УПСК РНК

УПСК РНК
УПСК РНК
	Прогнозируемая вторичная структура и сохранение последовательности UPSK
Идентификаторы
Символ	УПСК
Рфам	RF00390
Другие данные
РНК Тип	СНГ-рег.
Домен(ы)	Вирусы
ТАК	ТАК: 0000233
PDB Структуры	ПДБе

Домен восходящего псевдоузла (UPSK) представляет собой элемент РНК, обнаруженный в вирусе желтой мозаики репы , вирусе свеклы Q , ^{[ 1 ]} вирус полосатой мозаики ячменя ^{[ 2 ]} и вирус табачной мозаики , ^{[ 3 ]} который, как полагают, необходим для эффективной транскрипции . Нарушение структуры псевдоузла приводит к снижению эффективности транскрипции на 50%. ^{[ 4 ]} Этот элемент действует в сочетании с тРНК-подобным элементом 3'-UTR тимовируса/помовируса, усиливая трансляцию. ^{[ 5 ]}

Ссылки

^ Кениг Р., Плей К.В., Бейер С., Коммандер Ю. (август 1998 г.). «Свойства генома свекловичного вируса Q, нового фуроподобного вируса сахарной свеклы, определенные на основе неочищенного вируса» . Дж. Генерал Вирол . 79 (8): 2027–2036. дои : 10.1099/0022-1317-79-8-2027 . ПМИД 9714254 .
^ Соловьев А.Г., Савенков Е.И., Аграновский А.А., Морозов С.Ю. (май 1996 г.). «Сравнение геномных цис-элементов и кодирующих областей в бета-компонентах РНК вируса полосатой мозаики хордеивирусов, вируса кольцевой пятнистости лихниса и полулатентного вируса мятлика» . Вирусология . 219 (1): 9–18. дои : 10.1006/виро.1996.0217 . ПМИД 8623558 .
^ Фельден Б., Флоренц С., Жье Р., Вестхоф Э. (март 1996 г.). «Центральное трехстороннее соединение с псевдоузлами обеспечивает мимикрию, подобную тРНК, и ориентацию трех 5'-восходящих псевдоузлов на 3'-конце РНК вируса табачной мозаики» . РНК . 2 (3): 201–212. ПМЦ 1369363 . ПМИД 8608444 .
^ Дейман, бакалавр; Кортлевер Р.М.; Плейдж CW (1997). «Роль псевдоузла на 3'-конце РНК вируса желтой мозаики репы в синтезе минус-цепи вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой» . Дж Вирол . 71 (8): 5990–5996. doi : 10.1128/JVI.71.8.5990-5996.1997 . ЧВК 191855 . ПМИД 9223489 .
^ Мацуда, Д; Дреер Т.В. (2004). «ТРНК-подобная структура РНК вируса желтой мозаики репы представляет собой 3'-усилитель трансляции» . Вирусология . 321 (1): 36–46. дои : 10.1016/j.virol.2003.10.023 . ПМИД 15033563 .

Внешние ссылки

Страница УПСК РНК на Rfam

Эта по молекулярной или клеточной биологии статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[pmid9714254-1] Кениг Р., Плей К.В., Бейер С., Коммандер Ю. (август 1998 г.). «Свойства генома свекловичного вируса Q, нового фуроподобного вируса сахарной свеклы, определенные на основе неочищенного вируса» . Дж. Генерал Вирол . 79 (8): 2027–2036. дои : 10.1099/0022-1317-79-8-2027 . ПМИД 9714254 .

[pmid8623558-2] Соловьев А.Г., Савенков Е.И., Аграновский А.А., Морозов С.Ю. (май 1996 г.). «Сравнение геномных цис-элементов и кодирующих областей в бета-компонентах РНК вируса полосатой мозаики хордеивирусов, вируса кольцевой пятнистости лихниса и полулатентного вируса мятлика» . Вирусология . 219 (1): 9–18. дои : 10.1006/виро.1996.0217 . ПМИД 8623558 .

[pmid8608444-3] Фельден Б., Флоренц С., Жье Р., Вестхоф Э. (март 1996 г.). «Центральное трехстороннее соединение с псевдоузлами обеспечивает мимикрию, подобную тРНК, и ориентацию трех 5'-восходящих псевдоузлов на 3'-конце РНК вируса табачной мозаики» . РНК . 2 (3): 201–212. ПМЦ 1369363 . ПМИД 8608444 .

[4] Дейман, бакалавр; Кортлевер Р.М.; Плейдж CW (1997). «Роль псевдоузла на 3'-конце РНК вируса желтой мозаики репы в синтезе минус-цепи вирусной РНК-зависимой РНК-полимеразой» . Дж Вирол . 71 (8): 5990–5996. doi : 10.1128/JVI.71.8.5990-5996.1997 . ЧВК 191855 . ПМИД 9223489 .

[5] Мацуда, Д; Дреер Т.В. (2004). «ТРНК-подобная структура РНК вируса желтой мозаики репы представляет собой 3'-усилитель трансляции» . Вирусология . 321 (1): 36–46. дои : 10.1016/j.virol.2003.10.023 . ПМИД 15033563 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]