Эволюционная классификация белковых доменов
 | Редактор провел поиск и обнаружил, что существует достаточно источников, предмета чтобы установить известность . ( февраль 2021 г. ) |
| Содержание | |
|---|---|
| Типы данных захвачен | Белковые домены |
| Контакт | |
| Исследовательский центр | Лаборатория Гришина, Юго-западный медицинский центр Техасского университета |
| Авторы | H. Cheng, R. D. Schaeffer, Y. Liao, L. N. Kinch, J. Pei, S. Shi, B. H. Kim, N. V. Grishin. |
| Первичное цитирование | PMID 25474468 |
| Дата выпуска | 2014 |
| Доступ | |
| Веб-сайт | http://prodata.swmed.edu/ecod/ |
| Разнообразный | |
| Версия | постоянно обновляется |
| Политика курирования | руководство по новым белкам; автоматизирован для тех, у кого близкие совпадения |
Эволюционная классификация белковых доменов ( ЭКОД ) представляет собой биологическую базу данных , которая классифицирует белковые домены, доступные в Банке данных белков . ECOD пытается определить эволюционные отношения между белками.
Подобно Pfam , CATH и SCOP , ECOD компилирует домены вместо целых белков. Однако ECOD в большей степени фокусируется на эволюционных отношениях: вместо группировки белков по складкам , что может просто представлять собой конвергентную эволюцию , ECOD группирует белки только по очевидной гомологии . [1]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ченг, Х; Шеффер, Р.Д.; Ляо, Ю; Кинч, Л.Н.; Пей, Дж; Ши, С; Ким, Б.Х.; Гришин Н.В. (декабрь 2014 г.). «ECOD: эволюционная классификация белковых доменов» . PLOS Вычислительная биология . 10 (12): e1003926. Бибкод : 2014PLSCB..10E3926C . дои : 10.1371/journal.pcbi.1003926 . ПМК 4256011 . ПМИД 25474468 .
 | Эта биологическим базам данных статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |