ИМГТ
| Содержание | |
|---|---|
| Описание | Нуклеиновые последовательности, аминокислоты, аннотации и инструменты, связанные с адаптивной иммунной системой. |
| Организмы | Позвоночные |
| Дата выпуска | 1989 год |
| Доступ | |
| Веб-сайт | ИМГТ |
IMGT или международная информационная система ImMunoGeneTics представляет собой набор баз данных и ресурсов для иммуноинформатики , в частности последовательностей генов V, D, J и C , а также предоставляет другие инструменты и данные, связанные с адаптивной иммунной системой . [1] IMGT/LIGM-DB, первая и по-прежнему крупнейшая база данных, размещенная в рамках IMGT, содержит эталонные нуклеотидные последовательности для молекул рецепторов Т-клеток и иммуноглобулинов 360 видов по состоянию на 2023 год. [2] Эти гены кодируют белки, составляющие основу адаптивного иммунитета, обеспечивающего высокоспецифичное распознавание и запоминание патогенов.
История
[ редактировать ]
IMGT была основана в июне 1989 года Мари-Поль Лефран , иммунологом, работающим в Университете Монпелье . Проект был представлен на 10-м семинаре по картированию генома человека и привел к признанию регионов V, D, J и C как генов. [3] Первым созданным ресурсом был IMGT/LIGM-DB, эталон нуклеотидных последовательностей рецептора Т-клеток и иммуноглобулина человека, а затем и видов позвоночных. IMGT был создан под эгидой Молекулярной лаборатории иммуногенетики Университета Монпелье, а также Национального центра научных исследований Франции (CNRS).
Поскольку и рецепторы Т-клеток, и молекулы иммуноглобулинов строятся в процессе рекомбинации нуклеотидных последовательностей, аннотация областей строительных блоков и их роль в геноме уникальны. Для стандартизации терминологии и ссылок в 1992 году был создан IMGT-NC, признанный Международным союзом иммунологических обществ в качестве номенклатурного подкомитета. [4] Другие инструменты включают IMGT/Collier-de-Perles, метод двумерного представления аминокислотных последовательностей рецепторов, и IMGT/mAb-DB, базу данных моноклональных антител . База данных IPD-IMGT/HLA, которая в настоящее время поддерживается Группой информатики HLA , является основным справочником по HLA человека, частично созданным IMGT. [5] В 2003 году она была объединена с базой данных иммунополиморфизма и образовала текущий справочник.
С 2015 года ИМГТ возглавляет София Коссида. [6]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Лефранк, Мари-Поль (2014). «Гены иммуноглобулинов и рецепторов Т-клеток: IMGT®, рождение и развитие иммуноинформатики» . Границы в иммунологии . 5 (22): 22. дои : 10.3389/fimmu.2014.00022 . ПМЦ 3913909 . ПМИД 24600447 .
- ^ «ИМГТ» . Архивировано из оригинала 3 января 2023 года . Проверено 12 января 2023 г.
- ^ Лефранк, Мари-Поль; Лефран, Жерар (2019). «IMGT® и 30 лет иммуноинформатических исследований структуры и функций доменов антител V и C» . Антитела . 8 (2): 29. дои : 10.3390/antib8020029 . ПМК 6640715 . ПМИД 31544835 .
- ^ Подкомитет номенклатуры ВОЗ-IUIS по обозначению TCR (1993). «Номенклатура сегментов генов Т-клеточных рецепторов (TCR) иммунной системы». Бюллетень Всемирной организации здравоохранения . 71 (1): 113–115.
- ^ Робинсон, Джеймс; Баркер, Доминик Дж; Георгиу, Ксения; Купер, Майкл А; Фличек, Пол; Марш, Стивен Дж.Э. (2020). «База данных IPD-IMGT/HLA» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (Д1): Д948–Д955. дои : 10.1093/nar/gkz950 . ПМК 7145640 . ПМИД 31667505 .
- ^ «ИМГТ О нас» . Архивировано из оригинала 20 сентября 2022 года . Проверено 12 января 2023 г.