ФастКонтакт

FastContact — это алгоритм для быстрой оценки контактной и свободной энергии связывания для структур белково-белковых комплексов . Он основан на статистически определенном десольватационном контактном потенциале и кулоновской электростатике , зависящей от расстояния с диэлектрической проницаемостью . Приложение также сообщает об остаточных бесконтактных энергиях, которые быстро выделяют горячие точки взаимодействия.

Программа была написана на Фортране 77 Карлосом Дж. Камачо и Чао Чжаном на факультете вычислительной биологии Питтсбургского университета , Пенсильвания. ^{[ 1 ]} Веб-сервер для запуска FastContact онлайн или загрузки двоичного файла был настроен П. Кристофом Чампом в июле 2005 года. ^{[ 2 ]}^{[ 3 ]}

Ссылки

^ Камачо CJ, Чжан С (2005). «FastContact: быстрая оценка контакта и свободных энергий связывания» . Биоинформатика . 21 (10): 2534–2536. doi : 10.1093/биоинформатика/bti322 . ПМИД 15713734 .
^ Камачо CJ, Ма Х, Чемпион ПК (2006). «Оценка разнообразного набора высококачественных состыкованных конформаций: метаоценка, основанная на электростатических и десольватационных взаимодействиях». Белки . 63 (4): 868–877. дои : 10.1002/прот.20932 . ПМИД 16506242 . S2CID 13143572 .
^ Чемпион ПК, Камачо CJ (2007). «FastContact: инструмент оценки свободной энергии для структур белково-белковых комплексов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (дополнение к Интернету): W556–60. дои : 10.1093/нар/gkm326 . ЧВК 1933237 . ПМИД 17537824 .

Внешние ссылки

Бинарные файлы FastContact — двоичные файлы доступны для скачивания бесплатно (с документацией).
Сервер FastContact — создан П. Кристофом Чампом в июле 2005 года.
ФастКонтакт Вики

Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[fastcontact-1] Камачо CJ, Чжан С (2005). «FastContact: быстрая оценка контакта и свободных энергий связывания» . Биоинформатика . 21 (10): 2534–2536. doi : 10.1093/биоинформатика/bti322 . ПМИД 15713734 .

[Camacho2006-2] Камачо CJ, Ма Х, Чемпион ПК (2006). «Оценка разнообразного набора высококачественных состыкованных конформаций: метаоценка, основанная на электростатических и десольватационных взаимодействиях». Белки . 63 (4): 868–877. дои : 10.1002/прот.20932 . ПМИД 16506242 . S2CID 13143572 .

[Champ2007-3] Чемпион ПК, Камачо CJ (2007). «FastContact: инструмент оценки свободной энергии для структур белково-белковых комплексов» . Нуклеиновые кислоты Рез . 35 (дополнение к Интернету): W556–60. дои : 10.1093/нар/gkm326 . ЧВК 1933237 . ПМИД 17537824 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]