Гиперчувствительный сайт

Гиперчувствительные участки ДНКазы I в хроматине

В генетике представляет гиперчувствительный участок собой короткий участок хроматина и выявляется по его сверхчувствительности к расщеплению ДНКазой I и другими различными нуклеазами ( ДНКазой II и микрококковыми нуклеазами ). В сверхчувствительном сайте нуклеосомная структура менее компактна, что увеличивает доступность ДНК для связывания с белками, такими как факторы транскрипции и ДНКаза I. Эти сайты ответственны за многие наследственные тенденции.

Расположение

Сверхчувствительные участки обнаружены на каждом активном гене, и многие из этих генов часто имеют более одного сверхчувствительного участка. Чаще всего гиперчувствительные сайты обнаруживаются только в хроматине клеток, в которых экспрессируется ассоциированный ген, и не возникают, когда ген неактивен.

В транскрибируемой ДНК 5'-сверхчувствительные сайты появляются до начала транскрипции, и последовательности ДНК внутри сверхчувствительных сайтов необходимы для экспрессии генов . Примечание: сверхчувствительные сайты предшествуют активным промоторам .

Гиперчувствительные сайты образуются в результате связывания транскрипционных факторов , вытесняющих октамеры гистонов .

Их также можно обнаружить путем косвенной маркировки концов. Фрагмент ДНК разрезается один раз в сверхчувствительном участке с помощью ДНКазы и в другом участке с помощью фермента рестрикции . Затем измеряют расстояние от известного сайта рестрикции до разреза ДНКазы, чтобы определить местоположение.