КиСАО
Содержание | |
---|---|
Описание | Онтология, обеспечивающая поддержку однозначного обращения к алгоритмам моделирования при описании имитационного эксперимента. |
Типы данных захвачен | алгоритмы моделирования, их характеристики и параметры |
Контакт | |
Исследовательский центр | ЭМБЛ-ЭБИ |
Первичное цитирование | ПМИД 22027554 |
Доступ | |
Стандарты | МИРИАМ |
Формат данных | СОВА |
Веб-сайт | Домашняя страница KiSAO , KiSAO на BioPortal |
URL-адрес загрузки | Домашняя страница КиСАО |
Инструменты | |
Автономный | libKiSAO, Java-библиотека для запроса KiSAO |
Разнообразный | |
Лицензия | Художественная лицензия |
Версия | 2.3.5 (апрель 2014 г.) |
Политика курирования | да (ручной) |
Добавить в закладки сущности | да |
Онтология алгоритмов кинетического моделирования (KiSAO) предоставляет информацию о существующих алгоритмах, доступных для моделирования моделей системной биологии , их характеристик и взаимосвязей. KiSAO является частью проекта BioModels.net и инициативы COMBINE . [ 1 ]
Структура
[ редактировать ]КиСАО состоит из трех основных филиалов:
- алгоритм моделирования
- характеристика алгоритма моделирования
- параметр алгоритма моделирования
Элементы каждой ветви алгоритма связаны с ветвями характеристик и параметров с помощью «имеет характеристику» и «имеет параметры» соотношений . Сама ветвь алгоритма иерархически структурирована с использованием отношений, которые означают, что алгоритмы-потомки произошли от более общих предков или определяют их.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Курто, М.; Джути, Н.; Кнупфер, К.; Уолтемат, Д.; Жукова А.; Драгер, А.; Дюмонтье, М.; Финни, А.; Голебевский, М.; Гастингс, Дж.; Хупс, С.; Китинг, С.; Келл, Д.Б.; Керриен, С.; Лоусон, Дж.; Листер, А.; Лу, Дж.; Махне, Р.; Мендес, П.; Покок, М.; Родригес, Н.; Виллегер, А.; Уилкинсон, диджей; Вималаратне, С.; Лайбе, К.; Хука, М.; Ле Новер, Н. (2014). «Управляемые словари и семантика в системной биологии» . Молекулярная системная биология . 7 : 543. дои : 10.1038/msb.2011.77 . ПМК 3261705 . ПМИД 22027554 .