Вирус желтой крапчатости риса
Вирус желтой крапчатости риса | |
---|---|
Классификация вирусов ![]() | |
(без рейтинга): | Вирус |
Область : | Рибовирия |
Королевство: | Орторнавиры |
Тип: | Писувирикота |
Сорт: | Пизонивирицеты |
Заказ: | Собелиевиралес |
Семья: | Солемовирусиды |
Род: | Собемовирус |
Разновидность: | Вирус желтой крапчатости риса
|
Синонимы | |
собемовирус рисовой желтой крапчатости, бледно-желтая крапчатость |
Вирус желтой крапчатости риса ( RYMV ) является фитопатогенным вирусом , принадлежащим к роду Sobemovirus . Геном представляет собой одноцепочечную РНК с положительным смыслом длиной 4450 нуклеотидов и не полиаденилирован . [ 1 ] Впервые об этом сообщили в Кении в 1966 году. [ 2 ] в одной из первых схем интенсификации выращивания в Африке, благодаря связи RYMV с интенсификацией, [ П 1 ] но анализ ДНК его эволюционной истории показывает, что он развился в Восточной Африке в 19 веке. [ Т 1 ] [ П 2 ] [ П 3 ] С момента его обнаружения в Кении он был обнаружен во многих странах Африки к югу от Сахары . [ 3 ] Он также был обнаружен в Центральной Африке , но за пределами континента его еще не видели. [ 4 ] Геномная организация RYMV наиболее близка к организации собемовируса ежа пятнистой . [ 4 ] RYMV — одна из наиболее изученных фитовирусных патосистем . [ Т 2 ] [ 5 ]
Вирусология
[ редактировать ]Структура
[ редактировать ]RYMV представляет собой одноцепочечный РНК-вирус с положительным смыслом . Существует высокий уровень генетического разнообразия нуклеотидов RYMV, который составляет примерно 14%. [ 6 ] RYMV — собемовирус . [ 7 ]
Воздействие на растения
[ редактировать ]RYMV оказывает огромное влияние на посевы риса. полосатость, крапчатость , изменение цвета и деформация листьев, а также гибель зараженных молодых растений. Типичными признаками инфекции RYMV являются [ 2 ] [ 8 ] Потери урожая могут составлять 25–100%. [ 9 ] Считается, что RYMV начал распространяться с момента завоза экзотического риса ( Oryza sativa ) из Азии на африканский континент. [ 3 ] Местные сорта риса, произрастающие в Африке, как правило, более устойчивы к вирусу. [ 3 ] Естественным хозяином вируса обычно остаются растения трибы Oryzeae . [ 4 ] Вирус поражает лишь несколько видов растений, включая некоторые виды риса и дикие травы. [ 10 ] Единственный способ подтвердить наличие у растений RYMV — провести серологический тест . [ 1 ]
Симптомы заражения
[ редактировать ]Более молодые саженцы (стадия роста 3–4 листьев) являются наиболее восприимчивыми: у более старых растений обычно наблюдаются менее очевидные симптомы на листьях и меньшая задержка роста, чем у младших братьев и сестер. Симптомы первоначально проявляются в виде желто-зеленых линейных пятен у основания самых молодых листьев. [ 11 ] По мере роста инфекции пятна расширяются параллельно жилкам листьев и выглядят как желтые или оранжевые полосы; они могут различаться по ширине, но могут быть непрерывными до 10 см. [ 11 ]
Пораженные растения на ранней стадии сбора урожая имеют желтые или оранжевые листья. В тяжелых случаях листья скручиваются и засыхают. Другими симптомами являются задержка роста, снижение кущения и плохое наполнение метелки. Это приводит к низкой продуктивности семян или их отсутствию и низкому качеству зерна. [ 9 ]
Передача инфекции
[ редактировать ]РЫМВ находится в рисовой шелухе растений. [ 12 ] Вирус передается животными, при контакте листьев с ветром и абиотическими факторами (например, поливной водой). [ 8 ] Его могут передать листоеды или крысы. [ 4 ] или от растения к растению через остатки листьев, пустые колоски риса, переплетающиеся корни, контакт листьев, рисовую стерню, загрязненные руки и от близко расположенных растений. [ 12 ] Этот вирус не передается семенами и нематодами . Было обнаружено, что длиннорогие кузнечики ( Conocephalus ) являются возможными переносчиками RYMV в Уганде. [ 8 ]
Адаптивность и устойчивость
[ редактировать ]Некоторые сорта риса демонстрируют высокую устойчивость к RYMV, характеризующуюся отсутствием симптомов и обнаружением вируса. Наследование является этой высокой устойчивости рецессивным . Ген устойчивости RYMV1 был идентифицирован как ген eIF(iso)4G . четыре к rymv1 устойчивости аллеля Охарактеризованы : один у O. sativa ( rymv1-2 ) и три у O. glaberrima сортов ( rymv1-3 , rymv1-4, rymv1-5 ). [ 13 ] Устойчивость rymv1–3 обусловлена делецией кодонов 322–324 в том же домене eIF(iso)4G . [ 14 ]
Управление
[ редактировать ]Профилактика
[ редактировать ]Имеются устойчивые и толерантные сорта. [ 9 ] [ 15 ] [ 16 ]
Использование питомников, которые ранее не были заражены, или прямой посев в поле также может помочь предотвратить распространение вируса. [ 17 ]
CABI рекомендует сажать урожай как можно раньше, чтобы избежать пикового периода распространения насекомых-переносчиков вируса. Кроме того, синхронизация посева на разных полях может предотвратить распространение вируса на более молодые культуры. [ 11 ]
Поддержание сорняков для борьбы с другими хозяевами вируса и расчистка кустов вокруг полей для контроля мест размножения насекомых-переносчиков также могут предотвратить распространение RYMV. [ 15 ] [ 17 ] [ 18 ]
Санитарные процедуры могут снизить распространение RYMV. CABI рекомендует очищать от сорняков оросительные каналы и вокруг рисовых полей, особенно в межсезонье, чтобы удалить вирус и его насекомых-переносчиков. Устранит вирус и насекомые-переносчики. [ 11 ] Очистка сельскохозяйственной техники может уменьшить распространение и предотвратить механическое распространение. Это также относится к очистке любой сельскохозяйственной техники после каждого использования. [ 11 ] [ 17 ]
Контроль
[ редактировать ]RYMV полностью уничтожает восприимчивые сорта; в случае обнаружения удаление зараженных растений и их уничтожение может предотвратить дальнейшее распространение. CABI также рекомендовал сократить внесение удобрений на зараженные растения. [ 11 ]
Не существует химических методов борьбы, которые могли бы напрямую остановить распространение RYMV. Однако в некоторых странах имеются инсектициды для борьбы с переносчиками вируса; [ 9 ] [ 18 ] Подходящие химикаты различаются в зависимости от руководящих принципов конкретной страны.
Эпидемиология
[ редактировать ]По состоянию на 2019 год [update] RYMV по-прежнему считается «новой» болезнью, поскольку в будущем все еще продолжается и ожидается значительное расширение ареала. [ 5 ]
Источники
[ редактировать ] В эту статью включен текст из бесплатного контента . Лицензия CC-BY-SA ( лицензионное заявление/разрешение ). Текст взят из информационных бюллетеней Plantwise для фермеров: Устойчивый рис к вирусу желтой пятнистости риса , Джубилант Дж. Н. Мванги, Эдит Д. Киджа Мариам И. Мзирай, CABI.
В эту статью включен текст из бесплатного контента . Лицензия CC-BY-SA ( лицензионное заявление/разрешение ). Текст взят из PMDG: Зеленый список — вирус желтой пятнистости риса , Plantwise, CABI.
В эту статью включен текст из бесплатного контента . Лицензия CC-BY-SA ( лицензионное заявление/разрешение ). Текст взят из информационных бюллетеней Plantwise для фермеров: Рисовая желтая пятнистость (Икиведжуру) , Джоэль Каюга, Жермен Нкима, CABI.
В эту статью включен текст из бесплатного контента . Лицензия CC-BY-SA ( лицензионное заявление/разрешение ). Текст взят из PMDG: Вирус желтой пятнистости риса – Руанда , Дж. Златоуст Мухигирва и Жермен Нкима, CABI.
В эту статью включен текст из бесплатного контента . Лицензия CC-BY-SA ( лицензионное заявление/разрешение ). Текст взят из PMDG: Вирус желтой пятнистости риса – Малави , Чиласа С.Л., ДЖИГ Масангва, Шайбу Я.А., CABI.
В эту статью включен текст из бесплатного контента . Лицензия CC-BY-SA ( лицензионное заявление/разрешение ). Текст взят из PMDG: Вирус желтой пятнистости риса - Гана , Э. Мозес, ФК Бренту и Ф.А. Ньярко, CABI.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б Ясси, Миннесота; Ритценталер, К.; Бругиду, К.; Фоке, К.; Бичи, Р.Н. (1 февраля 1994 г.). «Нуклеотидная последовательность и характеристика генома РНК вируса желтой крапчатости риса». Журнал общей вирусологии . 75 (2): 249–257. дои : 10.1099/0022-1317-75-2-249 .
- ^ Перейти обратно: а б Баккер В. (1974). Характеристика и экологические аспекты вируса желтой крапчатости риса в Кении (докторская диссертация). Вагенингенский университет.
- ^ Перейти обратно: а б с Або, Мэн; Сы, А.А.; Алегбеджо, доктор медицины (4 декабря 1997 г.). «Вирус желтой пятнистости риса (RYMV) в Африке: эволюция, распространение, экономическое значение для стратегий устойчивого производства риса и управления им». Журнал устойчивого сельского хозяйства . 11 (2–3): 85–111. Бибкод : 1997JSusA..11b..85A . дои : 10.1300/J064v11n02_08 .
- ^ Перейти обратно: а б с д Фаржетт, Денис; Пинель, Аньес; Абубакар, Закия; Траоре, Умар; Бругиду, Кристоф; Фатогома, Сорхо; Эбрар, Эжени; Шуази, Марк; Сере, Якуба; Фоке, Клод; Конате, Гнисса (апрель 2004 г.). «Выводы об эволюционной истории вируса желтой пятнистости риса на основе геномных, филогенетических и филогеографических исследований» . Журнал вирусологии . 78 (7): 3252–3261. doi : 10.1128/JVI.78.7.3252-3261.2004 . ПМК 371063 . ПМИД 15016846 .
- ^ Перейти обратно: а б Лефевр, Пьер; Мартин, Даррен П.; Елена, Сантьяго Ф.; Шепард, Дионн Н.; Руманьяк, Филипп; Варсани, Арвинд (16 июля 2019 г.). «Эволюция и экология вирусов растений». Обзоры природы Микробиология . 17 (10). Исследования природы : 632–644. дои : 10.1038/s41579-019-0232-3 . ISSN 1740-1526 . ПМИД 31312033 . S2CID 197402034 . п. 639:
Ключевыми примерами вирусов, ответственных за хорошо изученные новые заболевания, являются... собемовирусы, такие как вирус желтой крапчатости риса. 106 .
- ^ Абубакар, З. (1 марта 2003 г.). «Филогеография вируса желтой крапчатости риса в Африке» . Журнал общей вирусологии . 84 (3): 733–743. дои : 10.1099/vir.0.18759-0 . ISSN 0022-1317 . ПМИД 12604826 .
- ^ Ясси, Миннесота; Ритценталер, К.; Бругиду, К.; Фоке, К.; Бичи, Р.Н. (февраль 1994 г.). «Нуклеотидная последовательность и характеристика генома РНК вируса желтой крапчатости риса» . Журнал общей вирусологии . 75 (Часть 2) (2): 249–257. дои : 10.1099/0022-1317-75-2-249 . ISSN 0022-1317 . ПМИД 8113745 .
- ^ Перейти обратно: а б с Уке, Аяка; Тибаньендела, Насвиру; Икеда, Рёичи; Фудзие, Азуса; Нацуаки, Кейко Тереза (30 декабря 2014 г.). «Пути передачи и стабильность вируса желтой крапчатости риса» . Журнал исследований в области защиты растений . 54 (4): 363–366. дои : 10.2478/jppr-2014-0054 . ISSN 1899-007X .
- ^ Перейти обратно: а б с д Киджа, Эд; Мзирай, Мичиган (2016). «Банк знаний Plantwise | Устойчивый рис к вирусу желтой крапчатости риса» . Банк знаний Plantwiseplus . Информационные бюллетени для фермеров. дои : 10.1079/pwkb.20147801019 . Проверено 22 мая 2020 г.
- ^ Каньека, З.И.; Сангу, Э; Фаргетт, Д; Панель-Гальзи, А; Хербрард, Э. (2007). «Распространение и разнообразие местных штаммов вируса желтой подвижности риса в Танзании» (PDF) . Африканский журнал растениеводства . hdl : 1807/47429 .
- ^ Перейти обратно: а б с д и ж «Банк знаний растений | Желтая пятнистость риса» . Банк знаний Plantwiseplus . Руководства по принятию решений по борьбе с вредителями. 2018. дои : 10.1079/pwkb.20167800983 . Проверено 22 мая 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б Або, Мэн; Алегбеджо, доктор медицины; Сы, А.А.; Мисари, С.М. (27 ноября 2000 г.). «Обзор путей передачи, растений-хозяев и методов обнаружения вируса желтой крапчатости риса». Журнал устойчивого сельского хозяйства . 17 (1): 19–36. Бибкод : 2000JSusA..17a..19A . дои : 10.1300/j064v17n01_04 . ISSN 1044-0046 . S2CID 83755820 .
- ^ Пуликар, Нильс; Пинель-Гальци, Аньес; Траоре, Умар; Виньоль, Флоренция; Гескьер, Ален; Конате, Гнисса; Эбрар, Эжени; Фаржетт, Денис (26 января 2012 г.). «Исторические обстоятельства модулируют адаптивность вируса желтой пятнистости риса» . ПЛОС Патогены . 8 (1): e1002482. дои : 10.1371/journal.ppat.1002482 . ISSN 1553-7374 . ПМК 3266926 . ПМИД 22291591 . *
Материал был скопирован из этого источника, доступного по лицензии Creative Commons.
- ^ Траоре, Умар; Пинель-Гальци, Агнес; Исаак, Сули; Пуликар, Нильс; Ариби, Джамель; Аке, Северин; Гескьер, Ален; Сере, Джейкоб; Конате, Гнисса; Хебрард, Евгения; Фаржетт, Денис (декабрь 2010 г.). «Адаптация вируса желтой крапчатости риса к устойчивости риса, опосредованной eIF(iso)4G». Вирусология . 408 (1): 103–108. дои : 10.1016/j.virol.2010.09.007 .
- ^ Перейти обратно: а б Каджуга, Дж.; Нкима, Г. (2016). «Банк знаний растений | Рисовая желтая крапчатость (Икиведжуру)» . Банк знаний Plantwiseplus . Информационные бюллетени для фермеров. дои : 10.1079/pwkb.20127801765 . Проверено 24 мая 2020 г.
- ^ Мухигирва, JC; Нкима, Г. (2018). «Банк знаний растений | Вирус желтой пятнистости риса (RYMV) - Руанда» . Банк знаний Plantwiseplus . Руководства по принятию решений по борьбе с вредителями. дои : 10.1079/pwkb.20147801479 . Проверено 24 мая 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б с Чиласа, СР; Масангва, ДИГ; Шайбу, Ю.А. (2018). «Банк знаний Plantwise | Болезнь желтой крапчатости риса - Малави» . Банк знаний Plantwiseplus . Руководства по принятию решений по борьбе с вредителями. дои : 10.1079/pwkb.20177800434 . Проверено 24 мая 2020 г.
- ^ Перейти обратно: а б Моисей, Э.; Бренту, ФК; Ньярко, ФА (2018). «Банк знаний Plantwise | Желтая пятнистость риса - Гана» . Банк знаний Plantwiseplus . Руководства по принятию решений по борьбе с вредителями. дои : 10.1079/pwkb.20167800971 . Проверено 24 мая 2020 г.
- Пинель-Гальци, Аньес; Траоре, Умар; Сере, Якуба; Эбрар, Эжени; Фаржетт, Денис (2015). «Биогеография возникновения вируса: вирус желтой крапчатости риса на примере». Современное мнение в вирусологии . 10 . Эльзевир : 7–13. дои : 10.1016/j.coviro.2014.12.002 . ISSN 1879-6257 . ПМИД 25544357 . S2CID 45136868 .
- ^ с. 7, «RYMV был впервые обнаружен в 1966 году недалеко от Кисуму в Кении вдоль северо-восточного берега озера Виктория [21]. Это сообщение совпало с разработкой одной из первых крупных схем интенсивного производства риса в Африке. С тех пор большинство эпидемий были связаны с интенсификацией выращивания риса».
- ^ Аннотация: «В Восточной Африке RYMV возник в 19 в. й столетия после интенсификации выращивания риса вдоль побережья Индийского океана, а затем распространился вглубь страны одновременно с интродукцией риса».
- ^ с. 9: «Характер генетического разнообразия RYMV интерпретируется как результат сопутствующей диверсификации и распространения вируса из Восточной в Западную Африку, начиная с 19-го века [19]. Здесь показано, что при более мелком масштабе пространственного разрешения географическое распространение штаммов сформировалось под влиянием истории выращивания риса в Африке».
- Траоре, О.; Пинель-Гальци, А.; Сорхо, Ф.; Сарра, С.; Ракотомалала, М.; Сангу, Э.; Каньека, З.; Сере, Ю.; Конате, Г.; Фаргетт, Д. (2009). «Переоценка эпидемиологии вируса желтой крапчатости риса после недавних достижений в полевых и молекулярных исследованиях». Вирусные исследования . 141 (2). Эльзевир : 258–267. doi : 10.1016/j.virusres.2009.01.011 . ISSN 0168-1702 . ПМИД 19195488 . S2CID 25049549 .
- ^ Аннотация: «Диверсификация и распространение RYMV сопровождались расширением выращивания риса в Африке с 19 века».
- ^ с. 258-9: «Патосистема RYMV — риса — одна из немногих патосистем растительных вирусов, подвергнутых детальным исследованиям, включающим как полевые, так и молекулярные эпидемиологические исследования».