Целенаправленное проецирование

Пример целенаправленного преследования проекций — В этом примере целенаправленная проекция используется для изучения проекций набора данных об экспрессии генов . Каждая из 122 точек соответствует образцу, взятому из раковой опухоли четырех диагностических классов (отмечены цветом). Для каждого образца регистрировали уровень экспрессии 100 генов (отмечены осями). На анимации видно, что TPP может четко разделить два класса (красный и фиолетовый), но два других (синий и зеленый) различить невозможно. Положение осей указывает на активацию того, какие гены наиболее связаны с каждым классом.

Целенаправленное проецирование — это тип статистического метода, используемый для исследовательского анализа данных , визуализации информации и выбора признаков . Это позволяет пользователю в интерактивном режиме исследовать очень сложные данные (обычно имеющие от десятков до сотен атрибутов) для поиска функций или закономерностей, представляющих потенциальный интерес.

Обычный, или «слепой», поиск проекций находит наиболее «интересные» возможные проекции в многомерных данных, используя алгоритм поиска , который оптимизирует некоторый фиксированный критерий «интересности», например, отклонение от нормального распределения . Напротив, целенаправленное отслеживание проекций позволяет пользователю исследовать пространство проекций, манипулируя точками данных непосредственно на интерактивной диаграмме рассеяния .

Поиск целенаправленных проекций нашел применение в анализе данных микрочипов ДНК , ^[1] белка анализ последовательности , ^[2] макет графика ^[3] и цифровая обработка сигналов . ^[4] Он доступен в виде пакета для набора WEKA инструментов машинного обучения .

Ссылки

^ Вера, Джозеф; Роберт Минтрам; Майя Ангелова (2006). «Целевая проекция для визуализации классификаций данных об экспрессии генов» (PDF) . Биоинформатика . 22 (21): 2667–267. doi : 10.1093/биоинформатика/btl463 . ПМИД 16954139 .
^ Хэддоу, Крис; Маркус Дюррант; Джастин Перри; Джо Фейт (2011). «Прогнозирование функциональных остатков выравнивания белковых последовательностей как задача выбора признака». Международный журнал интеллектуального анализа данных и биоинформатики . 5 (6): 691–705. дои : 10.1504/IJDMB.2011.045417 . ПМИД 22295751 .
^ Гибсон, Хелен; Джо Фейт (2011). «Схема графа атрибутов узлов для сетей малого мира» . Материалы 15-й Международной конференции по визуализации информации .
^ Суджан, Раджбхандари; Джо Фейт (2010). «Использование линейных проекций при визуальном анализе сигналов во внутренней оптической беспроводной линии связи». 2010 7-й Международный симпозиум по системам связи, сетям и цифровой обработке сигналов (CSNDSP 2010) . IEEE. стр. 576–581. дои : 10.1109/CSNDSP16145.2010.5580367 . ISBN 978-1-4244-8858-2 .

Дальнейшее чтение

Джо Фейт (2007) «Целевая проекция для интерактивного исследования наборов многомерных данных» , материалы 11-й Международной конференции по визуализации информации.

Внешние ссылки

imDEV для целевых проекций с использованием выбора функций в сочетании с PLS и PLS-DA Бесплатная надстройка Excel
Страница проекта Targeted Projection Pursuit

Эта статистике статья, посвященная , незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Вера, Джозеф; Роберт Минтрам; Майя Ангелова (2006). «Целевая проекция для визуализации классификаций данных об экспрессии генов» (PDF) . Биоинформатика . 22 (21): 2667–267. doi : 10.1093/биоинформатика/btl463 . ПМИД 16954139 .

[2] Хэддоу, Крис; Маркус Дюррант; Джастин Перри; Джо Фейт (2011). «Прогнозирование функциональных остатков выравнивания белковых последовательностей как задача выбора признака». Международный журнал интеллектуального анализа данных и биоинформатики . 5 (6): 691–705. дои : 10.1504/IJDMB.2011.045417 . ПМИД 22295751 .

[3] Гибсон, Хелен; Джо Фейт (2011). «Схема графа атрибутов узлов для сетей малого мира» . Материалы 15-й Международной конференции по визуализации информации .

[4] Суджан, Раджбхандари; Джо Фейт (2010). «Использование линейных проекций при визуальном анализе сигналов во внутренней оптической беспроводной линии связи». 2010 7-й Международный симпозиум по системам связи, сетям и цифровой обработке сигналов (CSNDSP 2010) . IEEE. стр. 576–581. дои : 10.1109/CSNDSP16145.2010.5580367 . ISBN 978-1-4244-8858-2 .

[1]

[2]

[3]

[4]