Дриада (хранилище)
 | |
| Разработчик(и) | Национальный центр эволюционного синтеза , UNC-CH Центр исследования метаданных , Оксфордский университет , Британская библиотека , Калифорнийская цифровая библиотека |
|---|---|
| Первоначальный выпуск | Январь 2008 г. |
| Репозиторий | |
| Написано в | Руби |
| Лицензия | Новая лицензия BSD |
| Веб-сайт | данные сухие |
Dryad — это международное с открытым доступом хранилище исследовательских данных , особенно данных, лежащих в основе научных и медицинских публикаций (в основном по эволюционной, генетической и экологической биологии). Dryad — это курируемый репозиторий общего назначения, который делает данные доступными для обнаружения, свободного повторного использования и цитирования. Научная, образовательная и благотворительная миссия «Дриады» — обеспечить инфраструктуру и способствовать повторному использованию данных научных исследований.
Концепция Dryad — это научная коммуникационная система, в которой научные общества, издатели, научно-исследовательские и образовательные учреждения, финансирующие организации и другие заинтересованные стороны совместно поддерживают и способствуют сохранению и повторному использованию исследовательских данных.
Цель Dryad — предоставить исследователям возможность проверять опубликованные результаты, изучать новые методологии анализа, повторно использовать данные для решения исследовательских вопросов, непредвиденных первоначальными авторами, а также проводить синтетические исследования, такие как формальный метаанализ. Для многих публикаций существующие хранилища данных не охватывают весь пакет данных. В результате многие важные наборы данных не сохраняются и больше не доступны и не пригодны для использования в то время, когда их ищут последующие исследователи. [1]
Dryad служит хранилищем таблиц, электронных таблиц, плоских файлов и всех других видов опубликованных данных, для которых еще не существует специализированных хранилищ. Оптимально, чтобы авторы отправляли данные в Dryad одновременно с публикацией статьи, чтобы ссылки на данные можно было включить в опубликованную статью. Все файлы данных в Dryad связаны с опубликованной статьей и доступны для повторного использования на условиях отказа Creative Commons Zero .
Dryad также является некоммерческой членской организацией, зарегистрированной в США, которая предоставляет всем заинтересованным сторонам форум, позволяющий устанавливать приоритеты для хранилища, участвовать в планировании, делиться знаниями и координировать действия в отношении политики обработки данных.
Dryad внесена в реестр хранилищ исследовательских данных re3data.org. [2]
Функции
[ редактировать ]
Dryad позволяет авторам, журналам, обществам и издателям облегчить архивирование данных во время публикации, когда данные легко доступны. Данные в Dryad получают постоянный уникальный идентификатор цифрового объекта (DOI), который можно включить в публикуемую статью, чтобы читатели могли получить доступ к данным. Авторы могут архивировать данные в Dryad и быть уверенными в их сохранности, одновременно выполняя требования журналов и агентств по финансированию исследований по распространению результатов своих исследований. [3]
Авторы отправляют данные в Dryad либо тогда, когда соответствующая статья находится на рассмотрении, либо когда она принята к публикации. Выбор зависит от того, включает ли журнал данные в сферу рецензирования. Авторы также могут предоставить данные после публикации статьи.
Предоставлению данных способствуют журналы, отправляющие в Dryad уведомления о новых рукописях. Это избавляет авторов от необходимости повторно вводить библиографические данные при загрузке файлов данных.
Кураторы Dryad просматривают отправленные файлы данных и выполняют контроль качества описаний метаданных перед включением нового контента в репозиторий. Подход к метаданным Dryad подчеркивает простоту и совместимость, поддерживаемые профилем Dublin Core метаданных приложения . Центр исследования метаданных, который сейчас находится в Колледже вычислительной техники и информатики Университета Дрекселя , раньше служил центральным кураторским центром Dryad, а основная кураторская деятельность теперь осуществляется через некоммерческую организацию в Северной Каролине. [4]
Dryad координирует отправку данных в специализированные репозитории, где, чтобы (а) снизить нагрузку на пользователей за счет оптимизации рабочего процесса отправки и (б) позволить Dryad и специализированным репозиториям обмениваться идентификаторами и другими метаданными, чтобы обеспечить перекрестные ссылки на различные связанные продукты данных. с данной публикацией. Первыми двумя партнерами по рукопожатию являются TreeBASE и GenBank , которые журналы-партнеры Dryad ранее определили как необходимые точки хранения данных филогенетического дерева и последовательностей ДНК соответственно.
Управление, история и финансирование
[ редактировать ]Dryad управляется Советом директоров , состоящим из двенадцати членов , избираемых ее членами. Членами могут быть независимые журналы, общества, издатели, исследовательские и образовательные учреждения, библиотеки, спонсоры или другие организации, поддерживающие миссию Dryad. Организация координирует политику обмена данными и способствует долгосрочной устойчивости хранилища.
Dryad начала взимать плату за подачу заявок в сентябре 2013 года. Dryad — это некоммерческая организация, которая предоставляет долгосрочный бесплатный доступ к своему содержимому исследователям, преподавателям и студентам, независимо от национальности или институциональной принадлежности. Dryad может предоставить бесплатный доступ к данным благодаря финансовой поддержке со стороны участников и отправителей данных. Плата за отправку данных Dryad предназначена для поддержания ее основных функций путем возмещения основных затрат на обработку и сохранение данных.
«Дриада» возникла на семинаре Национального центра эволюционного синтеза (NESCent) под названием «Сохранение, обмен и открытие цифровых данных: проблемы для малых научных сообществ в цифровую эпоху» в мае 2007 года. Первоначальное финансирование «Дриады» было предоставлено научным фондом Национальным Национальный центр эволюционного синтеза и другие партнеры в США.
DryadUK был проектом, финансируемым Jisc, который осуществлялся Британской библиотекой и Оксфордским университетом в партнерстве с NESCent, Центром цифрового курирования и Charles Beagrie Ltd. Проект привел к созданию британского зеркала репозитория Dryad, расположенного в Британской библиотеке. Проект также улучшил инструменты, доступные для публикации и цитирования данных, расширил дисциплинарный диапазон участвующих журналов и продолжил развитие бизнес-структуры для международной организации, занимающейся долгосрочным сохранением данных.
В 2019 году Dryad объявила о партнерстве с другим хранилищем данных Zenodo для совместной разработки новых решений, ориентированных на поддержку рабочих процессов исследователей и издателей, а также передовых практик в области программного обеспечения и управления данными . [5]
Дриада является членом Сети наблюдения за данными на Земле ( DataONE ).
Программное обеспечение
[ редактировать ]Первоначально Dryad была основана на программном обеспечении репозитория DSpace с открытым исходным кодом , разработанном Массачусетским технологическим институтом и Hewlett-Packard . В 2019 году Dryad перешла на платформу публикации данных Ruby-on-Rails с открытым исходным кодом под названием Stash.
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Vision, TJ (2010) Открытые данные и общественный договор научных публикаций. BioScience 60(5):330-330. два : 10.1525/bio.2010.60.5.2
- ^ «Запись о дриаде на re3data.org» . www.re3data.org . Проверено 21 июля 2014 г.
- ^ Архивирование данных. Майкл К. Уитлок, Марк А. МакПик, Марк Д. Раушер, Лорен Ризеберг и Аллен Дж. Мур, Американский натуралист, Vol. 175, № 2 (февраль 2010 г.), стр. 145-146. дои : 10.1086/650340
- ^ Гринберг Дж., Уайт Х., К., Кэрриер К. и Шерл Р. (2009). Лучшая практика метаданных для хранилища научных данных. Журнал библиотечных метаданных, 9:3, 194–212. дои : 10.1080/19386380903405090
- ^ Шельд, Мелиссанна (17 июля 2019 г.). «Финансируемое партнерство сближает Дриаду и Зенодо» . Новости и мнения Дриад . Проверено 08.11.2019 .