Рецептор частиц распознавания сигналов
| Альфа-субъединица рецептора частицы распознавания сигнала (SRP), N-конец | |||
|---|---|---|---|
 Структура бета-субъединицы рецептора частицы распознавания эукариотического сигнала. [ 1 ] | |||
| Идентификаторы | |||
| Символ | СРХ | ||
| Пфам | PF09201 | ||
| ИнтерПро | ИПР015284 | ||
| ОБЛАСТЬ ПРИМЕНЕНИЯ 2 | 1нрж / СКОПе / СУПФАМ | ||
| Суперсемейство OPM | 136 | ||
| белок OPM | 1нрдж | ||
| Мембраном | 38 | ||
| |||
Рецептор частицы распознавания сигнала (SRP) , также называемый стыковочным белком , представляет собой димер, состоящий из двух различных субъединиц, которые связаны исключительно с шероховатым ЭР в млекопитающих клетках . Его основная функция – идентификация подразделений SRP . SRP (частица распознавания сигнала) — молекула , которая помогает комплексам рибосома -мРНК- полипептид расположиться на мембране эндоплазматического ретикулума .
Эукариотический рецептор SRP (называемый SR) представляет собой гетеродимер SR-альфа (70 кДа; SRPRA ) и SR-бета (25 кДа; SRPRB ), оба из которых содержат GTP-связывающий домен. [ 2 ] тогда как прокариотический рецептор SRP содержит только мономерный слабосвязанный с мембраной гомолог SR-альфа FtsY ( P10121 ).
SRX-домен
[ редактировать ]SR-альфа регулирует нацеливание полипептидных комплексов SRP-рибосома на транслокон . [ 3 ] SR-альфа связывается с субъединицей SRP54 комплекса SRP. Субъединица SR-бета представляет собой трансмембранную ГТФазу, которая прикрепляет субъединицу SR-альфа (периферическая мембранная ГТФаза) к мембране ЭР. [ 4 ] SR-бета взаимодействует с N-концевым SRX-доменом SR-альфа, которого нет в бактериальном гомологе FtsY. SR-бета также участвует в рекрутировании образующегося SRP полипептида в белок-проводящий канал.
Семейство SRX представляет собой эукариотические гомологи альфа-субъединицы рецептора SR. Члены этой записи состоят из центрального шестицепочечного антипараллельного бета-листа, зажатого спиралью альфа1 с одной стороны и спиралями альфа2-альфа4 с другой. Они взаимодействуют с малой ГТФазой SR-бета, образуя комплекс, который соответствует классу малых комплексов G-белок-эффектор, включая Rap-Raf, Ras-PI3K(гамма), Ras-RalGDS и Arl2-PDE(дельта). [ 2 ] На С-конце SR-альфа и FtsY находится домен NG, аналогичный SRP54.
домена OF
[ редактировать ]Рецептор связывается с SPR54/Ffh с помощью «домена NG», комбинации домена «N» из 4 спиральных пучков ( InterPro : IPR013822 ) и домена GTPазы «G» ( InterPro : IPR000897 ), общих для обоих белков. Связанная структура представляет собой квазисимметричный гетеродимер, называемый нацеливающим комплексом. [ 5 ]
Частица распознавания сигнала (SRP)
[ редактировать ]Частица распознавания сигнала (SRP) представляет собой мультимерный белок, который вместе со своим конъюгатным рецептором (SR) участвует в нацеливании секреторных белков на мембрану шероховатой эндоплазматической сети (RER) у эукариот или на плазматическую мембрану у прокариот. [ 6 ] [ 7 ] SRP распознает сигнальную последовательность возникающего полипептида на рибосоме, замедляет его элонгацию и пристыковывает комплекс SRP-рибосома-полипептид к мембране RER через рецептор SR. SRP состоит из шести полипептидов (SRP9, SRP14, SRP19, SRP54, SRP68 и SRP72) и одной молекулы 7S РНК из 300 нуклеотидов. Компонент РНК катализирует взаимодействие SRP с его SR-рецептором. [ 8 ] У высших эукариот комплекс SRP состоит из домена Alu и домена S, связанных РНК SRP. Домен Alu состоит из гетеродимера SRP9 и SRP14, связанного с 5'- и 3'-концевыми последовательностями РНК SRP. Этот домен необходим для замедления удлинения образующейся полипептидной цепи, что дает SRP время для стыковки рибосомно-полипептидного комплекса с мембраной RER.
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Шварц Т., Блобель Г. (март 2003 г.). «Структурная основа функции бета-субъединицы рецептора частиц распознавания эукариотических сигналов» . Клетка . 112 (6): 793–803. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00161-2 . ПМИД 12654246 .
- ^ Перейти обратно: а б Блобель Г., Шварц Т. (2003). «Структурная основа функции бета-субъединицы рецептора частиц распознавания эукариотических сигналов» . Клетка . 112 (6): 793–803. дои : 10.1016/S0092-8674(03)00161-2 . ПМИД 12654246 .
- ^ Эндрюс Д.В., Легат КР, Фальконе Д. (2000). «Нуклеотид-зависимое связывание GTPase-домена бета-субъединицы рецептора частицы распознавания сигнала с альфа-субъединицей» . Ж. Биол. Хим . 275 (35): 27439–46. дои : 10.1074/jbc.M003215200 . ПМИД 10859309 .
- ^ Уолтер П., Миллер Дж.Д., Тадзима С., Лауффер Л. (1995). «Бета-субъединица рецептора частиц, распознающих сигнал, представляет собой трансмембранную ГТФазу, которая прикрепляет альфа-субъединицу, периферическую мембранную ГТФазу, к мембране эндоплазматического ретикулума» . Дж. Клеточная Биол . 128 (3): 273–282. дои : 10.1083/jcb.128.3.273 . ПМК 2120348 . ПМИД 7844142 .
- ^ Уайлд, Клеменс; Беккер, Матиас ММ; Кемпф, Георг; Синнинг, Ирмгард (18 декабря 2019 г.). «Структура, динамика и взаимодействие крупных вариантов SRP» . Биологическая химия . 401 (1): 63–80. дои : 10.1515/hsz-2019-0282 . ПМИД 31408431 .
- ^ Страуд Р.М., Уолтер П., Рутенбер Э., Рейес К.Л. (2007). Чжан С. (ред.). «Рентгеновские структуры рецептора частиц распознавания сигнала выявляют промежуточные соединения цикла нацеливания» . ПЛОС ОДИН . 2 (7): е607. Бибкод : 2007PLoSO...2..607R . дои : 10.1371/journal.pone.0000607 . ПМК 1904258 . ПМИД 17622352 .
- ^ Добберштейн Б., Хай С., Ромиш К., Миллер Ф.В. (2006). «Человеческие аутоантитела против белка 54 кДа, распознающего сигнал, блокируют частицы на нескольких стадиях» . Исследования и терапия артрита . 8 (2): Р39. дои : 10.1186/ar1895 . ПМК 1526608 . ПМИД 16469117 .
- ^ Уолтер П., Брэдшоу Н. (2007). «РНК частицы распознавания сигнала (SRP) связывает конформационные изменения в SRP с нацеливанием на белок» . Мол. Биол. Клетка . 18 (7): 2728–2734. дои : 10.1091/mbc.E07-02-0117 . ЧВК 1924838 . ПМИД 17507650 .
