Загадочное родство
В популяционной генетике загадочное родство возникает, когда люди в исследовании генетических ассоциаций более тесно связаны с другой популяцией, чем предполагали исследователи. Это может действовать как мешающий фактор как в исследованиях «случай-контроль» , так и в полногеномных исследованиях ассоциаций. [ 1 ] [ 2 ] а также в исследованиях генетического разнообразия . Наряду со стратификацией населения , это один из наиболее заметных мешающих факторов, который может привести к завышенным показателям ложноположительных результатов в исследованиях генных ассоциаций. [ 3 ] [ 4 ] Это часто корректируют путем включения полигенного компонента в статистическую модель, используемую для обнаружения генетических ассоциаций. [ 5 ] Другими подходами, которые были разработаны для попытки контроля загадочного родства, являются метод геномного контроля и использование расширенных тестов отношения правдоподобия . [ 6 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Войт Б.Ф., Причард Дж.К. (сентябрь 2005 г.). «Сбивает с толку загадочное родство в исследованиях ассоциаций случай-контроль» . ПЛОС Генетика . 1 (3): е32. дои : 10.1371/journal.pgen.0010032 . ПМК 1200427 . ПМИД 16151517 .
- ^ Булик-Салливан Б.К., Лох П.Р., Финукейн Х.К., Рипке С., Ян Дж., Паттерсон Н., Дейли М.Дж., Прайс А.Л., Нил Б.М. (март 2015 г.). «Регрессия LD Score отличает смешивание от полигенности в полногеномных исследованиях ассоциаций» . Природная генетика . 47 (3): 291–5. дои : 10.1038/ng.3211 . ПМЦ 4495769 . ПМИД 25642630 .
- ^ Астл В., Balding DJ (ноябрь 2009 г.). «Структура населения и загадочное родство в исследованиях генетических ассоциаций». Статистическая наука . 24 (4): 451–471. arXiv : 1010.4681 . дои : 10.1214/09-STS307 . ISSN 2168-8745 . S2CID 2553594 .
- ^ Чжан Ф., Дэн Х.В. (октябрь 2010 г.). «Сбивает с толку загадочное родство в исследованиях ассоциаций на основе гаплотипов». Генетика . 138 (9–10): 945–50. дои : 10.1007/s10709-010-9476-6 . ПМИД 20680405 . S2CID 24583500 .
- ^ Силланпяя MJ (апрель 2011 г.). «Обзор методов учета помех из-за расслоения населения и загадочного родства в анализе ассоциаций геномных данных» . Наследственность . 106 (4): 511–9. дои : 10.1038/hdy.2010.91 . ПМЦ 3183892 . ПМИД 20628415 .
- ^ Чжан Ф., Дэн Х.В. (2010). «Коррекция загадочного родства в популяционных исследованиях ассоциаций непрерывных признаков» . Наследственность человека . 69 (1): 28–33. дои : 10.1159/000243151 . ПМЦ 2880733 . ПМИД 19797906 .