Донна Р. Маглотт
Донна Р. Маглотт | |
---|---|
Альма-матер | Мичиганский университет |
Научная карьера | |
Учреждения | Национальный центр биотехнологической информации |
Диссертация | Строение и функции 50S рибосомы Escherichia coli (1970). |
Донна Р. Маглотт — научный сотрудник Национального центра биотехнологической информации, известная своими исследованиями крупномасштабных проектов в области геномики, включая геном мыши и разработку баз данных, необходимых для геномных исследований.
Образование и карьера
[ редактировать ]Маглотт получила докторскую степень. в 1970 году из Мичиганского университета , где она работала над рибосомой 50S в бактерии Escherichia coli . [1] Она занимала академическую должность в Университете Говарда ; [ когда? ] а затем в 1986 году перешла в Американский центр типовой культуры , где начала создавать базы данных, необходимые для геномных исследований. [2] [3] Она начала работать в Национальном центре биотехнологической информации (NCBI) в 1998 году. [4]
Исследовать
[ редактировать ]Во время учебы в Университете Говарда Маглотт работал над синтезом белка на ранних стадиях развития морских ежей . [5] [6] В ATCC она работала над репозиториями, хранящими клоновую и геномную информацию. [7] [8] и начал исследования с использованием геномных инструментов для изучения информации о хромосомах человека. [9] [10] В 2000 году Маглотт работал с Кимом Д. Прюиттом над созданием RefSeq , веб-ресурса для информации о генах, размещенного на NCBI. [11] [12] и обновлялся на протяжении многих лет. [13] [14] Она также принимала участие в разработке других баз данных в NCBI, включая Entrez Gene , [15] [16] КлинВар , [17] [18] Маркеры STS, консервативные последовательности кодирования (CCDS), Map Viewer, RefSeqGene, реестр генетического тестирования NIH (GTR), MedGen и ClinVar . [4] Крупномасштабные геномные проекты, над которыми работал Марготт, включают базу данных генома крысы, [19] и геном мыши [20] [21] и транскриптом. [22] В 2006 году Маглотт был частью команды, анализировавшей геном морского ежа Strongylocentrotus purpuratus , который стал первым геномом, полученным для подвижного морского беспозвоночного. [23] [24]
Избранные публикации
[ редактировать ]- Консорциум по секвенированию генома мыши (2002). «Первичное секвенирование и сравнительный анализ генома мыши» . Природа . 420 (6915): 520–562. Бибкод : 2002Natur.420..520W . дои : 10.1038/nature01262 . ISSN 0028-0836 . PMID 12466850 .
- Маглотт, Д. (17 декабря 2004 г.). «Энтрез Джин: генно-ориентированная информация в NCBI» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D54–D58. дои : 10.1093/nar/gki031 . ISSN 1362-4962 . ПМК 539985 . ПМИД 15608257 .
- Прюитт, Ким Д.; Татусова, Татьяна; Маглотт, Донна Р. (1 января 2007 г.). «Эталонные последовательности NCBI (RefSeq): тщательно подобранная база данных неизбыточных последовательностей геномов, транскриптов и белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (Проблема с базой данных): D61–65. дои : 10.1093/nar/gkl842 . ISSN 1362-4962 . ПМЦ 1716718 . ПМИД 17130148 .
- Международный консорциум по геномике тли (23 февраля 2010 г.). Эйзен, Джонатан А. (ред.). «Последовательность генома гороховой тли Acyrthosiphon pisum» . ПЛОС Биология . 8 (2): e1000313. дои : 10.1371/journal.pbio.1000313 . ISSN 1545-7885 . ПМЦ 2826372 . ПМИД 20186266 .
- Ландрам, Мелисса Дж.; Ли, Дженнифер М.; Райли, Джордж Р.; Чан, Вонхи; Рубинштейн, Венди С.; Черч, Дина М.; Маглотт, Донна Р. (2014). «ClinVar: общедоступный архив взаимосвязей между вариациями последовательностей и фенотипом человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Д1): Д980–Д985. дои : 10.1093/нар/gkt1113 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 3965032 . ПМИД 24234437 .
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Маглотт, Донна Рэй Шнайдер (1970). Строение и функция 50S рибосомы Escherichia coli (Диссертация). Анн-Арбор – Мичиган, OCLC 633231185 .
- ^ «Центр биоинформатики и вычислительной биологии» . www.cbcb.umd.edu . 2006. Архивировано из оригинала 17 августа 2007 г. Проверено 02 октября 2021 г.
- ^ «Донна Маглотт, доктор философии - ClinGen | Ресурс клинического генома» . 10 июля 2017 г. Архивировано из оригинала 10 июля 2017 г. Проверено 02 октября 2021 г.
- ^ Перейти обратно: а б «Проект человеческого вариома» . www.humanvariomeproject.org . Проверено 18 декабря 2016 г.
- ^ Маглотт, доктор медицинских наук (1985). «Диссоциация клеток эмбрионов морских ежей изменяет синтез актинов и других белков» . Дифференциация клеток . 17 (1): 29–43. дои : 10.1016/0045-6039(85)90535-4 . ПМИД 3875415 .
- ^ Маглотт, доктор медицинских наук (1985). «Двумерный электрофоретический анализ основных фосфопротеинов морского ежа Arbacia punctulata» . Сравнительная биохимия и физиология. Часть B: Сравнительная биохимия . 80 (3): 513–516. дои : 10.1016/0305-0491(85)90282-2 . ПМИД 4006443 .
- ^ Маглотт, Донна Р.; Нирман, Уильям К. (1 ноября 1990 г.). «Репозитории клонов и геномов в коллекции американских типовых культур» . Геномика . 8 (3): 601–605. дои : 10.1016/0888-7543(90)90054-X . ISSN 0888-7543 . ПМИД 1981058 .
- ^ Маглотт, Донна Р.; Нирман, Уильям К. (1991). «Зоны и библиотеки млекопитающих в ATCC» . Геном млекопитающих . 1 (1): 59–64. дои : 10.1007/BF00350848 . ISSN 0938-8990 . ПМИД 1794047 . S2CID 12336955 .
- ^ Скотт Дуркин, А.; Маглотт, Донна Р.; Нирман, Уильям К. (1 ноября 1992 г.). «Хромосомное распределение 38 меток экспрессируемых последовательностей (EST) в мозге человека путем анализа флуоресцентно меченных продуктов ПЦР из панелей гибридных клеток» . Геномика . 14 (3): 808–810. дои : 10.1016/S0888-7543(05)80194-6 . ISSN 0888-7543 . ПМИД 1427913 .
- ^ Шмидт, Валентина А.; Нирман, Уильям К.; Маглотт, Донна Р.; Купит, Лиза Д.; Московиц, Кейт А.; Вайнер, Джин Энн; Бахоу, Вади Ф. (1998). «Ген рецептора-3, активируемого протеиназой человека (PAR-3)» . Журнал биологической химии . 273 (24): 15061–15068. дои : 10.1074/jbc.273.24.15061 . ISSN 0021-9258 . ПМИД 9614115 .
- ^ Маглотт, доктор медицинских наук (1 января 2000 г.). «LocusLink и RefSeq NCBI» . Исследования нуклеиновых кислот . 28 (1): 126–128. дои : 10.1093/нар/28.1.126 . ПМЦ 102393 . ПМИД 10592200 .
- ^ Прюитт, Ким Д.; Кац, Кеннет С.; Сикотт, Хьюз; Маглотт, Донна Р. (2000). «Представляем RefSeq и LocusLink: курируемые ресурсы генома человека в NCBI» . Тенденции в генетике . 16 (1): 44–47. дои : 10.1016/S0168-9525(99)01882-X . ПМИД 10637631 .
- ^ Прюитт, К.Д. (1 января 2001 г.). «RefSeq и LocusLink: генно-ориентированные ресурсы NCBI» . Исследования нуклеиновых кислот . 29 (1): 137–140. дои : 10.1093/нар/29.1.137 . ПМК 29787 . ПМИД 11125071 .
- ^ Прюитт, К.Д.; Татусова Т.; Маглотт, доктор медицинских наук (03 января 2007 г.). «Эталонные последовательности NCBI (RefSeq): тщательно подобранная база данных неизбыточных последовательностей геномов, транскриптов и белков» . Исследования нуклеиновых кислот . 35 (База данных): D61–D65. дои : 10.1093/nar/gkl842 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 1716718 . ПМИД 17130148 .
- ^ Маглотт, Д. (17 декабря 2004 г.). «Энтрез Джин: генно-ориентированная информация в NCBI» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (Проблема с базой данных): D54–D58. дои : 10.1093/nar/gki031 . ISSN 1362-4962 . ПМК 539985 . ПМИД 15608257 .
- ^ Маглотт, Д.; Остелл, Дж.; Прюитт, К.Д.; Татусова, Т. (01.01.2011). «Энтрез Джин: генно-ориентированная информация в NCBI» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (База данных): D52–D57. дои : 10.1093/nar/gkq1237 . ISSN 0305-1048 . ПМК 3013746 . ПМИД 21115458 .
- ^ Ландрам, Мелисса Дж; Ли, Дженнифер М; Бенсон, Марк; Браун, Гарт Р.; Чао, Чен; Читипиралла, Шанмуга; Гу, Баошань; Харт, Дженнифер; Хоффман, Дуглас; Чан, Вонхи; Карапетян, Карен (04.01.2018). «ClinVar: улучшение доступа к вариантам интерпретаций и подтверждающим доказательствам» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (Д1): Д1062–Д1067. дои : 10.1093/нар/gkx1153 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 5753237 . ПМИД 29165669 .
- ^ Ландрам, Мелисса Дж.; Ли, Дженнифер М.; Райли, Джордж Р.; Чан, Вонхи; Рубинштейн, Венди С.; Черч, Дина М.; Маглотт, Донна Р. (2014). «ClinVar: общедоступный архив взаимосвязей между вариациями последовательностей и фенотипом человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (Д1): Д980–Д985. дои : 10.1093/нар/gkt1113 . ISSN 0305-1048 . ПМЦ 3965032 . ПМИД 24234437 .
- ^ Твиггер, С. (1 января 2002 г.). «База данных генома крыс (RGD): картирование болезней на геноме» . Исследования нуклеиновых кислот . 30 (1): 125–128. дои : 10.1093/нар/30.1.125 . ПМК 99132 . ПМИД 11752273 .
- ^ Консорциум по секвенированию генома мыши (2002). «Первичное секвенирование и сравнительный анализ генома мыши» . Природа . 420 (6915): 520–562. Бибкод : 2002Natur.420..520W . дои : 10.1038/nature01262 . ISSN 0028-0836 . PMID 12466850 .
- ^ Хадсон, Томас Дж.; Черч, Дина М.; Гринуэй, Саймон; Нгуен, Хай; Кук, апрель; Стин, Роберт Г.; Ван Эттен, Уильям Дж.; Касл, Эндрю Б.; Стривенс, Марк А.; Трикетт, Памела; Хьюстон, Кристина (2001). «Радиационная гибридная карта генов мыши» . Природная генетика . 29 (2): 201–205. дои : 10.1038/ng1001-201 . ISSN 1061-4036 . ПМИД 11586302 . S2CID 27643522 .
- ^ Консорциум FANTOM и группа исследований генома RIKEN, этапы I и II* (2002 г.). «Анализ транскриптома мыши на основе функциональной аннотации 60 770 полноразмерных кДНК» . Природа . 420 (6915): 563–573. Бибкод : 2002Natur.420..563O . дои : 10.1038/nature01266 . hdl : 10161/11223 . ISSN 0028-0836 . ПМИД 12466851 . S2CID 4347839 .
- ^ Консорциум по секвенированию генома морских ежей; Содергрен, Э.; Вайншток, генеральный директор; Дэвидсон, Э.Х; Кэмерон, РА; Гиббс, РА; Ангерер, RC; Ангерер, Л.М.; Арноне, Мичиган; Берджесс, доктор медицинских наук; Берк, РД (10 ноября 2006 г.). «Геном морского ежа Strongylocentrotus purpuratus» . Наука . 314 (5801): 941–952. Бибкод : 2006Sci...314..941S . дои : 10.1126/science.1133609 . ISSN 0036-8075 . ПМК 3159423 . ПМИД 17095691 .
- ^ Ливингстон, Британская Колумбия; Киллиан, CE; Уилт, Ф.; Кэмерон, А.; Ландрам, MJ; Ермолаева О.; Сапожников В.; Маглотт, ДР; Бьюкенен, AM; Эттенсон, Калифорния (2006). «Полногеномный анализ белков, связанных с биоминерализацией, у морского ежа Strongylocentrotus purpuratus» . Биология развития . 300 (1): 335–348. дои : 10.1016/j.ydbio.2006.07.047 . ПМИД 16987510 .