Олиготипирование (таксономия)
Олиготипирование — диагностический или молекулярно-биологический метод классификации организмов по коротким интервалам первичной последовательности ДНК .
«Системы» олиготипирования представляют собой наборы признанных целевых последовательностей, которые идентифицируют членов категорий внутри классификации. Классификация может проводиться с целью первичной биологической таксономии или функциональной классификации.
Классификация бактерий
[ редактировать ]Олиготипирование использовалось для классификации бактерий . [ 1 ] выявление генов устойчивости бактерий к антибиотикам, [ 2 ] выявление генетических факторов инфекционных заболеваний человека, [ 3 ] и проведение тестов на гистосовместимость доноров/реципиентов человеческой крови или костного мозга.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Роринг, С; Бриттен, Д; Буншотен, А.Е.; Хьюз, MS; Скьюс, Р.А.; ван Эмбден, JD A; Нил, SD (15 марта 1998 г.). «Спейсерное олиготипирование изолятов Mycobacterium bovis по сравнению с типированием по полиморфизму длины рестрикционных фрагментов с использованием зондов PGRS, DR и IS6110». Ветеринарная микробиология . 61 (1–2): 111–120. дои : 10.1016/S0378-1135(98)00178-3 . ПМИД 9646470 .
- ^ Мабилат, К.; Курвален, П. (1 ноября 1990 г.). «Разработка «олиготипирования» для характеристики и молекулярной эпидемиологии ТЕМ-бета-лактамаз у представителей семейства Enterobacteriaceae» . Антимикробные средства и химиотерапия . 34 (11): 2210–2216. дои : 10.1128/AAC.34.11.2210 . ISSN 0066-4804 . ПМК 172024 . ПМИД 2073111 .
- ^ Рани, Раджни; Фернандес-Вина, Массачусетс; Захир, ЮАР; Бина, КР; Стастный, Питер (1 июля 1993 г.). «Исследование аллелей HLA класса II методом ПЦР-олиготипирования у больных проказой из Северной Индии». Тканевые антигены . 42 (1): 133–137. дои : 10.1111/j.1399-0039.1993.tb02179.x . ISSN 1399-0039 . ПМИД 8284786 .