Майкл Фишбах

Майкл Фишбах
Майкл Фишбах
Рожденный	3 ноября 1980 г.
Альма-матер	Гарвардский колледж ; Гарвардский университет ;
	Научная карьера
Учреждения	; Стэнфордский университет ;
Веб-сайт	fischbachgroup.org

Майкл Эндрю Фишбах (родился 3 ноября 1980 г.) - американский химик, микробиолог и генетик. Он является доцентом кафедры биоинженерии и научным сотрудником факультета ChEM-H Стэнфордского университета. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]} и исследователь Биохаба Чана Цукерберга . ^{[ 3 ]}

Образование

Фишбах получил степень бакалавра биохимических наук в Гарвардском колледже в 2003 году. В это время (2000-2003) он работал в лаборатории Джеффри Сеттлмана в онкологическом центре больницы общего профиля Массачусетса над биохимией онкогенных мутантов малой ГТФазы Ras . ^{[ 4 ]} В 2007 году он получил степень доктора философии. Доктор философии по химии и химической биологии Гарвардского университета, работает в Кристофера Т. Уолша лаборатории Гарвардской медицинской школы над приобретением железа бактериальными патогенами и биохимией биосинтеза натуральных продуктов. ^{[ 5 ]}^{[ 6 ]}

Карьера

Фишбах был младшим научным сотрудником отделения молекулярной биологии Массачусетской больницы общего профиля (2007–2009 гг.), а затем поступил на факультет Калифорнийского университета в Сан-Франциско в 2009 г. В сентябре 2017 г. он перешел в Стэнфордский университет в качестве доцента. Чен Цукерберг, исследователь Biohub, Фишбах — один из восьми преподавателей Стэнфорда, Калифорнийского университета в Сан-Франциско и Калифорнийского университета в Беркли, возглавляющих CZ. Инициатива Biohub Microbiome, запущенная в 2018 году с целью понять, как микробиота может влиять на здоровье человека. ^{[ 7 ]}

Фишбах в настоящее время является членом научно-консультативного совета NGM Biopharmaceuticals. ^{[ 8 ]} и соучредитель Revolution Medicines. ^{[ 9 ]}

Исследовать

Лаборатория Фишбаха занимается обнаружением и характеристикой малых молекул микроорганизмов с упором на микробиом человека. ^{[ 10 ]}^{[ 11 ]}

Малые молекулы микробиоты человека

В 2014 году Фишбах и его лаборатория опубликовали исследование биосинтетических генов в микробиоме человека , описывающее способность микробов, связанных с человеком, продуцировать тиопептидные антибиотики. ^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]} Лаборатория Фишбаха обнаружила, что кишечный комменсал Bacteroides fragilis вырабатывает иммуномодулирующий сфинголипид альфа-галактозилцерамид. ^{[ 16 ]} показали, что выработка нейромедиаторов распространена среди комменсальных кишечных бактерий, ^{[ 17 ]} и открыли путь биосинтеза общего класса желчных кислот , продуцируемых кишечными бактериями. ^{[ 18 ]}

Вычислительные подходы к открытию натуральных продуктов

Лаборатория Фишбаха разработала алгоритм ClusterFinder, который автоматизирует процесс идентификации генов биосинтеза малых молекул в последовательностях бактериального генома. ^{[ 19 ]}^{[ 20 ]} Вместе с Марниксом Медемой он разработал второй алгоритм идентификации кластеров биосинтетических генов — antiSMASH. ^{[ 21 ]} с которым ClusterFinder был объединен.

Личная жизнь

Фишбах женат на Элизабет Саттели , доценте кафедры химического машиностроения в Стэнфорде. ^{[ 22 ]}

Внешние ссылки

«Майкл Фишбах: понимание биома кишечника» в подкасте Стэнфордской инженерной школы «Будущее всего с Рассом Альтманом »

Ссылки

^ «Профиль Майкла Фишбаха | Стэнфордские профили» . Profiles.stanford.edu . Проверено 12 июля 2019 г.
^ «Сотрудники факультета | ЧЭМ-Г» . chemh.stanford.edu . Проверено 12 июля 2019 г.
^ «Программа исследователей – Биохаб Чана Цукерберга» . Проверено 12 июля 2019 г.
^ Фишбах М.А., Сеттлман Дж. Специфическая биохимическая инактивация онкогенных белков Ras нуклеозиддифосфаткиназой. Рак Рез. 15 июля 2003 г.;63(14):4089-94. ПМИД 12874011 .
^ Фишбах М.А., Лин Х., Лю Д.Р., Уолш Коннектикут. Характеристика in vitro IroB, патоген-ассоциированной C-гликозилтрансферазы. Proc Natl Acad Sci US A. 2005, 18 января; 102 (3): 571-6. Электронная публикация 2004 г., 14 декабря. ПМИД 15598734 ; ПМК 545562 .
^ Уолш, Коннектикут, Фишбах, Массачусетс. Натуральные продукты, версия 2.0: соединение генов с молекулами. J Am Chem Soc. 3 марта 2010 г.; 132(8): 2469-93. два : 10.1021/ja909118a . ПМИД 20121095 ; ПМЦ 2828520 .
^ «Чан Цукерберг Biohub финансирует новые исследовательские усилия, инициативу по микробиому» . Центр новостей . 8 февраля 2017 года . Проверено 12 июля 2019 г.
^ «Научно-консультативный совет – NGM Bio» . www.ngmbio.com . Архивировано из оригинала 20 июля 2018 г. Проверено 7 января 2016 г.
^ «Команда – Революционные лекарства» . Revolutionmedicines.com .
^ «Фишбах Групп – Дом» . fischbachgroup.org .
^ Дония М.С., Фишбах М.А.. Малые молекулы микробиоты человека. Наука. 2015, 24 июля;349(6246):1254766. дои : 10.1126/science.1254766 . Epub, 23 июля 2015 г. Обзор. ПМИД 26206939 ; ПМК 4641445
^ Дония М.С., Чимерманчич П., Шульце С.Дж., Виланд Браун LC, Мартин Дж., Митрева М., Кларди Дж., Линингтон Р.Г., Фишбах М.А.. Систематический анализ кластеров биосинтетических генов в микробиоме человека выявил общее семейство антибиотиков. Клетка. 11 сентября 2014 г.; 158(6): 1402-14. дои : 10.1016/j.cell.2014.08.032 . ПМИД 25215495 ; ПМК 4164201 .
^ «Добыча антибиотиков прямо у нас под носом» . Нью-Йорк Таймс . 11 сентября 2014 г.
^ Пак, Алиса (12 сентября 2014 г.). «Лекарства своими руками: скоро антибиотики можно будет делать из собственных бактерий» . Время . Проверено 26 апреля 2018 г.
^ «Установите вора... Бактерии-спутники человечества — хорошее место для поиска новых лекарств» . Экономист . 20 сентября 2014 г. Проверено 26 апреля 2018 г.
^ Виланд Браун LC, Пенаранда С., Кашьяп ПК, Уильямс Б.Б., Кларди Дж., Кроненберг М. , Зонненбург Дж.Л., Комсток Л.Е., Блюстоун Дж.А., Фишбах М.А. Производство α-галактозилцерамида видным представителем микробиоты кишечника человека. ПЛоС Биол. Июль 2013 г.;11(7):e1001610. дои : 10.1371/journal.pbio.1001610 . Epub 2013, 16 июля. ПМИД 23874157 ; ПМЦ 3712910 .
^ Уильямс Б.Б., Ван Беншотен А.Х., Чимерманчич П., Дония М.С., Циммерманн М., Такетани М., Исихара А., Кашьяп ПК, Фрейзер Дж.С., Фишбах М.А.. Открытие и характеристика декарбоксилаз кишечной микробиоты, которые могут продуцировать нейромедиатор триптамин. Микроб-хозяин клетки. 8 октября 2014 г.; 16(4): 495-503. дои : 10.1016/j.chom.2014.09.001 . Epub, 25 сентября 2014 г. ПМИД 25263219 ; ПМК 4260654 .
^ Девлин А.С., Фишбах М.А.. Путь биосинтеза ведущего класса желчных кислот, полученных из микробиоты. Nat Chem Biol. 11 сентября 2015 г.: 685–90. дои : 10.1038/nchembio.1864 . Epub, 20 июля 2015 г. ПМИД 26192599 ; ПМЦ 4543561 .
^ Чимерманчич П., Медема М.Х., Клаесен Дж., Курита К., Виланд Браун LC, Мавромматис К., Пати А., Годфри П.А., Кёрсен М., Кларди Дж., Биррен Б.В., Такано Э., Сали А., Линингтон Р.Г., Фишбах М.А. Понимание вторичного метаболизма на основе глобального анализа кластеров биосинтетических генов прокариот. Клетка. 17 июля 2014 г.; 158(2): 412-21. дои : 10.1016/j.cell.2014.06.034 . ПМИД 25036635 ; ПМК 4123684 .
^ Медема М.Х., Фишбах М.А.. Вычислительные подходы к открытию натуральных продуктов. Nat Chem Biol. Сентябрь 2015 г.;11(9):639-48. дои : 10.1038/nchembio.1884 . ПМИД 26284671 .
^ «антиСМЭШ бактериальная версия» . antismash.вторичные метаболиты.org .
^ «Профиль Элизабет Саттели | Стэнфордские профили» . Profiles.stanford.edu . Проверено 12 июля 2019 г.

[1] «Профиль Майкла Фишбаха | Стэнфордские профили» . Profiles.stanford.edu . Проверено 12 июля 2019 г.

[2] «Сотрудники факультета | ЧЭМ-Г» . chemh.stanford.edu . Проверено 12 июля 2019 г.

[3] «Программа исследователей – Биохаб Чана Цукерберга» . Проверено 12 июля 2019 г.

[4] Фишбах М.А., Сеттлман Дж. Специфическая биохимическая инактивация онкогенных белков Ras нуклеозиддифосфаткиназой. Рак Рез. 15 июля 2003 г.;63(14):4089-94. ПМИД 12874011 .

[5] Фишбах М.А., Лин Х., Лю Д.Р., Уолш Коннектикут. Характеристика in vitro IroB, патоген-ассоциированной C-гликозилтрансферазы. Proc Natl Acad Sci US A. 2005, 18 января; 102 (3): 571-6. Электронная публикация 2004 г., 14 декабря. ПМИД 15598734 ; ПМК 545562 .

[6] Уолш, Коннектикут, Фишбах, Массачусетс. Натуральные продукты, версия 2.0: соединение генов с молекулами. J Am Chem Soc. 3 марта 2010 г.; 132(8): 2469-93. два : 10.1021/ja909118a . ПМИД 20121095 ; ПМЦ 2828520 .

[7] «Чан Цукерберг Biohub финансирует новые исследовательские усилия, инициативу по микробиому» . Центр новостей . 8 февраля 2017 года . Проверено 12 июля 2019 г.

[8] «Научно-консультативный совет – NGM Bio» . www.ngmbio.com . Архивировано из оригинала 20 июля 2018 г. Проверено 7 января 2016 г.

[9] «Команда – Революционные лекарства» . Revolutionmedicines.com .

[10] «Фишбах Групп – Дом» . fischbachgroup.org .

[11] Дония М.С., Фишбах М.А.. Малые молекулы микробиоты человека. Наука. 2015, 24 июля;349(6246):1254766. дои : 10.1126/science.1254766 . Epub, 23 июля 2015 г. Обзор. ПМИД 26206939 ; ПМК 4641445

[12] Дония М.С., Чимерманчич П., Шульце С.Дж., Виланд Браун LC, Мартин Дж., Митрева М., Кларди Дж., Линингтон Р.Г., Фишбах М.А.. Систематический анализ кластеров биосинтетических генов в микробиоме человека выявил общее семейство антибиотиков. Клетка. 11 сентября 2014 г.; 158(6): 1402-14. дои : 10.1016/j.cell.2014.08.032 . ПМИД 25215495 ; ПМК 4164201 .

[13] «Добыча антибиотиков прямо у нас под носом» . Нью-Йорк Таймс . 11 сентября 2014 г.

[14] Пак, Алиса (12 сентября 2014 г.). «Лекарства своими руками: скоро антибиотики можно будет делать из собственных бактерий» . Время . Проверено 26 апреля 2018 г.

[15] «Установите вора... Бактерии-спутники человечества — хорошее место для поиска новых лекарств» . Экономист . 20 сентября 2014 г. Проверено 26 апреля 2018 г.

[16] Виланд Браун LC, Пенаранда С., Кашьяп ПК, Уильямс Б.Б., Кларди Дж., Кроненберг М. , Зонненбург Дж.Л., Комсток Л.Е., Блюстоун Дж.А., Фишбах М.А. Производство α-галактозилцерамида видным представителем микробиоты кишечника человека. ПЛоС Биол. Июль 2013 г.;11(7):e1001610. дои : 10.1371/journal.pbio.1001610 . Epub 2013, 16 июля. ПМИД 23874157 ; ПМЦ 3712910 .

[17] Уильямс Б.Б., Ван Беншотен А.Х., Чимерманчич П., Дония М.С., Циммерманн М., Такетани М., Исихара А., Кашьяп ПК, Фрейзер Дж.С., Фишбах М.А.. Открытие и характеристика декарбоксилаз кишечной микробиоты, которые могут продуцировать нейромедиатор триптамин. Микроб-хозяин клетки. 8 октября 2014 г.; 16(4): 495-503. дои : 10.1016/j.chom.2014.09.001 . Epub, 25 сентября 2014 г. ПМИД 25263219 ; ПМК 4260654 .

[18] Девлин А.С., Фишбах М.А.. Путь биосинтеза ведущего класса желчных кислот, полученных из микробиоты. Nat Chem Biol. 11 сентября 2015 г.: 685–90. дои : 10.1038/nchembio.1864 . Epub, 20 июля 2015 г. ПМИД 26192599 ; ПМЦ 4543561 .

[19] Чимерманчич П., Медема М.Х., Клаесен Дж., Курита К., Виланд Браун LC, Мавромматис К., Пати А., Годфри П.А., Кёрсен М., Кларди Дж., Биррен Б.В., Такано Э., Сали А., Линингтон Р.Г., Фишбах М.А. Понимание вторичного метаболизма на основе глобального анализа кластеров биосинтетических генов прокариот. Клетка. 17 июля 2014 г.; 158(2): 412-21. дои : 10.1016/j.cell.2014.06.034 . ПМИД 25036635 ; ПМК 4123684 .

[20] Медема М.Х., Фишбах М.А.. Вычислительные подходы к открытию натуральных продуктов. Nat Chem Biol. Сентябрь 2015 г.;11(9):639-48. дои : 10.1038/nchembio.1884 . ПМИД 26284671 .

[21] «антиСМЭШ бактериальная версия» . antismash.вторичные метаболиты.org .

[22] «Профиль Элизабет Саттели | Стэнфордские профили» . Profiles.stanford.edu . Проверено 12 июля 2019 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

[ 17 ]

[ 18 ]

[ 19 ]

[ 20 ]

[ 21 ]

[ 22 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ
Национальный	Соединенные Штаты
академики	ДБЛП Google Академика ОРЦИД Скопус