МассТаг-ПЦР

MassTag PCR — модификация ПЦР , основанная на масс-спектрометрическом обнаружении конечного продукта. Эту технологию разработали исследователи из Школы общественного здравоохранения Мейлмана Колумбийского университета и Колумбийского центра генома. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Принципы

Как и в обычной ПЦР, в MassTag-PCR используются пары праймеров . Разница заключается в том, что праймеры, используемые для ПЦР MassTag, помечены молекулами известных масс или MassCodes. Вместо одной пары праймеров в этой технологии используется несколько праймеров, что делает ее мультиплексной системой. В отличие от традиционной системы Мультиплексной ПЦР, в ПЦР MassTag можно использовать более 15 пар праймеров. Если присутствует ДНК любого агента панели праймеров, она будет амплифицирована. Каждый усиленный продукт будет иметь свои определенные масскоды. Затем продукт ПЦР очищают от несвязавшихся праймеров, dNTP, ферментов и других примесей. Наконец, очищенные продукты ПЦР подвергают воздействию УФ- излучения, поскольку химическая связь между нуклеиновыми кислотами и праймерами фотолабильна . Поскольку масскоды высвобождаются из продуктов ПЦР, их обнаруживают с помощью масс-спектрометра. Наличие конкретного MassCode указывает на наличие конкретного патогена. ^{[ 1 ]}

Приложения

Было обнаружено, что этот метод позволяет обнаружить ранее не охарактеризованную кладу риновируса . ^{[ 3 ]} MassTag ПЦР является более комплексным и чувствительным методом диагностики, CII удалось определить причину этого заболевания в 26 из 79 ранее неизвестных случаев. ПЦР MassTag продемонстрировала свою трехстороннюю ценность в качестве инструмента надзора, выявления вспышек и эпидемиологии .

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б Бриз, Томас; Паласиос, Густаво; Кокорис, Марк; Джабадо, Омар; Лю, Чжицян; Ренвик, Нил; Капур, Вишал; Касас, Инмакулада; Посо, Франциско; Лимбергер, Рон; Перес-Брена, Пилар; Цзюй, Цзинъюэ; Липкин, В. Ян (2005). «Диагностическая система для быстрого и чувствительного дифференциального обнаружения возбудителей» . Новые инфекционные заболевания . 11 (2): 310–313. дои : 10.3201/eid1102.040492 . ISSN 1080-6040 . ПМК 3320438 . ПМИД 15752453 .
^ Ларкин, Мэрилинн (2005). «Технологии и здравоохранение» . Ланцет инфекционных заболеваний . 5 (9): 542. doi : 10.1016/s1473-3099(05)70211-5 . ISSN 1473-3099 .
^ Домингес, Сэмюэл Р.; и др. (октябрь 2008 г.). «Мультиплексная MassTag-ПЦР на респираторные патогены в смывах из носоглотки у детей, отрицательная по результатам обычных диагностических тестов, показывает высокую распространенность вирусов, принадлежащих к недавно обнаруженной кладе риновирусов» . Журнал клинической вирусологии . 43 (2): 219–222. дои : 10.1016/j.jcv.2008.06.007 . ПМК 2603178 . ПМИД 18674964 .

[:0-1] Перейти обратно: ^а ^б Бриз, Томас; Паласиос, Густаво; Кокорис, Марк; Джабадо, Омар; Лю, Чжицян; Ренвик, Нил; Капур, Вишал; Касас, Инмакулада; Посо, Франциско; Лимбергер, Рон; Перес-Брена, Пилар; Цзюй, Цзинъюэ; Липкин, В. Ян (2005). «Диагностическая система для быстрого и чувствительного дифференциального обнаружения возбудителей» . Новые инфекционные заболевания . 11 (2): 310–313. дои : 10.3201/eid1102.040492 . ISSN 1080-6040 . ПМК 3320438 . ПМИД 15752453 .

[2] Ларкин, Мэрилинн (2005). «Технологии и здравоохранение» . Ланцет инфекционных заболеваний . 5 (9): 542. doi : 10.1016/s1473-3099(05)70211-5 . ISSN 1473-3099 .

[3] Домингес, Сэмюэл Р.; и др. (октябрь 2008 г.). «Мультиплексная MassTag-ПЦР на респираторные патогены в смывах из носоглотки у детей, отрицательная по результатам обычных диагностических тестов, показывает высокую распространенность вирусов, принадлежащих к недавно обнаруженной кладе риновирусов» . Журнал клинической вирусологии . 43 (2): 219–222. дои : 10.1016/j.jcv.2008.06.007 . ПМК 2603178 . ПМИД 18674964 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]