Дерево-пазл
ДЕРЕВО-ПАЗЗЛ [ 1 ] представляет собой компьютерную программу, используемую для построения филогенетических деревьев на основе данных последовательностей с помощью анализа максимального правдоподобия . Длины ветвей могут быть рассчитаны с учетом гипотезы молекулярных часов и без нее .
Программное обеспечение также реализовало картографирование правдоподобия, [ 2 ] метод визуализации филогенетической информации в наборах данных, а также несколько тестов для оценки того, значительно ли вероятность появления деревьев значительно хуже, чем у других деревьев.
Преемником программы является IQ-TREE . [ 3 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шмидт, Хайко А.; Стриммер, Корбиниан; Вингрон, Мартин; фон Хэзелер, Арндт (2002). «ДЕРЕВО-ЗАГАДКА: Филогенетический анализ максимального правдоподобия с использованием квартетов и параллельных вычислений» . Биоинформатика . 18 (3): 502–504. дои : 10.1093/биоинформатика/18.3.502 . ПМИД 11934758 .
- ^ Стриммер, Корбиниан; фон Хэзелер, Арндт (1997). «Картирование правдоподобия: простой метод визуализации филогенетического содержания выравнивания последовательностей» . Учеб. Натл. акад. наук. США . 94 (13): 6815–6819. дои : 10.1073/pnas.94.13.6815 . ПМК 21241 . ПМИД 9192648 .
- ^ Нгуен, Лам-Тунг; Шмидт, Хайко А.; фон Хэзелер, Арндт; Минь, Буй Куанг (2015). «IQ-TREE: быстрый и эффективный стохастический алгоритм для оценки филогений максимального правдоподобия» . Молекулярная биология и эволюция . 32 (П1): W268–W274. дои : 10.1093/molbev/msu300 . ПМЦ 4271533 . ПМИД 25371430 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]
 | Эта по биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |
 | Эта научная статья о программном обеспечении незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |