Полипиримидиновый тракт

Незаменимый компонент сплайсосомы U2AF связан с коротким полипиримидиновым фрагментом РНК.

Полипиримидиновый тракт представляет собой область пре-мессенджерной РНК (мРНК), которая способствует сборке сплайсосомы , белкового комплекса, специализированного для осуществления сплайсинга РНК в процессе посттранскрипционной модификации . Эта область богата пиримидиновыми нуклеотидами , особенно урацилом , и обычно имеет длину 15–20 пар оснований и расположена примерно за 5–40 пар оснований перед 3'-концом интрона, подлежащего сплайсингу. ^{[ 1 ]}

Ряд белковых факторов связываются или ассоциированы с полипиримидиновым трактом, включая компонент сплайсосомы U2AF и белок, связывающий полипиримидиновый тракт (PTB), который играет регуляторную роль в альтернативном сплайсинге . Основная функция PTB заключается в замалчивании экзона обычно сплайсированная со зрелой мРНК, вместо этого исключается, что приводит к экспрессии изоформы белка , при котором конкретная область экзона , , который кодирует мРНК . Поскольку PTB повсеместно экспрессируется у многих высших эукариот , считается, что он подавляет включение «слабых» экзонов с плохо определенными сайтами сплайсинга . ^{[ 2 ]} Однако связывания PTB недостаточно для подавления «надежных» экзонов. ^{[ 3 ]}

Подавление или отбор экзонов имеет решающее значение для правильной экспрессии тканеспецифичных изоформ. Например, гладкие и скелетные мышцы экспрессируют альтернативные изоформы, отличающиеся взаимоисключающим выбором экзонов альфа- тропомиозина . ^{[ 4 ]}

Ссылки

^ Лодиш Х., Берк А., Мацудайра П., Кайзер К.А., Кригер М., Скотт М.П., Зипурски С.Л., Дарнелл Дж. (2004). Молекулярно-клеточная биология. WH Фриман: Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. 5-е изд.
^ Вагнер Э.Дж., Гарсиа-Бланко, Массачусетс. (2001). Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, препятствует определению экзонов. Мол. Cell Biol 21(10):3281-3288.
^ Гудинг С., Робертс Г.К., Смит К.В. (1998). Роль ингибирующего пиримидинового элемента и белка, связывающего полипиримидиновый тракт, в репрессии регулируемого экзона альфа-тропомиозина. РНК 4:85-100.
^ Гудинг С., Робертс Г.К., Моро Г., Надаль-Жинар Б., Смит К.В. (1994). Специфическое для плавных мышц переключение взаимоисключающего выбора экзонов альфа-тропомиозина путем специфического ингибирования сильного экзона по умолчанию. ЭМБО J 13(16):3861-72.

[Lodish-1] Лодиш Х., Берк А., Мацудайра П., Кайзер К.А., Кригер М., Скотт М.П., Зипурски С.Л., Дарнелл Дж. (2004). Молекулярно-клеточная биология. WH Фриман: Нью-Йорк, штат Нью-Йорк. 5-е изд.

[Wagner-2] Вагнер Э.Дж., Гарсиа-Бланко, Массачусетс. (2001). Белок, связывающий полипиримидиновый тракт, препятствует определению экзонов. Мол. Cell Biol 21(10):3281-3288.

[Gooding-3] Гудинг С., Робертс Г.К., Смит К.В. (1998). Роль ингибирующего пиримидинового элемента и белка, связывающего полипиримидиновый тракт, в репрессии регулируемого экзона альфа-тропомиозина. РНК 4:85-100.

[Gooding2-4] Гудинг С., Робертс Г.К., Моро Г., Надаль-Жинар Б., Смит К.В. (1994). Специфическое для плавных мышц переключение взаимоисключающего выбора экзонов альфа-тропомиозина путем специфического ингибирования сильного экзона по умолчанию. ЭМБО J 13(16):3861-72.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]