Собемовирус

Собемовирус
	Геном вируса мозаики Сесбании
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Область :	Рибовирия
Королевство:	Орторнавиры
Тип:	Писувирикота
Сорт:	Пизонивирицеты
Заказ:	Собелиевиралес
Семья:	Солемовирусиды
Род:	Собемовирус

Собемовирус — это род безоболочковых РНК-вирусов с положительной цепью , которые заражают растения. Растения служат естественными хозяевами. В этом роде 21 вид. К заболеваниям, связанным с этим родом, относятся: мозаика и крапчатость. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Структура

Вирусы Собемовируса не имеют оболочки, имеют икосаэдрическую геометрию и симметрию T = 3. Диаметр около 30 нм. ^{[ 1 ]}

Род	Структура	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Собемовирус	икосаэдрический	Т=3	Без конверта	Линейный	Однодольный

Геном

Геном собемовирусов на примере вируса мозаики Sesbania.

Геном представляет собой единый фрагмент линейной одноцепочечной РНК 4100–5700 нуклеотидов . с положительным смыслом длиной ^{[ 3 ]} Геном кодирует пять открытых рамок считывания: ORF1, ORF 2a и 2b, ORF3 и ORFx. ^{[ 4 ]}

ORF1 кодирует P1, который играет роль в подавлении молчания и движении вируса.

ORF 2a и 2b кодируют репликационные полипротеины P2a и P2ab. Трансляция ORF2a из геномной РНК зависит от механизма «утечки» сканирования. ^{[ нужна ссылка ]}

ORF3 кодирует белок оболочки. ^{[ нужна ссылка ]}

ORFx консервативен во всех собемовирусах. Он перекрывает 5'-конец ORF2a в рамке считывания +2, а также простирается на некоторое расстояние выше ORF2a. У него отсутствует инициирующий кодон AUG, и его экспрессия, по прогнозам, зависит от инициации низкого уровня на почти родственных кодонах, не относящихся к AUG, таких как CUG, со стороны части рибосом, которые сканируют область между инициирующими кодонами ORF1 и ORF2a. Его функция неизвестна, но, по-видимому, он необходим для заражения. ^{[ нужна ссылка ]}

Таксономия

Род включает в себя следующие виды: ^{[ 2 ]}

Жизненный цикл

Репликация вируса цитоплазматическая. Вход в клетку-хозяина достигается путем проникновения в клетку-хозяина. Репликация соответствует модели репликации вируса с положительной многоцепочечной РНК. Транскрипция вируса с положительной цепью РНК - это метод транскрипции. Трансляция происходит за счет «протекающего» сканирования и сдвига рамки рибосомы -1. Вирус покидает клетку-хозяина путем перемещения вируса по канальцам. Растения служат естественным хозяином. Вирус передается через вектор (CFMV: насекомые). Пути передачи трансмиссивные и семенные. ^{[ 1 ]}

Род	Сведения о хосте	Тканевой тропизм	Детали входа	Подробности выпуска	Сайт репликации	Монтажный участок	Передача инфекции
Собемовирус	Растения	Никто	Проникновение	Вирусное движение	Цитоплазма	Цитоплазма	Вектор, семя

Ссылки

^ Перейти обратно: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.
^ Перейти обратно: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2023 года . Проверено 10 августа 2023 г.
^ Индекс вирусов - Собемовирус (2006). В: ICTVdB — Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, C (ред), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США. ^{[ нужна страница ]}
^ Линг, Роджер; Пейт, Эдриенн Э; Карр, Джон П; Ферт, Эндрю Э (2013). «Основная пятая кодирующая ORF в собемовирусах» . Вирусология . 446 (1–2): 397–408. дои : 10.1016/j.virol.2013.05.033 . ПМЦ 3791421 . ПМИД 23830075 .

Внешние ссылки

[ViralZone-1] Перейти обратно: ^а ^б ^с «Вирусная зона» . ЭксПАСи . Проверено 15 июня 2015 г.

[ICTV-2] Перейти обратно: ^а ^б «Таксономия вирусов: выпуск 2022 г.» . Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Март 2023 года . Проверено 10 августа 2023 г.

[3] Индекс вирусов - Собемовирус (2006). В: ICTVdB — Универсальная база данных вирусов, версия 4. Бюхен-Осмонд, C (ред), Колумбийский университет, Нью-Йорк, США. ^{[ нужна страница ]}

[Ling2013-4] Линг, Роджер; Пейт, Эдриенн Э; Карр, Джон П; Ферт, Эндрю Э (2013). «Основная пятая кодирующая ORF в собемовирусах» . Вирусология . 446 (1–2): 397–408. дои : 10.1016/j.virol.2013.05.033 . ПМЦ 3791421 . ПМИД 23830075 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]