Открытие лекарств с открытым исходным кодом

Открытие лекарств с открытым исходным кодом (OSDD) - это Консорциум Team India под руководством Совета научных и промышленных исследований Индии (CSIR) с глобальным участием. ^[1]^[2]^[3]^[4]^[5] предлагая совместную платформу для разработки лекарств от забытых тропических болезней, таких как лейшманиоз , которые привлекают ограниченное внимание научно-исследовательских фармацевтических предприятий. ^[1]^[5]^[6]^[7]^[8]Эта программа имеет глобальное сообщество, насчитывающее более 7500 участников из 130 стран, в том числе исследователей, научных кругов, студентов, представителей промышленности, образовательных учреждений и так далее. ^[7]^[9] любой, кто стремится к открытию лекарств от забытых болезней в режиме открытого исходного кода . В программе может принять участие ^[10] OSDD объединяет экспертов разного происхождения, чтобы сосредоточиться на поиске и разработке доступных лекарств от тропических инфекций.

История

CSIR-OSDD был запущен в сентябре 2008 года. ^[9]^[11] Этот проект был задуман профессором Самиром К. Брахмачари , директором-основателем Института геномики и интегративной биологии CSIR, как 11-й проект пятилетнего плана CSIR. ^[12] Это было одобрено правительством Индии, общие затраты составили 45,96 крор рупий (около 12 миллионов долларов США). ^[13]Девиз проекта — «Доступное здравоохранение для всех». Он использует философию открытого исходного кода, концепции краудсорсинга и модель совместных исследований. ^[14] использование веб-инструментов для стимулирования инноваций и открытия новых методов лечения. ^[13]^[15] Все данные и ресурсы, созданные сообществом, открыто доступны через веб-портал под названием Sysborg 2.0, специально созданный для этой цели. ^[5]^[16]^[17]

В проекте используется модель здравоохранения, которая сочетает в себе политику патентования и исследования открытых источников с целью сделать новые лекарства доступными в качестве непатентованных лекарств. ^[18] без ограничений интеллектуальной собственности и, таким образом, обеспечить ценовую доступность и доступность. ^[1]^[5]^[19]

Первое мероприятие заключалось в разработке лекарств от туберкулезной палочки ( Mycobacterium Tuberculosis ). ^[20] Проект состоит из двух этапов:

Фаза I (2008–2012 гг.), которая будет включать открытие и разработку новых лекарств.
Фаза II (2012–2017 гг.), которая будет включать клинические испытания .

Процесс

OSDD началось с создания веб-портала, основанного на модели веб-сайта Wiki , чтобы участвующие агентства могли легко вносить вклад или изменять содержимое веб-сайта. Загруженную информацию можно затем подвергнуть рецензированию. Новые разрабатываемые лекарства будут находиться в общественном достоянии . цене . Фармацевтические компании будут приобретать дженерики, чтобы препарат можно было коммерциализировать по разумной ^[21]

Операционная методология

Процесс открытия лекарств разделен на десять рабочих пакетов, а именно: ^[21]

WP1 – Идентификация цели применения препарата. Это способствует вычислительной деятельности, включая исследования в области системной биологии для выявления потенциальных мишеней для лекарств. Это открывает возможность участия академических кругов, учреждений и отраслей, имеющих сильную склонность к открытому исходному коду.
WP2 – Формулирование целей. Это включает в себя обмен результатами экспериментов по потенциальным мишеням для лекарств и разработку методов анализа.
WP3 - Разработка экрана. Это предполагает использование специальных анализов, разработанных для различных целей, для скрининга больших библиотек химических соединений.
WP4 — стыковка In silico. Это включает в себя определение цели и идентификацию потенциальных участков в пораженных соединениях для синтеза аналогов, чтобы достичь максимальной эффективности и минимальной токсичности.
WP5 — Экспрессия генов на микроматрицах для клеток и тканей человека с лучшими ингибиторами. Это предполагает идентификацию соединений с более высокой аффинностью связывания с мишенью без изменения профиля экспрессии клетки-хозяина.
РП6 - Медицинская химия. Это включает в себя синтез улучшенных соединений.
WP7 - Оптимизация лидов. Это делается для получения соединений свинца с желаемым эффектом, не влияя при этом на хозяина.
WP8 - Аффинная колонка на основе протеомики для проверки связывания клеточных белков человека
WP9 – Доклиническая токсичность соединений свинца
WP10 – Клиническая разработка новых молекулярных структур

Пакеты работ 1–8 относятся к этапу I, а WP9 и 10 — к этапу II.

Организация

OSDD — это совместный проект и подразделение CSIR. Профессор Самир К. Брахмачари , бывший генеральный директор CSIR, является «главным наставником» проекта по открытию лекарств с открытым исходным кодом. М. Виджаян, президент Академии Гьян Бинду , В.М. Каточ, генеральный директор Индийского совета медицинских исследований Наставниками являются (ICMR), и Н.К. Гангули, бывший генеральный директор ICMR. Отдельные проекты рассматриваются участвующими организациями и управляются главным исследователем. ^[21] Эти проекты централизованно контролируются директором проекта OSDD д-ром Саралой Балачандран в CSIR.

Финансирование

Основное финансирование OSDD осуществляется правительством Индии. На период с сентября 2008 года по март 2012 года правительство Индии выделило на этот проект 45,96 крор рупий (около 12 миллионов долларов). ^[22] Средства используются для финансирования научных проектов, создания инфраструктуры и поддержки текущей деятельности проекта. ^[23] До 2012 года OSDD был проектом «Национальной лабораторной схемы» CSIR. В 12-й пятилетке на 2013-2017 годы плановая комиссия одобрила продолжение OSDD в рамках Схемы открытых инноваций СНИР.

Достижения

К OSDD присоединились 7500 зарегистрированных участников из разных уголков мира. Реализуется около 110 исследовательских проектов. Совместная работа выявила более 60 потенциальных мишеней для лечения M.tuberculosis . На рассмотрении находятся семь целей. Первая международная публикация консорциума состоялась в 2009 году по карте интегративной геномики M.tuberculosis . ^[24] С тех пор опубликовано более десятка исследований. ^[25] OSDD в настоящее время реализует информационно-просветительскую программу OSDD по химии (OSDDChem). В рамках этой системы студенты обучаются синтетической химии , а соединения, синтезированные в университетах, институтах и колледжах в центрах OSDDChem, передаются в базу данных OSDDChem и отправляются в CSIR-CDRI. Эти молекулы затем подвергаются скринингу в CSIR-CDRI на предмет противотуберкулезной и противомалярийной активности. ^[26]^[27]

См. также

Ссылки

^ Jump up to: ^а ^б ^с Бхардвадж, Аншу; Скариа, Винод; Рагхава, Гаджендра Пал Сингх; Линн, Эндрю Майкл; Чандра, Нагасума; Банерджи, Суланья; Рагунанданан, Мутукурусси В.; Панди, Викас; Танеджа, Бхупеш; Ядав, Джьоти; Даш, Дебасис; Бхаттачарья, Джаджит; Мисра, Амит; Кумар, Анил; Рамачандран, Шринивасан; Томас, Закир; Брахмачари, Самир К.; Брахмачари, СК (2011). «Открытие лекарств с открытым исходным кодом - новая парадигма совместных исследований в области разработки лекарств от туберкулеза». Туберкулез . 91 (5): 479–486. дои : 10.1016/j.tube.2011.06.004 . ПМИД 21782516 . S2CID 5556982 .
^ Ордал, Кристина; Рёттинген, Джон-Арне (20 сентября 2012 г.). «Забытые тропические болезни PLOS: открытие лекарств с открытым исходным кодом на практике: практический пример» . PLOS Забытые тропические болезни . 6 (9). Plosntds.org: e1827. дои : 10.1371/journal.pntd.0001827 . ПМЦ 3447952 . ПМИД 23029588 .
^ Паллава Багла (24 февраля 2012 г.). «Краудсорсинговое открытие наркотиков». Наука . 335 (6071). Sciencemag.org: 909. Бибкод : 2012Sci...335..909B . дои : 10.1126/science.335.6071.909 . ПМИД 22362985 .
^ Дипа Куруп (17 декабря 2010 г.). «Примите философию открытого исходного кода, — советует Калам ученым и исследователям» . Индус . Thehindu.com . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с ^д «ОТКРЫТИЕ ЛЕКАРСТВ С ОТКРЫТЫМ ИСТОЧНИКОМ: ГЛОБАЛЬНАЯ СОВМЕСТНАЯ МОДЕЛЬ ОТКРЫТИЯ ЛЕКАРСТВ ДЛЯ ТУБЕРКУЛЕЗА» (PDF) . Scienceandcultural-isna.org\accessdate=30 апреля 2015 г.
^ Дхруба Джьоти Пуркайт (12 мая 2013 г.). «Где лекарства от тропических болезней? | Деловая линия» . Thehindubusinessline.com . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Виртуальное сотрудничество исследователей может снизить стоимость разработки жизненно важных лекарств – Business Today» . Businesstoday.intoday.in. 6 января 2013 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Открытие лекарств с открытым исходным кодом (OSDD)» . Openhealthnews.com . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б «Правительство побуждает молодые умы изобретать более дешевые лекарства – Timesofindia- EconomicTimes» . Статьи. Economictimes.indiatimes.com. 20 декабря 2007 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Присоединяйтесь к движению – открытие лекарств с открытым исходным кодом» . Осдд.нет . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Сима Сингх (апрель 2008 г.). «Индия использует подход с открытым исходным кодом к открытию лекарств» . Клетка . 133 (2): 201–203. дои : 10.1016/j.cell.2008.04.003 . ПМИД 18423188 .
^ «Самир Брахмачари - 10 лучших биотехнологических специалистов по версии Fierce» . FierceBiotechit.com. 23 марта 2012 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Jump up to: ^а ^б «О нас — Открытие лекарств с открытым исходным кодом» . Осдд.нет . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Открытие лекарств с открытым исходным кодом — Timesofindia- EconomicTimes» . Статьи. Economictimes.indiatimes.com. 21 декабря 2007 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Сачин С. Рават (5 марта 2013 г.). «Открытие лекарств с открытым исходным кодом | Биолог-мечтатель» . Dreamerbiological.wordpress.com . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «OSDD — служба единого входа» . Sysborg2.osdd.net . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Блог Джеймона Джозефа: Facebook для лабораторных халатов» . Ibnlive.in.com. 2011-09-23. Архивировано из оригинала 26 сентября 2011 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Фармацевтические компании Pvt обращаются к CSIR с просьбой разработать противотуберкулезный препарат» . Таймс оф Индия . 15 апреля 2011 г. Архивировано из оригинала 7 января 2014 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Открытие лекарств с открытым исходным кодом (OSDD)» . Zunia.org. 2012-03-02 . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Бюро информации для прессы (15 сентября 2008 г.). «CSIR запускает открытие лекарств с открытым исходным кодом: новаторское исследование людей, людьми и для людей» . dst.gov.in. Департамент науки и технологий, Индия . Проверено 7 января 2014 г.
^ Jump up to: ^а ^б ^с Директор проекта «Открытие лекарств с открытым исходным кодом». « «ОТКРЫТОЕ ОТКРЫТИЕ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ» ОТКРЫТАЯ СОВМЕСТНАЯ МОДЕЛЬ ОТКРЫТИЯ ЛЕКАРСТВ ДЛЯ ТУБЕРКУЛЕЗА» (PDF) . www.who.int . Всемирная организация здравоохранения, Женева . Проверено 7 января 2014 г.
^ «Центр выделяет финансирование в размере 150 рупий на проект CSIR по открытию лекарств с открытым исходным кодом | CSIR в новостях» . Csirindia.wordpress.com. 27 мая 2011 г. Проверено 30 апреля 2015 г.
^ «Журнал Forbes India - Как открытие лекарств с открытым исходным кодом помогает Индии разрабатывать новые лекарства» . Forbesindia.com . Проверено 30 апреля 2015 г.
^ Бхардвадж, А; Бхартия, Д; Кумар, Н; Консорциум по открытию лекарств с открытым исходным кодом; Скария, В. (2009). «TBrowse: Интегративная геномная карта микобактерий туберкулеза». Туберкулез (Эдинбург, Шотландия) . 89 (5): 386–7. дои : 10.1016/j.tube.2009.07.005 . ПМИД 19683474 .
^ НКБИ. «Консорциум по открытию лекарств с открытым исходным кодом [корпоративный автор]» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . Проверено 7 января 2014 г.
^ Химанши Дхаван (18 сентября 2013 г.). «CSIR настаивает на борьбе с туберкулезом, найдено лекарство от малярии» . Таймс оф Индия . Bennett, Coleman & Co. Ltd. Архивировано из оригинала 20 сентября 2013 года . Проверено 7 января 2014 г.
^ «Открытый фармацевтический проект» . open-pharma.org . Проверено 25 июня 2021 г.

Внешние ссылки

[sciencedirect1-1] Jump up to: ^а ^б ^с Бхардвадж, Аншу; Скариа, Винод; Рагхава, Гаджендра Пал Сингх; Линн, Эндрю Майкл; Чандра, Нагасума; Банерджи, Суланья; Рагунанданан, Мутукурусси В.; Панди, Викас; Танеджа, Бхупеш; Ядав, Джьоти; Даш, Дебасис; Бхаттачарья, Джаджит; Мисра, Амит; Кумар, Анил; Рамачандран, Шринивасан; Томас, Закир; Брахмачари, Самир К.; Брахмачари, СК (2011). «Открытие лекарств с открытым исходным кодом - новая парадигма совместных исследований в области разработки лекарств от туберкулеза». Туберкулез . 91 (5): 479–486. дои : 10.1016/j.tube.2011.06.004 . ПМИД 21782516 . S2CID 5556982 .

[2] Ордал, Кристина; Рёттинген, Джон-Арне (20 сентября 2012 г.). «Забытые тропические болезни PLOS: открытие лекарств с открытым исходным кодом на практике: практический пример» . PLOS Забытые тропические болезни . 6 (9). Plosntds.org: e1827. дои : 10.1371/journal.pntd.0001827 . ПМЦ 3447952 . ПМИД 23029588 .

[3] Паллава Багла (24 февраля 2012 г.). «Краудсорсинговое открытие наркотиков». Наука . 335 (6071). Sciencemag.org: 909. Бибкод : 2012Sci...335..909B . дои : 10.1126/science.335.6071.909 . ПМИД 22362985 .

[4] Дипа Куруп (17 декабря 2010 г.). «Примите философию открытого исходного кода, — советует Калам ученым и исследователям» . Индус . Thehindu.com . Проверено 30 апреля 2015 г.

[scienceandculture-isna1-5] Jump up to: ^а ^б ^с ^д «ОТКРЫТИЕ ЛЕКАРСТВ С ОТКРЫТЫМ ИСТОЧНИКОМ: ГЛОБАЛЬНАЯ СОВМЕСТНАЯ МОДЕЛЬ ОТКРЫТИЯ ЛЕКАРСТВ ДЛЯ ТУБЕРКУЛЕЗА» (PDF) . Scienceandcultural-isna.org\accessdate=30 апреля 2015 г.

[6] Дхруба Джьоти Пуркайт (12 мая 2013 г.). «Где лекарства от тропических болезней? | Деловая линия» . Thehindubusinessline.com . Проверено 30 апреля 2015 г.

[intoday1-7] Jump up to: ^а ^б «Виртуальное сотрудничество исследователей может снизить стоимость разработки жизненно важных лекарств – Business Today» . Businesstoday.intoday.in. 6 января 2013 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[8] «Открытие лекарств с открытым исходным кодом (OSDD)» . Openhealthnews.com . Проверено 30 апреля 2015 г.

[indiatimes2007-9] Jump up to: ^а ^б «Правительство побуждает молодые умы изобретать более дешевые лекарства – Timesofindia- EconomicTimes» . Статьи. Economictimes.indiatimes.com. 20 декабря 2007 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[10] «Присоединяйтесь к движению – открытие лекарств с открытым исходным кодом» . Осдд.нет . Проверено 30 апреля 2015 г.

[11] Сима Сингх (апрель 2008 г.). «Индия использует подход с открытым исходным кодом к открытию лекарств» . Клетка . 133 (2): 201–203. дои : 10.1016/j.cell.2008.04.003 . ПМИД 18423188 .

[12] «Самир Брахмачари - 10 лучших биотехнологических специалистов по версии Fierce» . FierceBiotechit.com. 23 марта 2012 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[autogenerated1-13] Jump up to: ^а ^б «О нас — Открытие лекарств с открытым исходным кодом» . Осдд.нет . Проверено 30 апреля 2015 г.

[14] «Открытие лекарств с открытым исходным кодом — Timesofindia- EconomicTimes» . Статьи. Economictimes.indiatimes.com. 21 декабря 2007 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[15] Сачин С. Рават (5 марта 2013 г.). «Открытие лекарств с открытым исходным кодом | Биолог-мечтатель» . Dreamerbiological.wordpress.com . Проверено 30 апреля 2015 г.

[16] «OSDD — служба единого входа» . Sysborg2.osdd.net . Проверено 30 апреля 2015 г.

[17] «Блог Джеймона Джозефа: Facebook для лабораторных халатов» . Ibnlive.in.com. 2011-09-23. Архивировано из оригинала 26 сентября 2011 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[18] «Фармацевтические компании Pvt обращаются к CSIR с просьбой разработать противотуберкулезный препарат» . Таймс оф Индия . 15 апреля 2011 г. Архивировано из оригинала 7 января 2014 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[zunia1-19] «Открытие лекарств с открытым исходным кодом (OSDD)» . Zunia.org. 2012-03-02 . Проверено 30 апреля 2015 г.

[20] Бюро информации для прессы (15 сентября 2008 г.). «CSIR запускает открытие лекарств с открытым исходным кодом: новаторское исследование людей, людьми и для людей» . dst.gov.in. Департамент науки и технологий, Индия . Проверено 7 января 2014 г.

[who-21] Jump up to: ^а ^б ^с Директор проекта «Открытие лекарств с открытым исходным кодом». « «ОТКРЫТОЕ ОТКРЫТИЕ ЛЕКАРСТВЕННЫХ СРЕДСТВ» ОТКРЫТАЯ СОВМЕСТНАЯ МОДЕЛЬ ОТКРЫТИЯ ЛЕКАРСТВ ДЛЯ ТУБЕРКУЛЕЗА» (PDF) . www.who.int . Всемирная организация здравоохранения, Женева . Проверено 7 января 2014 г.

[22] «Центр выделяет финансирование в размере 150 рупий на проект CSIR по открытию лекарств с открытым исходным кодом | CSIR в новостях» . Csirindia.wordpress.com. 27 мая 2011 г. Проверено 30 апреля 2015 г.

[23] «Журнал Forbes India - Как открытие лекарств с открытым исходным кодом помогает Индии разрабатывать новые лекарства» . Forbesindia.com . Проверено 30 апреля 2015 г.

[24] Бхардвадж, А; Бхартия, Д; Кумар, Н; Консорциум по открытию лекарств с открытым исходным кодом; Скария, В. (2009). «TBrowse: Интегративная геномная карта микобактерий туберкулеза». Туберкулез (Эдинбург, Шотландия) . 89 (5): 386–7. дои : 10.1016/j.tube.2009.07.005 . ПМИД 19683474 .

[25] НКБИ. «Консорциум по открытию лекарств с открытым исходным кодом [корпоративный автор]» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США . Проверено 7 января 2014 г.

[himanshi-26] Химанши Дхаван (18 сентября 2013 г.). «CSIR настаивает на борьбе с туберкулезом, найдено лекарство от малярии» . Таймс оф Индия . Bennett, Coleman & Co. Ltd. Архивировано из оригинала 20 сентября 2013 года . Проверено 7 января 2014 г.

[27] «Открытый фармацевтический проект» . open-pharma.org . Проверено 25 июня 2021 г.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]

[12]

[13]

[14]

[15]

[16]

[17]

[18]

[19]

[20]

[21]

[22]

[23]

[24]

[25]

[26]

[27]