Альфа-бета-ствол

Альфа /бета-цилиндр представляет собой белковую складку , образованную единицами, состоящими из короткой α-спирали , за которой следуют две антипараллельные β-цепи , за которыми следуют α-спираль и β-цепь; три β-цепи образуют β-лист , который проходит параллельно цилиндру, а α-спираль находится снаружи цилиндра, но не контактирует с α-спиралями других повторов, как в цилиндрах TIM .

Белковые структуры, известные для этой складки, происходят из белков из семейства факторов инициации 6 эукариот и архей, а именно Methanococcus jannaschii aIF6 и Saccharomyces cerevisiae eIF6. ^{[ 1 ]} и из eIF6 из Dictyostelium discoideum . ^{[ 2 ]}

Эти альфа/бета-цилиндры представляют собой часто встречающиеся мотивы, созданные из повторений мотива петли бета-альфа-бета. Этот альфа/бета-цилиндр представляет собой домен фермента пируваткиназы. ^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Грофт С.М., Бекманн Р., Сали А., Берли С.К. (декабрь 2000 г.). «Кристаллические структуры фактора антиассоциации рибосом IF6». Нат. Структура. Биол . 7 (12): 1156–64. дои : 10.1038/82017 . ПМИД 11101899 . S2CID 35762049 .
^ Вейс Ф., Джудис Э., Черчер М., Джин Л., Хилценко С., Вонг CC, Трейнор Д., Кей Р.Р., Уоррен Эй.Дж. (ноябрь 2015 г.). «Механизм высвобождения eIF6 из зарождающейся рибосомальной субъединицы 60S» . Нат. Структура. Мол. Биол . 22 (11): 914–9. дои : 10.1038/nsmb.3112 . ПМЦ 4871238 . ПМИД 26479198 .
^ Ли, Джей Си; Герман, П. (2011). Структурные и функциональные энергетические связи в аллостерической регуляции мышечной пируваткиназы . Методы энзимологии. Том. 488. стр. 185–217. дои : 10.1016/B978-0-12-381268-1.00008-2 . ISBN 9780123812681 . ПМИД 21195229 .

[1] Грофт С.М., Бекманн Р., Сали А., Берли С.К. (декабрь 2000 г.). «Кристаллические структуры фактора антиассоциации рибосом IF6». Нат. Структура. Биол . 7 (12): 1156–64. дои : 10.1038/82017 . ПМИД 11101899 . S2CID 35762049 .

[2] Вейс Ф., Джудис Э., Черчер М., Джин Л., Хилценко С., Вонг CC, Трейнор Д., Кей Р.Р., Уоррен Эй.Дж. (ноябрь 2015 г.). «Механизм высвобождения eIF6 из зарождающейся рибосомальной субъединицы 60S» . Нат. Структура. Мол. Биол . 22 (11): 914–9. дои : 10.1038/nsmb.3112 . ПМЦ 4871238 . ПМИД 26479198 .

[3] Ли, Джей Си; Герман, П. (2011). Структурные и функциональные энергетические связи в аллостерической регуляции мышечной пируваткиназы . Методы энзимологии. Том. 488. стр. 185–217. дои : 10.1016/B978-0-12-381268-1.00008-2 . ISBN 9780123812681 . ПМИД 21195229 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]