Ясс (программное обеспечение)
| Стабильная версия | 1.14
|
|---|---|
| Репозиторий | |
| Операционная система | Linux , Mac , MS-Windows |
| Тип | биоинформатики Инструмент |
| Лицензия | GPLv2 CeCILL |
| Веб-сайт | https://bioinfo.univ-lille.fr/yass/ |
YASS (еще один поисковик сходства) [ 1 ] [ 2 ] это бесплатное программное обеспечение , [ 3 ] парного выравнивания последовательностей программное обеспечение для нуклеотидных последовательностей, то есть оно может искать сходство между последовательностями ДНК или РНК . YASS принимает нуклеотидные последовательности либо в виде обычного текста, либо в формате FASTA , а выходной формат включает табличный вывод BLAST . YASS использует несколько с ограниченными переходами разнесенных затравочных k-меров , что позволяет значительно повысить чувствительность. YASS можно использовать локально на компьютере пользователя или в качестве SaaS на веб-сервере YASS , который создает точечную диаграмму на основе браузера .
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Ной Л., Кучеров. Г. (2005). «YASS: повышение чувствительности поиска по сходству ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 33 (2): W540–W543. дои : 10.1093/nar/gki478 . ПМК 1160238 . ПМИД 15980530 .
- ^ Ной Л., Кучеров. Г. (2004). «Улучшенные критерии совпадения для локального выравнивания ДНК» . БМК Биоинформатика . 5 : 149. дои : 10.1186/1471-2105-5-149 . ПМК 526756 . ПМИД 15485572 .
- ^ «ЧИТАЙТЕ» . Проверено 7 апреля 2015 г.
Внешние ссылки
[ редактировать ]  | Эта статья, посвященная биоинформатике, незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |