Трансактивирующая crRNA
В молекулярной биологии транс -активирующая РНК CRISPR ( tracrRNA ) представляет собой небольшую транс -кодируемую РНК. Впервые его обнаружила Эммануэль Шарпантье в ходе исследования человеческого возбудителя Streptococcus pyogenes — типа бактерий , наносящих вред человечеству. [ 1 ] У бактерий и архей CRISPR-Cas (кластерные, регулярно расположенные короткие палиндромные повторы/CRISPR-ассоциированные белки) представляют собой РНК-опосредованную защитную систему, которая защищает от вирусов и плазмид . Этот защитный путь состоит из трех этапов. Сначала копия вторгшейся нуклеиновой кислоты интегрируется в локус CRISPR . Затем CRISPR-РНК ( crRNA ) транскрибируются из этого локуса CRISPR . Затем crРНК включаются в эффекторные комплексы , где crRNA направляет комплекс к вторгающейся нуклеиновой кислоте, а белки Cas разрушают эту нуклеиновую кислоту. [ 2 ] Существует несколько подтипов системы CRISPR.
Системам CRISPR-Cas типа II требуется tracrRNA, которая играет роль в созревании crRNA. [ 3 ] ТракрРНК частично комплементарна и по парам оснований пре-крРНК образует дуплекс РНК . Он расщепляется РНКазой III , РНК-специфической рибонуклеазой , с образованием гибрида crРНК/tracrRNA. Этот гибрид действует как проводник для эндонуклеазы Cas9, которая расщепляет вторгшуюся нуклеиновую кислоту. [ 1 ] [ 4 ] [ 5 ]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Jump up to: а б Дельчева Е., Чилински К., Шарма С.М., Гонсалес К., Чао Ю., Пирзада З.А. и др. (2011). «Созревание РНК CRISPR с помощью транскодируемой малой РНК и фактора хозяина РНКазы III» . Природа . 471 (7340): 602–607. Бибкод : 2011Natur.471..602D . дои : 10.1038/nature09886 . ПМК 3070239 . ПМИД 21455174 .
- ^ Тернс МП, Тернс Р.М. (2011). «Адаптивные иммунные системы на основе CRISPR» . Curr Opin Микробиол . 14 (3): 321–327. дои : 10.1016/j.mib.2011.03.005 . ПМК 3119747 . ПМИД 21531607 .
- ^ Шарпантье Э., Рихтер Х., ван дер Ост Дж., Уайт М.Ф. (2015). «Пути биогенеза РНК-направляющих в адаптивном иммунитете CRISPR-Cas архей и бактерий» . Обзоры микробиологии FEMS . 39 (3): 428–441. дои : 10.1093/femsre/fuv023 . ПМЦ 5965381 . ПМИД 25994611 .
- ^ Джинек М., Чилински К., Фонфара И., Хауэр М., Дудна Дж.А., Шарпантье Э. (2012). «Программируемая ДНК-эндонуклеаза, управляемая двойной РНК, в адаптивном бактериальном иммунитете» . Наука . 337 (6096): 816–821. Бибкод : 2012Sci...337..816J . дои : 10.1126/science.1225829 . ПМК 6286148 . ПМИД 22745249 .
- ^ Браунс С.Дж. (2012). «Швейцарский армейский нож иммунитета». Наука . 337 (6096): 808–809. Бибкод : 2012Sci...337..808B . дои : 10.1126/science.1227253 . ПМИД 22904002 . S2CID 206543893 .
Дальнейшее чтение
[ редактировать ]- Ле Рун А., Шарпантье Э (2012). «Маленькие РНК стрептококков» . РНК Биол . 9 (4): 414–426. дои : 10.4161/rna.20104 . ПМИД 22546939 .