НОНМЕМ
NONMEM — это пакет программного обеспечения для нелинейного моделирования смешанных эффектов, разработанный Стюартом Л. Билом и Льюисом Б. Шейнером в конце 1970-х годов в Калифорнийском университете в Сан-Франциско и расширенный Робертом Бауэром из Icon PLC. Его название является аббревиатурой от НЕЛИНЕЙНОГО моделирования смешанных эффектов , но оно особенно эффективно в контексте популяционной фармакокинетики , фармакометрики и моделей ФК/ФД . [1] [2] [3] [4] Модели NONMEM пишутся на NMTRAN — специальном языке спецификации моделей , который переводится на FORTRAN , компилируется «на лету» и выполняется с помощью сценария командной строки. Результаты представлены в виде текстовых выходных файлов, включая таблицы. [5] Существует множество интерфейсов, помогающих разработчикам моделей вести работу с файлами, отслеживать разработку модели, оценивать соответствие и графический вывод, например PsN и xpose. [6] и Крылья для NONMEM. [7] Текущая версия для NONMEM — 7.5.
Оценка модели
[ редактировать ]NONMEM оценивает свои модели в соответствии с принципами оценки максимального правдоподобия . Нелинейная модель смешанных эффектов обычно не имеет близких решений, поэтому применяются специальные методы оценки, такие как методы линеаризации, такие как методы линеаризации первого порядка (FO), условные первого порядка (FOCE) или лапласиана (LAPL), методы аппроксимации. такие как двухэтапная итеративная выборка (ITS), выборка по важности (IMP), оценка стохастической аппроксимации (SAEM) или прямая выборка. [8]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шейнер, Льюис Б.; Б. Розенберг; В.В. Маратэ (1977). «Оценка методов оценки популяционных фармакокинетических параметров I. Модель Михаэлиса-Ментена: рутинные клинические фармакокинетические данные». Журнал фармакокинетики и биофармацевтики . 5 (5): 445–79. дои : 10.1007/BF01061728 . ПМИД 925881 . S2CID 28622472 .
- ^ Шейнер, Льюис Б.; Стюарт Л. Бил (1980). «Оценка методов оценки популяционных фармакокинетических параметров I. Модель Михаэлиса-Ментена: рутинные клинические фармакокинетические данные». Журнал фармакокинетики и биофармацевтики . 8 (6): 553–71. дои : 10.1007/BF01060053 . ПМИД 7229908 . S2CID 31174590 .
- ^ Шейнер, Льюис Б.; Стюарт Л. Бил (1981). «Оценка методов оценки популяционных фармакокинетических параметров II. Биэкспоненциальная модель и экспериментальные фармакокинетические данные». Журнал фармакокинетики и биофармацевтики . 9 (5): 635–51. дои : 10.1007/BF01061030 . ПМИД 7334463 . S2CID 2668816 .
- ^ Шейнер, Льюис Б.; Стюарт Л. Бил (1983). «Оценка методов оценки популяционных фармакокинетических параметров III. Моноэкспоненциальная модель: рутинные клинические фармакокинетические данные». Журнал фармакокинетики и биофармацевтики . 11 (3): 303–19. дои : 10.1007/BF01061870 . ПМИД 6644555 . S2CID 9308691 .
- ^ Бауэр, Роберт Дж. (2019). «Учебное пособие NONMEM, часть I: описание команд и опций с простыми примерами демографического анализа» . CPT: Фармакометрика и системная фармакология . 8 (8): 525–537. дои : 10.1002/psp4.12404 . ISSN 2163-8306 . ПМК 6709426 . ПМИД 31056834 .
- ^ «ПсН::Дом» . uupharmacometrics.github.io . Проверено 9 мая 2022 г.
- ^ «Крылья для NONMEM» . wfn.sourceforge.net . Проверено 9 мая 2022 г.
- ^ Бауэр, Роберт Дж. (2019). «Учебное пособие по NONMEM, часть II: методы оценки и расширенные примеры» . CPT: Фармакометрика и системная фармакология . 8 (8): 538–556. дои : 10.1002/psp4.12422 . ISSN 2163-8306 . ПМК 6709422 . ПМИД 31044558 .