры. Все члены требуют соли для роста с оптимальным ростом, происходящим в присутствии 10–12% (мас./Об.) NaCl. Диапазон температуры для роста составляет 15–45 ° C, с оптимальной температурой роста в диапазоне 30-37 ° C.
Девять консервативных сигнатурных инделей (CSIS) были идентифицированы для этого рода в следующих белках: GTP-связывающий белок , CoA-связывающий белок, нуклеозид-трихосфатаза YTKD, протеазовый модулятор HFLC, дигидролипоилдегидрогеназа , Duf3603, семейный белок M20/M25/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40, семейство M20/M40. экзонуклеаза SBCCD субъединица D и L-арабиноза изомераза , которая в большинстве случаев разделяется исключительно всеми или большинством членов этого рода. [ 6 ] Эти CSI были идентифицированы с помощью анализа последовательностей генома от видов Salibacterium и обеспечивают надежные молекулярные средства дифференциации этого рода от других родов Bacillaceae и бактерий.
Таксономия
[ редактировать ]Salibacterium , по состоянию на май 2021 года, содержит в общей сложности 7 видов с обоснованно опубликованными названиями. [ 1 ] Эта схема ветвления также наблюдается в базе данных таксономии генома (GTDB). [ 7 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый и фон глин час Parte, ac "salibacterium" . LPSN .
- ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2018). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М (ред.). «НОМЕНКЛАТУРА Аннотация для Salibacterium lacus wang et al. 2018». Название Afforlife Abstracts . doi : 10.1601/nm.31165 (неактивный 2024-04-17).
{{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен с апреля 2024 года ( ссылка ) - ^ "Salibacterium" . www.uniprot.org .
- ^ Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М. (2015). Паркер, Чарльз Томас; Гаррити, Джордж М (ред.). «НОМЕНКЛАТУРА Аннотация для Salibacterium Reddy et al. 2015». Название Afforlife Abstracts . doi : 10.1601/nm.27815 (неактивный 2024-04-17).
{{cite journal}}: CS1 Maint: doi неактивен с апреля 2024 года ( ссылка ) - ^ Патель, Судип; Гупта, Радхей С. (2020-01-01). "Филогеномическая и сравнительная геномная структура для разрешения полифили рода Bacillus: предложение для шести новых родов видов Bacillus, Peribacillus Gen. Nov., Cytobacillus Gen. Nov., Mesobacillus Gen. Nov., Neobacillus Gen. Nov., Metabacillus. Генерал . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (1): 406–438. doi : 10.1099/ijsem.0.003775 . ISSN 1466-5026 . PMID 31617837 .
- ^ Подпрыгнуть до: а беременный в дюймовый Гупта, Радхей С.; Патель, Судип; Саини, Навнет; Чен, Шу (2020-11-01). "Надежная демаркация 17 различных видов Bacillus, предложенных как новые роды Bacillaceae, Phylogenomics и сравнительный геномный анализ: описание Robertmurraya kyonggiensis sp. Nov. И предложение для полученного рода Bacillus, ограничивающий его только членам Subtilis и Cereus clades. видов " . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 70 (11): 5753–5798. doi : 10.1099/ijsem.0.004475 . ISSN 1466-5026 . PMID 33112222 .
- ^ "Gtdb - дерево" . gtdb.ecogenomic.org . Получено 2021-05-28 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Vishnuvardhan Reddy, S; Тирумала, м; Сасикала, C; Венката Рамана, C (ноябрь 2015). «Salibacterium halotolerans Gen. Nov., Sp. Nov., Бактерия, выделенная из солевой панорамы, реклассификация Bacillus Qingdaonensis в качестве Salibacterium Qingdaonense Comb. Nov. И Bacillus Halochares в качестве гребня Salibacterium Halochares. Nov» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 65 (11): 4270–4275. doi : 10.1099/ijsem.0.000572 . PMID 26338019 .
 | Эта Bacillota статья, связанная с , является заглушкой . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |