Библиотека программного обеспечения FMRIB
| Разработчик(и) | Группа анализа FMRIB |
|---|---|
| Стабильная версия | 6.0.1 / 11 марта 2019 г |
| Написано в | С++, ТКЛ |
| Операционная система | Линукс , МакОС |
| Доступно в | Английский |
| Тип | Научная визуализация и обработка изображений |
| Лицензия | Индивидуальный, некоммерческий |
| Веб-сайт | фсл |
Библиотека программного обеспечения FMRIB , сокращенно FSL , представляет собой библиотеку программного обеспечения, содержащую анализ изображений и статистические инструменты для получения данных функциональной , структурной и диффузной МРТ головного мозга.
FSL доступен как в виде предварительно скомпилированных двоичных файлов, так и в виде исходного кода для компьютеров Apple и ПК ( Linux ). Он находится в свободном доступе для некоммерческого использования.
Функциональность FSL [ править ]
| Функциональная МРТ | |
|---|---|
| ПОДВИГ | Анализ FMRI на основе модели с простым, но мощным графическим интерфейсом пользователя: предварительная обработка данных (включая коррекцию синхронизации срезов, коррекцию движения MCFLIRT и развертку PRELUDE+FUGUE EPI); Анализ временных рядов FILM GLM с предварительным отбеливанием; регистрация на структурных и/или эталонных космических изображениях; и полностью обобщенный групповой анализ смешанных эффектов с использованием передовых байесовских методов. |
| МЕЛОДИКА | Безмодельный анализ FMRI с использованием вероятностного анализа независимых компонентов (PICA). MELODIC автоматически оценивает количество интересных источников шума и сигналов в данных и благодаря связанной «модели шума» может назначать значения («p-значения») выходным пространственным картам. |
| ФЛОБЫ | Генерация оптимальных базисных функций HRF и оценка байесовской активации. |
| СММ | Моделирование пространственной смеси - проверка альтернативных гипотез с использованием моделирования смеси гистограмм с пространственной регуляризацией классификации вокселей на активацию и неактивацию. |
| Структурная МРТ | |
| НО / СТАВКА2 | Инструмент извлечения мозга — сегментирует мозг от немозговых структур по структурным и функциональным данным, а также моделирует поверхности черепа и скальпа. [1] |
| СЬЮЗЕН | Нелинейное шумоподавление. |
| БЫСТРЫЙ | Инструмент автоматической сегментации FMRIB – сегментация мозга (на различные типы тканей) и коррекция поля смещения. |
| ФЛИРТОВАТЬ | Инструмент регистрации линейных изображений FMRIB – линейная интер- и интрамодальная регистрация. [2] |
| ФУГА | Устраняет геометрические искажения в изображениях EPI с использованием карт полей B 0 . |
| СИЕНА | Анализ структурных изменений мозга для оценки атрофии мозга. |
| Диффузионная МРТ | |
| ФДТ | FMRIB's Diffusion Toolbox - инструменты для реконструкции параметров диффузии низкого уровня и вероятностной трактографии. |
| ТБСС | Пространственная статистика на основе участков (часть набора инструментов FMRIB Diffusion Toolbox) – воксельный анализ данных диффузии по нескольким субъектам. [3] |
| Другие инструменты | |
| Вывод | Различные инструменты вывода/порогового определения, в том числе: Randomise (инструмент вывода на основе перестановок для непараметрического статистического определения порогов), кластер (пороговое определение на основе кластеров с использованием теории GRF для вывода), FDR (вывод о частоте ложных открытий) и Glm (графический интерфейс для создания модели). матрицы). |
| FSLeyes | Инструмент интерактивного отображения 3D и 4D данных. |
| АВВУТИЛС | Различные утилиты для преобразования и обработки изображений. |
и развитие История
FSL написан в основном членами аналитической группы FMRIB (функциональная магнитно-резонансная томография мозга), Оксфорд.Университет, Великобритания. Первый выпуск FSL состоялся в 2000 году; былона сегодняшний день примерно один крупный новый выпуск каждый год. ФМРИБAnalysis Group в основном финансируется Wellcome Trust Великобритании и EPSRC . MRC Исследовательские советы .
См. также [ править ]
Внешние ссылки [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ С.М. Смит. Быстрое и надежное автоматическое извлечение мозга . Картирование человеческого мозга, 17(3):143-155, ноябрь 2002 г.
- ^ Дженкинсон М., Баннистер П., Брейди Дж. М. и Смит С. М. Улучшенная оптимизация для надежной и точной линейной регистрации и коррекции движения изображений мозга . НейроИмидж, 17(2), 825-841, 2002.
- ^ С. М. Смит, М. Дженкинсон, Х. Йохансен-Берг, Д. Рюкерт, Т. Э. Николс, К. Э. Маккей, К. Е. Уоткинс, О. Сиссарелли, М. З. Кадер, П. М. Мэтьюз и Т. Дж. Беренс. Пространственная статистика на основе трактов: воксельный анализ данных диффузии по нескольким субъектам . НейроИмидж, 31:1487-1505, 2006.
Категории :
- Программное обеспечение для обработки изображений
- Компьютеры в медицинской визуализации
- Исследовательский совет инженерных и физических наук
- Организации информационных технологий, базирующиеся в Соединенном Королевстве
- Нейровизуализация
- Программное обеспечение для нейровизуализации
- Организации, связанные с Оксфордским университетом
- Велком Траст
- Организации, созданные в 2012 году
- 2012 заведения в Великобритании