Нгаго
NgAgo — это , управляемая одноцепочечной ДНК (оцДНК) Argonaute эндонуклеаза , аббревиатура от atronobacterium gregoryi A go r naute N . NgAgo связывает 5'- фосфорилированную оцДНК длиной ~24 нуклеотида (гДНК), направляя ее к месту-мишени, и производит двухцепочечные разрывы ДНК в участке гДНК. Как и в случае с системой CRISPR/Cas , о NgAgo сообщили Chunyu Han et al. быть пригодным для редактирования генома , [1] но это не было повторено. В отличие от Cas9 , система NgAgo-гДНК не требует наличия мотива, примыкающего к протоспейсеру (PAM).
Роль
[ редактировать ]В мае 2016 года было предложено использовать NgAgo для редактирования генома из-за высокой точности и эффективности системы, которая, как утверждается, сводит к минимуму нецелевые эффекты. Специфичность гДНК имеет важное значение, поскольку эффективность расщепления снижается из-за несоответствия одного нуклеотида между направляющей и целевой молекулами. Использование 5'-фосфорилированных оцДНК в качестве направляющих молекул снижает вероятность того, что клеточные олигонуклеотиды введут в заблуждение NgAgo. Направляющая молекула может быть присоединена к NgAgo только во время экспрессии белка. После загрузки руководства NgAgo не может заменить свободно плавающую оцДНК на свою гДНК. Проектирование, синтез и регулирование концентрации оцДНК проще по сравнению с системами, использующими оцРНК. Требуемая дозировка оцДНК меньше, чем дозировка экспрессирующей оцРНК плазмиды. [1]
Споры
[ редактировать ]Сомнения по поводу этой методики возникли на форумах по редактированию генов еще в июне и сохраняются. [2] Было несколько заявлений о том, что эту процедуру невозможно воспроизвести . Компания Nature Biotechnology , которая первоначально опубликовала исследование, проводит расследование. [3] [4] было опубликовано письмо, В ноябре 2016 года в журнале Protein & Cell ставящее под сомнение результаты исследования и утверждение ведущего автора о том, что репликация требует «превосходных экспериментальных навыков». [5] В том же месяце журнал Nature Biotechnology опубликовал критическую корреспонденцию трех групп. [6] и сопутствующее выражение обеспокоенности со стороны редакторов оригинальной статьи. [7] Авторы отозвали исследование в заявлении, опубликованном в журнале Nature Biotechnology 3 августа 2017 года, сославшись на продолжающуюся неспособность исследовательского сообщества воспроизвести их результаты. [8] В 2018 году расследование, проведенное университетом Хана, пришло к выводу, что, хотя выводы Хана были ошибочными, он и его команда не собирались обманывать научное сообщество. [9] В апреле 2019 года в препринте было обнаружено, что NgAgo действительно обладает способностью редактировать гены, и предполагалось, что предыдущие результаты, возможно, было трудно воспроизвести из-за трудностей, связанных с очисткой активного белка. [10] [11]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Гао, Фэн; Шен, Сяо Цзы; Цзян, Фэн; У, Юнцян; Хан, Чунью (2016). «Редактирование генома под контролем ДНК с использованием Natronobacterium gregoryi Argonaute». Природная биотехнология . 34 (7): 768–773. дои : 10.1038/nbt.3547 . ПМИД 27136078 . S2CID 4381309 . (Отозвано, см. дои : 10.1038/nbt0817-797a , PMID 28787423 , часы втягивания )
- ^ Блоу, Натан (4 октября 2016 г.). «Редактировать или нет: История Нгаго» . БиоТехники . Проверено 29 ноября 2016 г.
- ^ Сираноски, Дэвид (2016). «Репликация, насмешки и отшельничество: споры по поводу редактирования генов NgAgo усиливаются» . Природа . 536 (7615): 136–137. Бибкод : 2016Natur.536..136C . дои : 10.1038/536136а . ПМИД 27510204 .
- ^ Сираноски, Дэвид (2016). «Споры о редактировании генов NgAgo обостряются в рецензируемых статьях» . Природа . 540 (7631): 20–21. дои : 10.1038/nature.2016.21023 . ПМИД 27905463 .
- ^ Берджесс, Шон, Гу, Фэн; Хуан, Линь, Шуо; Ли, Вэй; Сунь, Чжоу; Цзяньчжун, Хуэй; Чжан, Бо (15 ноября 2016 Цзин - г. Цян, Хаойи; Ван, Сюн , Вэй ; . ) 12): 913–915. : 10.1007 /s13238-016-0343-9 . PMC 5205665. doi PMID 27848216 .
- ^ Ли, Сын Хван; Туркьяно, Джандоменико; Ата, Хиротака; Новшин, Сомайра; Ромито, Марианна; Лу, Женкун; Рю, Сык-Мин; Эккер, Стивен С; Катомен, Тони; Ким, Джин Су (28 ноября 2016 г.). «Неспособность обнаружить редактирование генома под контролем ДНК с использованием Natronobacterium gregoryi Argonaute» . Природная биотехнология . 35 (1): 17–18. дои : 10.1038/nbt.3753 . ПМЦ 5662444 . ПМИД 27893702 .
- ^ Гао, Фэн; Шен, Сяо Цз.; Цзян, Фэн; У, Юнцян; Хан, Чунью (2017). «Приложение: Редакционное выражение обеспокоенности: редактирование генома с помощью ДНК с использованием Natronobacterium gregoryi Argonaute». Природная биотехнология . 35 (5): 481. doi : 10.1038/nbt0517-481a . ПМИД 28486453 .
- ^ Сираноски, Дэвид (2017). «Авторы отказываются от спорного Ng Ago исследования по редактированию генов » . Природа . дои : 10.1038/nature.2017.22412 .
- ^ Сираноски, Дэвид (2018). «Университет освобождает авторов исследования по редактированию генов NgAgo от обмана» . Природа . дои : 10.1038/d41586-018-06163-0 . S2CID 149931718 .
- ^ «Новый белок для редактирования генов может улучшить лечение заболеваний и устойчивое производство» . 3 апреля 2019 г.
- ^ Соломон, Кевин (2019). «Гомологичная рекомбинация, усиленная NgAgo, в E. coli опосредуется активностью эндонуклеазы ДНК». bioRxiv 10.1101/597237 .
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |