Дуглас Х. Тернер
![]() |
Дуглас « Дуг » Х. Тернер — американский химик и профессор химии Рочестерского университета .
Дуглас Х. Тернер | |
---|---|
Веб-сайт | http://rna.chem.rochester.edu/ |
Ранний период жизни
[ редактировать ]Тернер вырос в Бруклине , Нью-Йорк.
Образование
[ редактировать ]Тернер учился в Гарвардском колледже , который с отличием окончил по химии и был назначен младшим лейтенантом армии США . Он работал в аспирантуре на химических факультетах Колумбийского университета и в Брукхейвенской национальной лаборатории , где работал с Джорджем Флинном и Норманом Сутиным над разработкой метода скачка температуры рамановского лазера для измерения кинетики в наносекундном масштабе времени. В этот период он также провел три месяца в Аннистоне, штат Алабама, пройдя базовый курс офицерского состава армейского химического корпуса. Решив, что наука ему нравится больше, чем война, он отказался от возможности продолжить службу в качестве действующего офицера и поступил в университет. из Калифорнии в Беркли, чтобы стать постдоком вместе с Игнасио Тиноко-младшим. Там он изобрел круговой дихроизм, обнаруживаемый флуоресценцией, для измерения оптической активности флуоресцентного компонента раствора.
Профессиональная жизнь и научные достижения
[ редактировать ]В 1975 году Тернер поступил на факультет химического факультета Рочестерского университета , где до сих пор является профессором. Тернеру также посчастливилось стать частью академической семьи Тома Чеха (Нобелевская премия по химии, 1989 г.) в течение двух лет творческого отпуска в Университете Колорадо в Боулдере. Тернеру необычайно повезло со своей академической семьей, состоящей из 8 постдоков, 49 студентов, получивших докторскую степень, и других его сотрудников. Вместе они открыли многие фундаментальные принципы, определяющие структуру РНК. [ 1 ] Эти принципы, иногда называемые «правилами Тёрнера», [ 2 ] используются во многих алгоритмах предсказания структуры РНК . Это помогло разработать методы прогнозирования структуры РНК по последовательности, а также взаимодействий РНК-РНК: например, связывание миРНК или миРНК с мишенью. Методы с использованием «Правил Тернера» широко используются биохимиками и биологами. [ 3 ] [ 4 ] В его собственной лаборатории эти методы были использованы для обнаружения потенциально важных с медицинской точки зрения структур РНК в вирусе гриппа. [ 5 ] РНК включая псевдоузел , который может играть роль в регуляции сплайсинга в 3'-сайте сплайсинга сегмента A вируса гриппа .
Недавно Тернер и его коллеги использовали с помощью ядерного магнитного резонанса и молекулярной динамики моделирование коротких РНК , чтобы проверить понимание зависимости от последовательности стэкинг-взаимодействий. [ 6 ] [ 7 ] Многое еще предстоит выяснить.
Статьи, соавтором которых является Тернер, цитировались более 20 000 раз (Google Scholar). Работа также была отмечена стипендиями Слоана и Гуггенхайма, избрана членом Американской ассоциации содействия развитию науки (AAAS), выбрана Американским химическим обществом в качестве лектора Гордона Хаммеса, непрерывное финансирование гранта НИЗ с 1976 г. 2019 г., соавторство более 250 статей. Вместе с Рышардом Кьержеком из Института биоорганической химии в Познани он разделил премию AAAS Польша-США в области науки в 2016 году. В 2023 году Тернер получил награду «Выдающийся научный наставник» Общества РНК / Лабораторного издательства Колд-Спринг-Харбор. [ 8 ]
Тернер также служил научному сообществу, часто преподавая курс химии на первом курсе бакалавриата и курс биофизической химии для аспирантов, будучи членом нескольких исследовательских секций Национального института здравоохранения, консультативного совета Института биоорганической химии в Познани и редакционного совета журнала Биофизический журнал. Он также был сопредседателем Гордонской конференции по нуклеиновым кислотам.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Тернер, Д.Х.; Н Сугимото; С.М. Фрейер (1988). «Прогнозирование структуры РНК». Ежегодный обзор биофизики и биофизической химии . 17 (1): 167–192. дои : 10.1146/annurev.bb.17.060188.001123 . ISSN 0883-9182 . ПМИД 2456074 .
- ^ Тернер, Д.Х.; Мэтьюз, Д.Х. (2009). «NNDB: база данных параметров ближайшего соседа для прогнозирования стабильности вторичной структуры нуклеиновой кислоты» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (Проблема с базой данных): D280–D282. дои : 10.1093/nar/gkp892 . ПМК 2808915 . ПМИД 19880381 .
- ^ Доту, И.; Лоренц, Вашингтон; Ван Хентенрик, П.; Клот, П. (2009). «Вычисление путей сворачивания между вторичными структурами РНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 38 (5): 1711–1722. дои : 10.1093/нар/gkp1054 . ПМЦ 2836545 . ПМИД 20044352 .
- ^ Сетин, М.Г.; Мэтьюз, Д.Х. (2012). «Прогнозирование структуры РНК: обзор методов». Бактериальная регуляторная РНК . Методы молекулярной биологии. Том. 905. стр. 99–122. дои : 10.1007/978-1-61779-949-5_8 . ISBN 978-1-61779-948-8 . ПМИД 22736001 .
- ^ Мосс, Западная Нью-Йорк; Прайор, Сан-Франциско; Тернер, Д.Х. (2011). «Идентификация потенциально консервативной вторичной структуры РНК во всех кодирующих областях вируса гриппа А» . РНК . 17 (6): 991–1011. дои : 10.1261/rna.2619511 . ПМК 3096049 . ПМИД 21536710 .
- ^ Кондон, Дэвид Э.; Кеннеди, Скотт Д.; Морт, Брендан С.; Киржек, Рышард; Йылдырым, Ильяс; Тернер, Дуглас Х. (9 июня 2015 г.). «Стекирование в РНК: ЯМР четырех тетрамеров, эталон молекулярной динамики» . Журнал химической теории и вычислений . 11 (6): 2729–2742. дои : 10.1021/ct501025q . ISSN 1549-9618 . ПМЦ 4463549 . ПМИД 26082675 .
- ^ Чжао, Цзяньбо; Кеннеди, Скотт Д.; Бергер, Кайл Д.; Тернер, Дуглас Х. (10 марта 2020 г.). «Ядерный магнитный резонанс одноцепочечных РНК и ДНК CAAU и UCAAUC как критерии для моделирования молекулярной динамики». Журнал химической теории и вычислений . 16 (3): 1968–1984. дои : 10.1021/acs.jctc.9b00912 . ISSN 1549-9618 . ПМИД 31904966 . S2CID 210043354 .
- ^ https://www2.rnasociety.org/wp-content/uploads/2023/05/RNA-2023-Prog-Book.pdf .