ФастКонтакт
![]() | В этой статье есть несколько проблем. Пожалуйста, помогите улучшить его или обсудите эти проблемы на странице обсуждения . ( Узнайте, как и когда удалять эти шаблонные сообщения )
|
FastContact — это алгоритм для быстрой оценки контактной и свободной энергии связывания для структур белково-белковых комплексов . Он основан на статистически определенном десольватационном контактном потенциале и кулоновской электростатике , зависящей от расстояния с диэлектрической проницаемостью . Приложение также сообщает об остаточных бесконтактных энергиях, которые быстро выделяют горячие точки взаимодействия.
Программа была написана на Фортране 77 Карлосом Дж. Камачо и Чао Чжаном на факультете вычислительной биологии Питтсбургского университета , Пенсильвания. [ 1 ] Веб-сервер для запуска FastContact онлайн или загрузки двоичного файла был настроен П. Кристофом Чампом в июле 2005 года. [ 2 ] [ 3 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Камачо CJ, Чжан С (2005). «FastContact: быстрая оценка контакта и свободных энергий связывания» . Биоинформатика . 21 (10): 2534–2536. doi : 10.1093/биоинформатика/bti322 . ПМИД 15713734 .
- ^ Камачо CJ, Ма Х, Чемпион ПК (2006). «Оценка разнообразного набора высококачественных состыкованных конформаций: метаоценка, основанная на электростатических и десольватационных взаимодействиях». Белки . 63 (4): 868–877. дои : 10.1002/прот.20932 . ПМИД 16506242 . S2CID 13143572 .
- ^ Чемпион ПК, Камачо CJ (2007). «FastContact: инструмент оценки свободной энергии для структур белково-белковых комплексов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (дополнение к Интернету): W556–60. дои : 10.1093/нар/gkm326 . ЧВК 1933237 . ПМИД 17537824 .
Внешние ссылки
[ редактировать ]- Бинарные файлы FastContact — двоичные файлы доступны для скачивания бесплатно (с документацией).
- Сервер FastContact — создан П. Кристофом Чампом в июле 2005 года.
- ФастКонтакт Вики