Фагеом
Фагеом и их метагеномов , — сообщество бактериофагов локализованное в определенной среде, подобное микробиому . [ 1 ] [ 2 ] Этот термин был впервые использован в статье Моди и др. в 2013 году. [ 3 ] и продолжает использоваться в научных статьях, касающихся бактериофагов и их метагеномов. Бактериофаг , или сокращенно фаг , — это вирус, способный инфицировать бактерии и археи и размножаться внутри них. Фагеом — это подкатегория вирома , который объединяет все вирусы, связанные с хозяином или средой. [ 4 ] Фаги составляют большую часть большинства виромов и в настоящее время считаются наиболее распространенным организмом. [ 5 ] Часто при проведении исследований ученые обращают внимание только на фагом, а не на виром.
У людей
[ редактировать ]Хотя бактериофаги не способны инфицировать клетки человека, они в изобилии обнаружены в вироме человека . [ 6 ]
Фагеом кишечника человека в последнее время стал предметом интереса научного сообщества. Состав кишечного фагеома может быть ответственен за различные заболевания кишечника, такие как ВЗК. Состав фагов, составляющих фагом кишечника здорового человека, в настоящее время дискутируется, поскольку разные методы исследования могут привести к разным результатам. [ 7 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ма Ю, Ю Х, Май Джи, Токуясу Т, Лю С (февраль 2018 г.). «Каталог кишечных фагов человека коррелирует кишечный фагом с диабетом 2 типа» . Микробиом . 6 (1): 24. дои : 10.1186/s40168-018-0410-y . ПМК 5796561 . ПМИД 29391057 .
- ^ Таунсенд Э.М., Келли Л., Маскатт Дж., Бокс Дж.Д., Харгрейвс Н., Лилли Д., Джеймсон Э. (04.06.2021). «Фагеом кишечника человека: происхождение и роль в микробиоме кишечника человека» . Границы клеточной и инфекционной микробиологии . 11 : 643214. дои : 10.3389/fcimb.2021.643214 . ПМЦ 8213399 . ПМИД 34150671 .
- ^ Моди С.Р., Ли Х.Х., Спина К.С., Коллинз Дж.Дж. (июль 2013 г.). «Лечение антибиотиками расширяет резервуар резистентности и экологическую сеть метагенома фага» . Природа . 499 (7457): 219–222. Бибкод : 2013Natur.499..219M . дои : 10.1038/nature12212 . ПМЦ 3710538 . ПМИД 23748443 .
- ^ Virgin HW (март 2014 г.). «Виром в физиологии и заболеваниях млекопитающих» . Клетка . 157 (1): 142–150. дои : 10.1016/j.cell.2014.02.032 . ПМЦ 3977141 . ПМИД 24679532 .
- ^ Кин EC (январь 2015 г.). «Век исследований фагов: бактериофаги и формирование современной биологии» . Биоэссе . 37 (1): 6–9. doi : 10.1002/bies.201400152 . ПМЦ 4418462 . ПМИД 25521633 .
- ^ Гурска А., Петер С., Уиллманн М., Аутенрит И., Шлаберг Р., Хьюсон Д.Х. (июнь 2018 г.). «Динамика фагеома кишечника человека при лечении антибиотиками». Вычислительная биология и химия . 74 : 420–427. doi : 10.1016/j.compbiolchem.2018.03.011 . ПМИД 29567068 . S2CID 4222429 .
- ^ Шкопоров А.Н., Райан Ф.Дж., Дрейпер Л.А., Форд А., Стокдейл С.Р., Дейли К.М. и др. (апрель 2018 г.). «Воспроизводимые протоколы метагеномного анализа фекальных фагеомов человека» . Микробиом . 6 (1): 68. дои : 10.1186/s40168-018-0446-z . ПМК 5892011 . ПМИД 29631623 .