Родословная (генетическая)
Генетическая линия включает всех потомков данной генетической последовательности, обычно после новой мутации . Это не то же самое, что аллель , поскольку исключает случаи, когда разные мутации приводят к возникновению одной и той же аллели, и включает потомков, которые отличаются от предка одной или несколькими мутациями . Генетическая последовательность может иметь разные размеры, например, одиночный ген или гаплотип, содержащий несколько соседних генов вдоль хромосомы . При рекомбинации каждый ген может иметь отдельные генетические линии, даже если популяция разделяет одну организменную линию . В бесполых микробах или соматических клетках клеточные линии точно соответствуют генетическим линиям, и их можно проследить . [1]
Неполная сортировка родословной
[ редактировать ]
Неполная сортировка линий описывает ситуацию, когда филогенетическое древо гена не соответствует древу вида . Например, хотя большинство линий генов человека сначала сливаются с линиями шимпанзе, а затем с линиями горилл, встречаются и другие конфигурации. [2]
Выбор рода
[ редактировать ]Выбор линии происходит, когда частота представителей одной линии меняется по отношению к другой линии. Это полезно для изучения аллелей со сложными эффектами, которые проявляются на протяжении нескольких поколений, например, аллелей, влияющих на рекомбинацию , способность к развитию или альтруизм . [3] [4] Отбор линий также полезен при определении эффектов мутаций в высокоструктурированных средах, таких как опухоли. [5]
Долгосрочные стохастические результаты конкуренции между линиями можно количественно оценить с помощью математических моделей как соотношение вероятности фиксации : вероятности контрфиксации. [6] Инклюзивная приспособленность равна средней приспособленности организма особей по распределению вероятностей возможных линий. [7]
Запись древовидной последовательности
[ редактировать ]Запись древовидной последовательности описывает эффективные методы записи выживших линий при проведении компьютерного моделирования популяционной генетики . [8] «вперед во времени» Полученные в результате компьютерные симуляции предлагают альтернативу теории объединения в «обратное время» . Запись древовидной последовательности была включена в программное обеспечение для моделирования популяции SLiM. [9]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Леви, Саша Ф.; Бланделл, Джейми Р.; Венкатарам, Сандип; Петров Дмитрий А.; Фишер, Дэниел С.; Шерлок, Гэвин (март 2015 г.). «Количественная эволюционная динамика с использованием отслеживания родословной с высоким разрешением» . Природа . 519 (7542): 181–186. Бибкод : 2015Natur.519..181L . дои : 10.1038/nature14279 . ПМЦ 4426284 . ПМИД 25731169 .
- ^ Ривас-Гонсалес, Икер; Руссель, Маржолен; Ли, Фанг; Чжоу, Лонг; Дютей, Жюльен Ю.; Мунк, Каспер; Шао, Юн; У, Дундун; Шируп, Миккель Х.; Чжан, Гоцзе (2 июня 2023 г.). «Повсеместная неполная сортировка линий проливает свет на видообразование и отбор приматов». Наука . 380 (6648). дои : 10.1126/science.abn4409 . ПМИД 37262154 .
- ^ Грейвс, Кристофер Дж.; Вайнрайх, Дэниел М. (2 ноября 2017 г.). «Изменчивость эффектов приспособленности может помешать отбору наиболее приспособленных» . Ежегодный обзор экологии, эволюции и систематики . 48 (1): 399–417. doi : 10.1146/annurev-ecolsys-110316-022722 . ПМК 6768565 . ПМИД 31572069 .
- ^ Де Вьен, Дэмиен М.; Жиро, Татьяна; Гуйон, Пьер-Анри (2013). «Отбор родословной и поддержание пола» . ПЛОС ОДИН . 8 (6e66906): e66906. Бибкод : 2013PLoSO...866906D . дои : 10.1371/journal.pone.0066906 . ПМЦ 3688966 . ПМИД 23825582 .
- ^ Нанни, Леонард (7 марта 1999 г.). «Отбор линии и эволюция многостадийного канцерогенеза» . Труды Лондонского королевского общества B: Биологические науки . 266 (1418): 493–498. дои : 10.1098/rspb.1999.0664 . ISSN 0962-8452 . ПМК 1689794 . ПМИД 10189713 .
- ^ Кинг, Оливер Д.; Мазель, Джоанна (декабрь 2007 г.). «Эволюция адаптации хеджирования ставок к редким сценариям» . Теоретическая популяционная биология . 72 (4): 560–575. дои : 10.1016/j.tpb.2007.08.006 . ПМК 2118055 . ПМИД 17915273 .
- ^ Акчай, Эрол; Ван Клив, Джереми (5 февраля 2016 г.). «Нет приспособленности, кроме приспособленности, и родословная является ее носителем» . Фил. Пер. Р. Сок. Б. 371 (1687): 20150085. doi : 10.1098/rstb.2015.0085 . ISSN 0962-8436 . ПМК 4760187 . ПМИД 26729925 .
- ^ Келлехер, Джером; Торнтон, Кевин Р.; Ашандер, Хайме; Ральф, Питер Л. (1 ноября 2018 г.). «Эффективная запись родословной для быстрого моделирования популяционной генетики» . PLOS Вычислительная биология . 14 (11): e1006581. Бибкод : 2018PLSCB..14E6581K . дои : 10.1371/journal.pcbi.1006581 . ПМК 6233923 . ПМИД 30383757 .
- ^ Халлер, Бенджамин К.; Галлоуэй, Джаред; Келлехер, Джером; Мессер, Филипп В.; Ральф, Питер Л. (март 2019 г.). «Запись древовидных последовательностей в SLiM открывает новые горизонты для моделирования целых геномов в реальном времени» . Ресурсы молекулярной экологии . 19 (2): 552–566. дои : 10.1111/1755-0998.12968 . ПМК 6393187 .
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |