Главный ген-регулятор

В генетике главный ген-регулятор — это ген-регулятор, находящийся на вершине иерархии регуляции генов , особенно в регуляторных путях, связанных с клеток судьбой и дифференцировкой .

Примеры

Большинство генов, считающихся главными регуляторами, кодируют белки факторов транскрипции , которые, в свою очередь, изменяют экспрессию нижестоящих генов этого пути. ^[1] Канонические примеры главных регуляторов включают Oct-4 (также называемый POU5F1), SOX2 и NANOG — все факторы транскрипции, участвующие в поддержании плюрипотентности в стволовых клетках . ^[1] Главные регуляторы, участвующие в развитии и морфогенезе, могут также проявляться как онкогены, имеющие отношение к онкогенезу и метастазированию , как в случае с транскрипционным фактором Twist . ^[2]

Другие гены, которые считаются главными регуляторами, кодируют белки SR , которые действуют как факторы сплайсинга . ^[3] и некоторые некодирующие РНК . ^[4]

Критика

Концепцию главного регулятора критиковали за то, что она представляет собой «упрощенную парадигму», которая не учитывает многофакторное влияние на судьбу некоторых клеток. ^[5]

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б Мэттик, Дж.С.; Тафт, Р.Дж.; Фолкнер, Дж.Дж. (январь 2010 г.). «Глобальный взгляд на геномную информацию - выходя за рамки гена и главного регулятора». Тенденции в генетике . 26 (1): 21–8. дои : 10.1016/j.tig.2009.11.002 . ПМИД 19944475 .
^ Ян, Дж; Мани, ЮАР; Донахер, Дж.Л.; Рамасвами, С; Ицыксон, РА; Пойдем, С; Савангнер, П; Гительман, Я; Ричардсон, А; Вайнберг, РА (25 июня 2004 г.). «Твист, главный регулятор морфогенеза, играет важную роль в метастазировании опухоли» . Клетка . 117 (7): 927–39. дои : 10.1016/j.cell.2004.06.006 . ПМИД 15210113 . S2CID 16181905 .
^ Лонг, Джей Си; Касерес, Дж. Ф. (1 января 2009 г.). «Семейство белков SR факторов сплайсинга: главные регуляторы экспрессии генов». Биохимический журнал . 417 (1): 15–27. дои : 10.1042/BJ20081501 . ПМИД 19061484 .
^ Бреннеке, Дж; Аравин А.А.; Старк, А; Дус, М; Келлис, М; Сачиданандам, Р; Хэннон, GJ (23 марта 2007 г.). «Дискретные небольшие локусы, генерирующие РНК, как главные регуляторы активности транспозонов у дрозофилы» (PDF) . Клетка . 128 (6): 1089–103. дои : 10.1016/j.cell.2007.01.043 . ПМИД 17346786 . S2CID 2246942 .
^ Острайх, К.Дж.; Вайнманн, AS (ноябрь 2012 г.). «Главные регуляторы или определение линии? Изменение взглядов на факторы транскрипции CD4 + Т-клеток» . Обзоры природы. Иммунология . 12 (11): 799–804. дои : 10.1038/nri3321 . ПМЦ 3584691 . ПМИД 23059426 .

[mattick-1] Jump up to: ^а ^б Мэттик, Дж.С.; Тафт, Р.Дж.; Фолкнер, Дж.Дж. (январь 2010 г.). «Глобальный взгляд на геномную информацию - выходя за рамки гена и главного регулятора». Тенденции в генетике . 26 (1): 21–8. дои : 10.1016/j.tig.2009.11.002 . ПМИД 19944475 .

[yang-2] Ян, Дж; Мани, ЮАР; Донахер, Дж.Л.; Рамасвами, С; Ицыксон, РА; Пойдем, С; Савангнер, П; Гительман, Я; Ричардсон, А; Вайнберг, РА (25 июня 2004 г.). «Твист, главный регулятор морфогенеза, играет важную роль в метастазировании опухоли» . Клетка . 117 (7): 927–39. дои : 10.1016/j.cell.2004.06.006 . ПМИД 15210113 . S2CID 16181905 .

[long-3] Лонг, Джей Си; Касерес, Дж. Ф. (1 января 2009 г.). «Семейство белков SR факторов сплайсинга: главные регуляторы экспрессии генов». Биохимический журнал . 417 (1): 15–27. дои : 10.1042/BJ20081501 . ПМИД 19061484 .

[brennecke-4] Бреннеке, Дж; Аравин А.А.; Старк, А; Дус, М; Келлис, М; Сачиданандам, Р; Хэннон, GJ (23 марта 2007 г.). «Дискретные небольшие локусы, генерирующие РНК, как главные регуляторы активности транспозонов у дрозофилы» (PDF) . Клетка . 128 (6): 1089–103. дои : 10.1016/j.cell.2007.01.043 . ПМИД 17346786 . S2CID 2246942 .

[oestreich-5] Острайх, К.Дж.; Вайнманн, AS (ноябрь 2012 г.). «Главные регуляторы или определение линии? Изменение взглядов на факторы транскрипции CD4 + Т-клеток» . Обзоры природы. Иммунология . 12 (11): 799–804. дои : 10.1038/nri3321 . ПМЦ 3584691 . ПМИД 23059426 .

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]