Сумит Чанда

Сумит К. Чанда — американский учёный-исследователь, занимающийся вирусными и иммунологическими заболеваниями человека. ^{[ 1 ]} Он также возглавлял команду, которая создала и развернула Metascape для анализа данных омики . ^{[ 2 ]} Этот инструмент привлекает более 500 000 пользователей в год и цитируется 2000 раз в год с момента его создания в 2019 году. ^{[ не проверено в теле ]}

Ранняя жизнь и образование

Чанда получил степень бакалавра наук. степень доктора биологии в Корнельском университете и степень доктора философии. в области молекулярной фармакологии в Стэнфордском университете . Прошел постдокторантуру в Институте геномики исследовательского фонда Novartis . ^{[ 3 ]} где он впервые применил высокопроизводительные подходы к идентификации и проверке целей, которые позволили доклиническую разработку новых терапевтических средств. ^{[ 4 ]}

Карьера

В 2014 году Чанда вместе с Бин Чжоу, Иньяо Чжоу, Максом Чангом, Ларсом Паче и Крисом Беннером создали бесплатный генов под названием Metascape. ресурс для аннотаций и анализа ^{[ 5 ]}

В 2007 году он вернулся к академическим исследованиям в Институте медицинских открытий Сэнфорда Бернема Преби , где стал директором их программы «Иммунитет и патогенез». ^{[ 6 ]} и присоединился к кафедре иммунологии и микробиологии Научно-исследовательского института Скриппса и «Калибра» в качестве профессора в 2021 году. ^{[ 7 ]}

Чанда разработал и применил крупномасштабные системные подходы для выявления факторов хозяина, критически важных для репликации вируса , включая грипп , SARS-CoV-2 , ^{[ 8 ]} флавивирусы и ВИЧ-1 . Его команда применила высокопроизводительные технологии для открытия противовирусных методов лечения в ответ на пандемию COVID-19. ^{[ 9 ]} и открыл новый класс агентов, обращающих латентный период , для лечения ВИЧ-1 (3).

Чанда возглавляет несколько крупных совместных проектов нескольких учреждений, включая Центр противовирусных препаратов (CAMPP), ^{[ 10 ]} которая является частью сети NIAID по поиску противовирусных препаратов (AViDD), а также программы обращения иммунной дисфункции для ликвидации ВИЧ-1 (RID-HIV), которая является членом Национального института здравоохранения коллабораторий Мартина Делани . Программа исследований в области лечения ВИЧ (MDC). ^{[ 11 ]}

Публикации

Кениг Р., Чжоу Ю., Элледер Д., Даймонд Т.Л., Бонами GMC, Ирелан Дж.Т., Чианг С.И., Буу Т., ДеДжесус П., Лилли С.Э., Зайдель С., Опалуч А.М., Колдуэлл Дж.С., Вайцман М.Д., Кухен К.Л., Бандиопадьяй С., Идекер Т. , Орт А.П., Миралья Л.Дж., Бушман Ф.Д., Янг Дж.А., Чанда С.К. Глобальный анализ взаимодействий хозяин-патоген, которые регулируют репликацию ВИЧ-1 на ранней стадии. Клетка. 2008 135(1):49-60. PMCID: PMC26228946
Кениг Р.С., Стерц С., Чжоу Ю., Иноуэ А., Хоффманн Х.Х., Бхаттачария С., Аламарес Дж.Г., Черне Д.М., Ортигоза М.Б., Лян Ю., Гао К., Эндрюс С.Е., Бандиопадьяй С., ДеДжесус П., Ту Б.П., Паче Л., Ши К. , Орт А , Бонами Дж , Миралья Л , Идекер Т , Гарсиа-Тейлор А , Янг ДжЭТ , Палезе П , Шоу МЛ , Чанда СК . Факторы человека-хозяина, необходимые для репликации вируса гриппа. Nature 2010, февраль 463: 813–817. PMCID: PMC2862546
Йо С., Шнайдер М., Зайфрид Дж., Сунторнвакарин С., Аклех Р.Э., Оливьери К.К., ДеДжесус П.Д., Руан С., де Кастро Е., Руис П.А., Джерманод Д., Дес Протес В., Гарсиа-Састре А., Кониг Р., Чанда С.К. PQBP1 является проксимальным сенсором cGAS-зависимого врожденного ответа на ВИЧ-1. Клетка. 2015 161(6):1293-305. PMCID: PMC4503237
Чжоу Ю, Чжоу Б, Паче Л, Чанг М, Ходабахши А.Х., Танасейчук О, Беннер С, Чанда СК. Metascape предоставляет ориентированный на биологов ресурс для анализа наборов данных системного уровня. Нац Коммун. 3 апреля 2019 г.; 10(1):1523.
Юань С, Инь X, Мэн X, Чан JF, Йе ZW, Рива L, Паче L, Чан CC, Лай ПМ, Чан CC, Пун В.К., Ли AC, Мацунага Н, Пу Y, Юэнь CK, Цао J, Лян Р. , Тан К., Шэн Л., Ду Ю, Сюй В., Лау Си, Сит Ки, Ау В.К., Ван Р., Чжан Ю., Тан Ю.Д., Клаузен Т.М., Пиль Дж., О Дж., Сзе К.Х., Чжан А.Дж., Чу Х., Кок К.Х., Ван Д., Цай С.Х., Эско Дж.Д., Хунг И.Ф., Ли РА, Чен Х., Сунь Х., Цзинь Д.И., Сунь Р., Чанда С.К., Юэнь К.Ю. Клофазимин в целом ингибирует коронавирусы, включая SARS-CoV-2. Природа. 2021 593(7859):418-423. ПМИД 33727703
Мартин-Санчо Л., Левински М.К., Паче Л., Стоунхэм К.А., Инь Х, Беккер М.Е., Пратт Д., Чурас С., Розенталь С.Б., Лю С., Уэстон С., Де Хесус П.Д., О'Нил А.М., Гундер А.П., Нгуен С., Пу Ю, Карри Х.М., Оом А.Л., Миорин Л., Родригес-Франдсен А., Чжэн Ф., Ву С., Сюн Ю., Урбановски М., Шоу М.Л., Чанг М.В., Беннер С., Хоуп Т.Дж., Фриман М.Б., Гарсиа-Састре А., Идекер Т., Хультквист Дж. Ф., Гуателли Дж., Чанда С.К. Функциональный ландшафт клеточного ограничения SARS-CoV-2. Мол Клетка. 2021, 17 июня;81(12):2656-2668. PMCID: PMC8043580
Йо С., Мамеде Дж., Лау Д., Ан Н., Санчес-Апарисио М.Т., Темпл Дж., Таквелл А., Фукс Н.В., Чианчи Г.К., Рива Л., Карри Х., Инь Икс, Гамбут С., Саймонс Л.М., Хультквист Дж.Ф., Кениг Р., [ PubMed ] [ Перекрестная ссылка ] Сюн Й., Гарсия-Тейлор А., Бёкинг Т., Хоуп Т.Дж., Чанда СК. Распознавание капсида ВИЧ-1 с помощью PQBP1 разрешает врожденное иммунное восприятие зарождающейся ДНК ВИЧ-1. Мол Клетка. 4 августа 2022 г.; 82 (15): 2871–2884. PMCID: PMC9552964

Ссылки

^ Чанда, Сумит (21 февраля 2023 г.). «Как мы можем подготовиться к следующей пандемии? Основные моменты подкаста Sumit Chanda» (интервью). Исследование Скриппса . Проверено 22 сентября 2023 г. - через YouTube .
^ Чжоу, Инъяо; Чжоу, Бин; Паче, Ларс; Чанг, Макс; Ходабахши, Алиреза Хадж; Танасейчук, Ольга; Беннер, Кристофер; Чанда, Сумит К. (3 апреля 2019 г.). «Metascape предоставляет биологическому ресурсу для анализа наборов данных системного уровня» . Природные коммуникации . 10 (1): 1523. Бибкод : 2019NatCo..10.1523Z . дои : 10.1038/s41467-019-09234-6 . ISSN 2041-1723 . ПМК 6447622 . ПМИД 30944313 .
^ «Институты биомедицинских исследований Novartis» . Новартис . Проверено 22 сентября 2023 г.
^ «Изобретения, патенты и патентные заявки Сумита К. Чанда - Поиск патентов Justia» . Юстиа . Проверено 22 сентября 2023 г.
^ Метаскейп. «Краткая история Metascape с 2014 года | Блог Metascape» . Проверено 28 сентября 2023 г.
^ Вайнтрауб, Арлин (20 апреля 2020 г.). «COVID-19: новые данные о животных подтверждают эффективность ремдесивира компании Gilead, поскольку появляются другие кандидаты на лечение» . Жестокие биотехнологии .
^ «Сумит Чанда» . Исследование Скриппса . Проверено 22 сентября 2023 г.
^ «Знакомьтесь с авторами: Лаурой Мартин-Санчо и Сумит К. Чанда» (PDF) . Молекулярная клетка . 17 июня 2021 г.
^ «Высокопроизводительный скрининг выявил 21 препарат, активный против COVID-19» (Пресс-релиз) . Получено 22 сентября 2023 г. - через Обзор целевых показателей лекарств.
^ «NIAID объявляет награду за разработку противовирусных препаратов» . Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний (пресс-релиз). 18 мая 2022 г. Проверено 22 сентября 2023 г.
^ Чанда, Сумит. «Сумит Чанда - От ВИЧ до Covid-19 (EP.01)» . Модельные лекарства (интервью) . Проверено 22 сентября 2023 г.

[1] Чанда, Сумит (21 февраля 2023 г.). «Как мы можем подготовиться к следующей пандемии? Основные моменты подкаста Sumit Chanda» (интервью). Исследование Скриппса . Проверено 22 сентября 2023 г. - через YouTube .

[2] Чжоу, Инъяо; Чжоу, Бин; Паче, Ларс; Чанг, Макс; Ходабахши, Алиреза Хадж; Танасейчук, Ольга; Беннер, Кристофер; Чанда, Сумит К. (3 апреля 2019 г.). «Metascape предоставляет биологическому ресурсу для анализа наборов данных системного уровня» . Природные коммуникации . 10 (1): 1523. Бибкод : 2019NatCo..10.1523Z . дои : 10.1038/s41467-019-09234-6 . ISSN 2041-1723 . ПМК 6447622 . ПМИД 30944313 .

[3] «Институты биомедицинских исследований Novartis» . Новартис . Проверено 22 сентября 2023 г.

[4] «Изобретения, патенты и патентные заявки Сумита К. Чанда - Поиск патентов Justia» . Юстиа . Проверено 22 сентября 2023 г.

[5] Метаскейп. «Краткая история Metascape с 2014 года | Блог Metascape» . Проверено 28 сентября 2023 г.

[6] Вайнтрауб, Арлин (20 апреля 2020 г.). «COVID-19: новые данные о животных подтверждают эффективность ремдесивира компании Gilead, поскольку появляются другие кандидаты на лечение» . Жестокие биотехнологии .

[7] «Сумит Чанда» . Исследование Скриппса . Проверено 22 сентября 2023 г.

[8] «Знакомьтесь с авторами: Лаурой Мартин-Санчо и Сумит К. Чанда» (PDF) . Молекулярная клетка . 17 июня 2021 г.

[9] «Высокопроизводительный скрининг выявил 21 препарат, активный против COVID-19» (Пресс-релиз) . Получено 22 сентября 2023 г. - через Обзор целевых показателей лекарств.

[10] «NIAID объявляет награду за разработку противовирусных препаратов» . Национальный институт аллергии и инфекционных заболеваний (пресс-релиз). 18 мая 2022 г. Проверено 22 сентября 2023 г.

[11] Чанда, Сумит. «Сумит Чанда - От ВИЧ до Covid-19 (EP.01)» . Модельные лекарства (интервью) . Проверено 22 сентября 2023 г.

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]