ВФДБ

База данных факторов вирулентности
Содержание
Описание	База данных, отслеживающая факторы вирулентности бактерий.
Типы данных ; захвачен	Патогенные бактерии
Организмы	Бактерии
Контакт
Первичное цитирование	ПМИД 15608208
Доступ
Веб-сайт	www .mgc .и .cn /VFs /основной .htm
Разнообразный
Добавить в закладки ; сущности	да

VFDB, также известная как база данных факторов вирулентности, представляет собой базу данных , которая обеспечивает ученым быстрый доступ к факторам вирулентности бактериальных патогенов . ^{[ 1 ]} По нему можно перемещаться и просматривать, используя род или слова. инструмент BLAST предусмотрен Для поиска по известным факторам вирулентности . ^{[ 2 ]} VFDB содержит коллекцию из 16 важных бактериальных патогенов. ^{[ 1 ]} Скрипты Perl использовались для извлечения позиций и последовательностей VF из GenBank . ^{[ 3 ]} Кластеры ортологичных групп (COG) использовались для обновления неполных аннотаций. ^{[ 1 ]} Дополнительную информацию удалось получить NCBI . VFDB был создан на базе Windows операционных систем на серверах DELL PowerEdge 1600SC . ^{[ нужна ссылка ]}

См. также

^ Jump up to: ^а ^б ^с Чен, Л. (17 декабря 2004 г.). «VFDB: справочная база данных по факторам вирулентности бактерий» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D325–D328. дои : 10.1093/nar/gki008 . ISSN 1362-4962 . ПМК 539962 . ПМИД 15608208 .
^ Альтшул, С. (1 сентября 1997 г.). «Gapped BLAST и PSI-BLAST: новое поколение программ поиска по базам данных белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 25 (17): 3389–3402. дои : 10.1093/нар/25.17.3389 . ISSN 1362-4962 . ПМК 146917 . ПМИД 9254694 .
^ Бенсон, Д.А.; Карш-Мизрачи, И.; Липман, диджей; Остелл, Дж.; Сэйерс, EW (1 января 2009 г.). «ГенБанк» . Исследования нуклеиновых кислот . 37 (База данных): D26–D31. дои : 10.1093/нар/gkn723 . ISSN 0305-1048 . ПМК 2686462 . ПМИД 18940867 .

Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .