Распространенное заболевание – распространенный вариант
Гипотеза общего варианта заболевания (часто сокращенно CD-CV , вызывающие заболевание ) предсказывает, что общие аллели или варианты , будут обнаружены во всех популяциях людей, у которых проявляется данное заболевание. Известно, что общие варианты (не обязательно вызывающие заболевания) существуют в кодирующих и регуляторных последовательностях генов. Согласно гипотезе CD-CV, некоторые из этих вариантов приводят к предрасположенности к сложным полигенным заболеваниям. Каждый вариант каждого гена, влияющий на сложное заболевание, будет иметь небольшой аддитивный или мультипликативный эффект на фенотип заболевания. Эти заболевания или черты эволюционно нейтральны отчасти потому, что на эти черты влияет очень много генов. Гипотеза подтвердилась в случае предполагаемых причинных вариантов аполипопротеина Е, включая APOE ε4, связанных с болезнью Альцгеймера . [1] IL23R Было обнаружено, что связан с болезнью Крона ; аллель риска встречается в общей популяции в 93% случаев. [ нужна ссылка ] .
Одна из распространенных форм вариаций в геномах человека называется однонуклеотидным полиморфизмом (SNP). Как следует из названия, SNP представляют собой изменения одного основания в ДНК. Варианты SNP, как правило, распространены в разных популяциях человека. Эти полиморфизмы оказались ценными в качестве геномных указателей или «маркеров» при поиске общих вариантов, влияющих на восприимчивость к распространенным заболеваниям. Исследования связали распространенные SNP с такими заболеваниями, как диабет 2 типа, болезнь Альцгеймера, шизофрения и гипертония . [2] [3] [4] [5] [6]
См. также
[ редактировать ]Ссылки
[ редактировать ]- ^ Расширенное генетическое исследование с высоким разрешением 109 шведских семей с болезнью Альцгеймера, Анна Силлен, Хорхе Андраде, Лена Лилиус, Шарлотта Форселл, Карин Аксельман, Якоб Одеберг, Бенгт Винблад и Кэролайн Графф, Европейский журнал генетики человека (2008) 16, 202 -208; дои : 10.1038/sj.ejhg.5201946 ; опубликовано в Интернете 24 октября 2007 г.
- ^ Дюрр, Р.Х.; Тейлор, К.Д.; Брант, СР; Риу, JD; Сильверберг, Миссисипи; Дейли, MJ ; Стейнхарт, АХ; Авраам, К.; Регейро, М.; Гриффитс, А.; Дассопулос, Т.; Биттон, А.; Ян, Х.; Тарган, С.; Датта, ЛВ; Кистнер, Е.О.; Шумм, ЛП; Ли, АТ; Грегерсен, ПК; Бармада, ММ; Роттер, Дж.И.; Николае, DL; Чо, Дж. Х. (2006). «Исследование общегеномных ассоциаций идентифицирует IL23R как ген воспалительного заболевания кишечника» . Наука 314 (5804): 1461–1463. Бибкод : 2006Sci... 314.1461D дои : 10.1126/science.1135245 . ISSN 0036-8075 . ПМК 4410764 . ПМИД 17068223 .
- ^ Леви, Дэниел; Эрет, Георг Б; Райс, Кеннет; Вервурт, Жермен С; Лаунер, Ленор Дж; Деган, Аббас; Глейзер, Николь Л; Моррисон, Аланна С; Джонсон, Эндрю Д; Аспелунд, Тор; Аульченко Юрий; Ламли, Томас; Кеттген, Анна; Васан, Рамачандран С; Риваденейра, Фернандо; Эйриксдоттир, Гудный; Го, Сюцин; Аркинг, Дэн Э; Митчелл, Гэри Ф; Маттаче-Расо, Франческо США; Смит, Альберт V; Тейлор, Кент; Шарпф, Роберт Б; Хван, Ши-Джен ; Сиджбрандс, Эрик Дж.Г.; Бис, Джошуа; Харрис, Тамара Б; Ганеш, Санти К; О'Доннелл, Кристофер Дж; Хоффман, Альберт; Роттер, Джером I; Кореш, Джозеф; Бенджамин, Эмилия Дж; Уиттерлинден, Андре Г; Хейсс, Херардо; Фокс, Кэролайн С; Виттеман, Жаклин CM; Бурвинкль, Эрик; Ван, Томас Дж; Гуднасон, Вилмундур; Ларсон, Мартин Дж; Чакраварти, Аравинда; Псати, Брюс М; ван Дуйн, Корнелия М (2009). «Полногеномное исследование ассоциации артериального давления и гипертонии» . Природная генетика . 41 (6): 677–687. дои : 10.1038/ng.384 . ISSN 1061-4036 . ПМК 2998712 . ПМИД 19430479 .
- ^ Стори, Джон Д.; Райчаудхури, Сумья; Пленге, Роберт М.; Россин, Элизабет Дж.; Нг, Эйлвин С.Ю.; Перселл, Шон М.; Склар, Памела; Скольник, Эдвард М.; Ксавье, Рамник Дж.; Альтшулер, Дэвид; Дейли, Марк Дж. (2009). «Идентификация взаимосвязей между регионами геномных заболеваний: прогнозирование генов в ассоциациях патогенных SNP и редких делециях» . ПЛОС Генетика . 5 (6): e1000534. дои : 10.1371/journal.pgen.1000534 . ISSN 1553-7404 . ПМЦ 2694358 . ПМИД 19557189 .
- ^ Сешадри, Судха (2010). «Полногеномный анализ генетических локусов, связанных с болезнью Альцгеймера» . ДЖАМА . 303 (18): 1832–1840. дои : 10.1001/jama.2010.574 . ISSN 0098-7484 . ПМЦ 2989531 . ПМИД 20460622 .
- ^ Зеггини, Элефтерия ; Скотт, Лаура Дж; Саксена, Рича; Войт, Бенджамин Ф; Марчини, Джонатан Л; Ху, Тианле; де Баккер, Пол IW; Абекасис, Гонсало Р.; Альмгрен, Питер; Андерсен, Гитте; Ардли, Кристина; Бострем, Кристина Бенгтссон; Бергман, Ричард Н; Бонникасл, Лори Л; Борх-Йонсен, Кнут; Бертт, Кристмас П; Чен, Хун; китаец Питер С.; Дейли, Марк Дж ; Деодхар, Паримал; Дин, Чиа-Джен; Дони, Алекс С.Ф.; Дюрен, Уильям Л; Эллиотт, Кэтрин С; Эрдос, Майкл Р.; Фрейлинг, Тимоти М; Фрити, Рэйчел М; Джаннини, Лорен; Граллерт, Харальд; Граруп, Нильс; Гроувс, Кристофер Дж; Гуидуччи, Кэндис; Хансен, Торбен; Гердер, Кристиан; Хитмэн, Грэм А; Хьюз, Томас Э; Исомаа, Бо; Джексон, Энн Ю; Йоргенсен, Торбен; Конг, Августин; Баланс, Кэрри; Курувилла, Финни Дж; Куусисто, Джоанна; Лангенберг, Клаудия; Ланге, Ханна; Лауритцен, Торстен; Ли, Юн; Линдгрен, Сесилия М; Лысенко Валерия; Марвелл, Аманда Ф; Мейзингер, Криста; Мидтьель, Кристиан; Мольке, Карен Л; Моркен, Марио А; Моррис, Эндрю Д.; Нарис, Нарис; Нильссон, Питер; Оуэн, Кэтрин Р.; Палмер, Колин Н.А.; Пейн, Фелисити; Перри, Джон РБ; Петтерсен, Элин; Плату, Карл; Прокопенко Инга; Ци, Лу; Цинь, Ли; Рейнер, Найджел В.; Рис, Мэтью; Руа, Джеффри Дж; Сандбек, Анелли; Шилдс, Беверли; Шегрен, Маркета; Штайнторсдоттир, Валгердур; Стрингхэм, Хизер М; Свифт, Эми Дж; Торлейфссон, Гудмар; Торстейнсдоттир, Уннур; Тимпсон, Николас Дж; Туоми, Тинамайя; Туомилето, Джеймс; Уокер, Марк; Ватанабэ, Ричард М; Уидон, Майкл Н; Уиллер, Кристен Дж; Иллиг, Томас; Хвеем, Кристиан; Ху, Фрэнк Б; Лааксон, Марк; Стефанссон, Кари; Педерсен, Олуф; Уэрхэм, Николас Дж; Баррозу, Инес; Хаттерсли, Эндрю Т; Коллинз, Фрэнсис С; Группа, Лейф; Маккарти, Марк I; Бенке, Майкл; Альтшулер, Дэвид (2008). «Метаанализ общегеномных данных об ассоциации и крупномасштабная репликация идентифицируют дополнительные локусы восприимчивости к диабету 2 типа» . Природная генетика . 40 (5): 638–645. дои : 10.1038/ng.120 . ISSN 1061-4036 . ПМК 2672416 . ПМИД 18372903 .