Роберт Стивенс (ученый)
Роберт Стивенс | |
---|---|
![]() Роберт Стивенс | |
Рожденный | Роберт Дэвид Стивенс 11 февраля 1965 г. |
Национальность | Британский |
Альма-матер |
|
Известный | ТАМБИС [6] [7] [8] |
Научная карьера | |
Поля | |
Учреждения | Манчестерский университет |
Диссертация | Принципы проектирования слуховых интерфейсов для представления сложной информации слепым людям (1996 г.) |
Докторантура | Алистер Эдвардс [5] |
Веб-сайт | www |
Роберт Дэвид Стивенс (1965 г.р.) — профессор биомедицины информатики . [9] [10] и бывший заведующий кафедрой компьютерных наук . Манчестерского университета [11]
Образование
[ редактировать ]Стивенс получил степень бакалавра наук в области биохимии в Бристольском университете в 1986 году. [12] степень магистра наук в области биоинформатики в 1991 году и степень доктора компьютерных наук в 1996 году, оба — в Йоркском университете . [5]
Карьера и исследования
[ редактировать ]Текущие исследовательские интересы Стивенса [4] [13] [14] [15] являются построение биологических онтологий , [16] [17] такие как Генная Онтология , [18] [19] [20] [21] и примирение семантической неоднородности [22] в биоинформатике. [23] [24] Это исследование финансировалось Исследовательским советом инженерных и физических наук (EPSRC) . [25] [26] Исследовательский совет по биотехнологиям и биологическим наукам (BBSRC) [27] и Европейский Союз . [28]
Стивенс был главным исследователем ряда исследовательских проектов, включая Ondex, [29] [30] КомпараГрид, [31] SWAT (инструмент разработки семантической сети) [25] и Сеть онтогенеза. [25]
Стивенс был председателем программы и соорганизатором Международной конференции по биомедицинской онтологии (ICBO) 2012 г. [32] и стал сооснователем UK Ontology Network. [33] Он также участвовал в работе Группы по интересам в области здравоохранения и биологических наук (HCLSIG) Консорциума Всемирной паутины (W3C) . [34] Стивенс в настоящее время входит в редакционную коллегию журнала «Биомедицинская семантика» . [35] Стивенс начинал как преподаватель , затем стал старшим преподавателем, доцентом и в августе 2013 года стал профессором.
Стивенс преподавал на нескольких курсах бакалавриата и магистратуры по разработке программного обеспечения, базам данных, биоинформатике, а также проводит вводные и продвинутые курсы по языку веб-онтологии . Он был главным научным руководителем пяти успешных аспирантов. [36] [37] [38] [39] [40] и совместно руководил несколькими другими. [41] [42] [43]
С июля 2016 года он занимает должность заведующего кафедрой компьютерных наук Манчестерского университета. [11]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Филд, Д.; Гаррити, Дж.; Грей, Т.; Моррисон, Н.; Селенгут, Дж.; Стерк, П.; Татусова Т.; Томсон, Н.; Аллен, MJ; Ангиуоли, СВ; Эшбернер, М.; Аксельрод, Н.; Балдауф, С.; Баллард, С.; Бур, Дж.; Кокрейн, Г.; Коул, Дж.; Давиндт, П.; Де Вос, П.; Депамфилис, К.; Эдвардс, Р.; Фарук, Н.; Фельдман, Р.; Гилберт, Дж.; Гилна, П.; Глекнер, Ф.О.; Гольдштейн, П.; Гуральник, Р.; Хафт, Д.; и др. (2008). «Минимальная информация о спецификации последовательности генома (MIGS)» . Природная биотехнология . 26 (5): 541–7. дои : 10.1038/nbt1360 . ПМК 2409278 . ПМИД 18464787 .
- ^ Гобл, К. ; Харпер, С.; Стивенс, Р. (2000). «Труды слабовидящих веб-путешественников» (PDF) . Материалы одиннадцатого ACM по гипертексту и гипермедиа - ГИПЕРТЕКСТ '00 . п. 1. дои : 10.1145/336296.336304 . ISBN 978-1581132274 . S2CID 7099946 .
- ^ Стивенс, Роберт (2007). «День из жизни ученого-инвалида (?): Незрячий в науке» (PDF) . Биохимик . дои : 10.1042/BIO02903030 . Проверено 20 июня 2013 г.
- ^ Jump up to: а б Публикации Роберта Стивенса , индексируемые Google Scholar
- ^ Jump up to: а б Стивенс, Роберт Дэвид (1996). Принципы проектирования слуховых интерфейсов для представления сложной информации слепым людям (PDF) (кандидатская диссертация). Университет Йорка. OCLC 931328170 . EThOS uk.bl.ethos.319718 .
- ^ Гобл, Калифорния ; Стивенс, Р .; Нг, Г.; Беххофер, С.; Патон, Северо-Запад ; Бейкер, П.Г.; Пейм, М.; Брасс, А. (2001). «Прозрачный доступ к множеству источников биоинформатической информации» (PDF) . IBM Systems Journal . 40 (2): 532–551. дои : 10.1147/sj.402.0532 .
- ^ Стивенс, Р .; Бейкер, П.; Беххофер, С.; Нг, Г.; Джейкоби, А.; Патон, Северо-Запад ; Гобл, Калифорния ; Брасс, А. (2000). «ТАМБИС: прозрачный доступ к многочисленным источникам биоинформатической информации» . Биоинформатика . 16 (2): 184–185. дои : 10.1093/биоинформатика/16.2.184 . ПМИД 10842744 .
- ^ Бейкер, П.Г.; Брасс, А.; Беххофер, С.; Гобл, К.; Патон, Н.; Стивенс, Р. (1998). «ТАМБИС - прозрачный доступ к многочисленным источникам биоинформатической информации». Слушания. Международная конференция по интеллектуальным системам молекулярной биологии . 6 : 25–34. ПМИД 9783206 .
- ^ «Профессор Роберт Стивенс, профиль исследования – личные данные (Манчестерский университет)» . Архивировано из оригинала 28 декабря 2011 года . Проверено 10 июня 2012 г.
- ^ Кляйн, Дж.; Илс, Дж.; Цюрбиг, П.; Влаху, А.; Мишак, Х.; Стивенс, Р. (2013). «Proteasix: инструмент для автоматического и крупномасштабного прогнозирования протеаз, участвующих в генерации естественных пептидов» . Протеомика . 13 (7): 1077–1082. дои : 10.1002/pmic.201200493 . ПМИД 23348921 . S2CID 8604093 .
- ^ Мэн, Ю.Б.; Стивенс, РД ; Китай, В.; МакГилл, С.; Эшбернер, М. (1988). «Пять генов глицил-тРНК в комплексе генов noc Drosophila melanogaster» . Исследования нуклеиновых кислот . 16 (14): 7189. doi : 10.1093/nar/16.14.7189 . ПМК 338370 . ПМИД 3136440 .
- ^ Роберт Стивенс на DBLP библиографическом сервере
- ^ Публикации Роберта Стивенса , индексируемые библиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
- ^ Роберта Стивенса Страница профиля автора ACM. в цифровой библиотеке
- ^ Мэлоун, Дж.; Браун, А.; Листер, Алабама; Айсон, Дж.; Халл, Д.; Паркинсон, Х.; Стивенс, Р. (2014). «Онтология программного обеспечения (SWO): ресурс для воспроизводимости анализа, курирования и цифрового сохранения биомедицинских данных» . Журнал биомедицинской семантики . 5:25 . дои : 10.1186/2041-1480-5-25 . ПМЦ 4098953 . ПМИД 25068035 .
- ^ Лорд, П.; Стивенс, Р. (2010). Фридберг, Иддо (ред.). «Добавление немного реальности к построению онтологий для биологии» . ПЛОС ОДИН . 5 (9): е12258. Бибкод : 2010PLoSO...512258L . дои : 10.1371/journal.pone.0012258 . ПМЦ 2933225 . ПМИД 20838431 .
- ^ Юпп, С.; Стивенс, Р .; Хендорф, Р. (2012). «Аннотации логических онтологий генов (ЦЕЛЬ): изучение аннотаций онтологий генов с помощью OWL» . Журнал биомедицинской семантики . 3 (Дополнение 1): S3. дои : 10.1186/2041-1480-3-S1-S3 . ПМК 3337258 . ПМИД 22541594 .
- ^ Каланкеш, ЛР; Стивенс, Р .; Брасс, А. (2012). «Язык онтологии генов: анализ закона Ципфа» . БМК Биоинформатика . 13 :127. дои : 10.1186/1471-2105-13-127 . ПМЦ 3473240 . ПМИД 22676436 .
- ^ Лорд, PW; Стивенс, РД ; Брасс, А.; Гобл, Калифорния (2003). «Меры семантического сходства как инструменты для изучения онтологии генов» (PDF) . Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 601–612. дои : 10.1142/9789812776303_0056 . ISBN 978-981-238-217-7 . ПМИД 12603061 .
- ^ Роу, CJ; Стивенс, Р .; Гобл, Калифорния ; Эшбернер, М. (2003). «Методология переноса онтологии генов в среду логики описания с использованием DAML+OIL». Тихоокеанский симпозиум по биокомпьютингу : 624–635. CiteSeerX 10.1.1.121.5880 . дои : 10.1142/9789812776303_0058 . ISBN 978-981-238-217-7 . ПМИД 12603063 .
- ^ «Семантическая гетерогенность в ресурсах биоинформатики» . Cs.man.ac.uk. Проверено 10 января 2019 г.
- ^ Лорд, PW; Стивенс, РД ; Брасс, А .; Гобл, Калифорния (2003). «Исследование мер семантического сходства в онтологии генов: взаимосвязь между последовательностью и аннотацией» . Биоинформатика . 19 (10): 1275–1283. doi : 10.1093/биоинформатика/btg153 . ПМИД 12835272 .
- ^ Гастингс, Дж.; Магка, Д.; Бэтчелор, К.; Дуань, Л.; Стивенс, Р .; Эннис, М.; Стейнбек, К. (2012). «Структурная классификация и онтология в химии» . Журнал хеминформатики . 4 :8. дои : 10.1186/1758-2946-4-8 . ПМК 3361486 . ПМИД 22480202 .
- ^ Jump up to: а б с «Гранты, предоставленные Роберту Стивенсу EPRSC» . Проверено 21 июня 2012 г.
- ^ «Архивная копия» . Архивировано из оригинала 22 февраля 2015 года . Проверено 22 февраля 2015 г.
{{cite web}}
: CS1 maint: архивная копия в заголовке ( ссылка ) - ^ «Сведения о следователе/руководителе — Роберт Стивенс @ BBSRC» . Проверено 21 июня 2012 г.
- ^ Дак, Г.; Ненадич, Г.; Брасс, А .; Робертсон, Д.Л.; Стивенс, Р. (2013). «BioNerDS: изучение использования баз данных и программного обеспечения в области биоинформатики посредством анализа литературы» . БМК Биоинформатика . 14 :194. дои : 10.1186/1471-2105-14-194 . ПМЦ 3693927 . ПМИД 23768135 .
- ^ Колер, Дж.; Баумбах, Дж.; Тауберт, Дж.; Шпехт, М.; Скуса, А.; Рюгг, А.; Роулингс, К.; Верье, П.; Филиппи, С. (2006). «Графический анализ и визуализация результатов экспериментов с помощью ONDEX» . Биоинформатика . 22 (11): 1383–1390. doi : 10.1093/биоинформатика/btl081 . ПМИД 16533819 .
- ^ «Подробности о награде BBSRC BB/F006012/1: Ondex» .
- ^ «Подробности о премии BBSRC BBS/B/17131: ComparaGrid - использование GRID-технологий для сравнительной геномики» .
- ^ «ИКБО ФОИС 2012» . Проверено 19 июня 2012 г.
- ^ Сеть онтологий Великобритании http://www.ukontology.org/
- ^ «Re: введение: Эрик Миллер, w3c от Роберта Стивенса 1 декабря 2005 г. ( [электронная почта защищена] от декабря 2005 г.)» . Lists.w3.org . Проверено 10 января 2019 г.
- ^ «Журнал биомедицинской семантики» . Журнал биомедицинской семантики . Проверено 10 января 2019 г.
- ^ Эганья Арангурен, Микель (2009). Роль и применение шаблонов проектирования онтологий в биоонтологиях (кандидатская диссертация). Университет Манчестера.
- ^ Бренчли, Рэйчел (2009). К автоматизированной аннотации протеинфосфатаз (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. OCLC 855121149 . EThOS uk.bl.ethos.509724 }.
- ^ Браун, Эндрю Дж. (2007). Невизуальное взаимодействие с графиками (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. Архивировано из оригинала 3 февраля 2014 года.
- ^ Фишер, Пол Райан (2009). К системному подходу к масштабному анализу генотип-фенотипических корреляций (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. OCLC 711956205 . EThOS uk.bl.ethos.516331 .
- ^ Халл, Дункан (2008). Семантическое сопоставление биоинформатических веб-сервисов (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. OCLC 1064135556 . EThOS uk.bl.ethos.497578 .
- ^ Ешилада, Елиз (2005). Аннотирование и преобразование веб-страниц для улучшения мобильности пользователей с нарушениями зрения (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. Копак 36711980 .
- ^ Чжао, июнь (2007). Концептуальная модель происхождения электронной науки (PDF) (кандидатская диссертация). Университет Манчестера. Архивировано из оригинала (PDF) 6 октября 2012 года.
- ^ «Профессор Роберт Стивенс - Манчестерский университет» . Research.manchester.ac.uk . Проверено 10 января 2019 г.