Кэролайн Дж. Браун

Кэролайн Дж. Браун
Кэролайн Дж. Браун
Альма-матер	Университет Гвельфа , бакалавр ; Университет Торонто , доктор философии ; Стэнфордский университет , доктор философии
	Научная карьера
Поля	Генетика человека , Эпигенетика , Х-инактивация
Научные консультанты	Хант Уиллард
Веб-сайт	Веб-страница лаборатории ; Веб-страница университета

Кэролайн Дж. Браун (род. 1961, Онтарио ) — канадский генетик и профессор кафедры медицинской генетики Университета Британской Колумбии . Браун известна своими исследованиями инактивации Х-хромосомы , открыв человеческий ген XIST в 1990 году.

Образование и ранняя карьера

Браун получила степень бакалавра наук в области генетики в 1983 году в Университете Гвельфа , Онтарио. Она начала работу над докторской диссертацией в Университете Торонто в 1983 году под руководством Ханта Уилларда и завершила ее в Стэнфордском университете после переезда лаборатории Уилларда в 1989 году. Браун инициировала исследования Х-хромосомы в лаборатории, и ее докторская диссертация называлась «Исследование инактивации Х-хромосомы человека». Ее работа включала анализ генов, которые «избегают» инактивации Х-хромосомы, экспрессируясь из (иначе) неактивной Х-хромосомы, а также молекулярную характеристику центра Х-инактивации, генетического локуса, необходимого для молчания хромосомы. Эти две темы сошлись воедино при открытии в 1990 году гена XIST , который локализуется в центре Х-инактивации и экспрессируется исключительно из неактивной Х-хромосомы. Об этом открытии сообщалось в двух статьях в журнале Nature в 1991 году. ^{[ 1 ]}^{[ 2 ]}

Уиллард назвал Брауна «критическим человеком, который изменил исследование инактивации X». ^{[ 3 ]} Браун стала научным сотрудником в 1990 году на Стэнфордском факультете генетики, а два года спустя перешла с лабораторией Уилларда на факультет генетики Университета Кейс Вестерн Резерв , штат Огайо, где продолжила изучение длинной некодирующей РНК XIST. Браун стала доцентом (1994 г.) и доцентом (1999 г.) на кафедре медицинской генетики Университета Британской Колумбии в Ванкувере, а в 2004 году получила звание профессора. С 2011 по 2014 год она возглавляла кафедру. руководила более чем двадцатью докторантами и аспирантами в своей лаборатории.

Исследовать

Исследования Брауна направлены на процесс инактивации Х-хромосомы у человека. Ее лаборатория выявила критические различия между инактивацией Х-хромосомы мыши и человека, такие как отсутствие отцовской инактивации Х-хромосомы во внеэмбриональных тканях человека, более высокая доля человеческих «беглецов» и идентификация различных регуляторных последовательностей человеческого XIST и мышиного Xist. ^{[ 4 ]}^{[ 5 ]} Ее лаборатория каталогизирует ускользающие гены, используя как анализ экспрессии, так и анализ метилирования ДНК , чтобы определить, какие гены способствуют половым различиям в восприимчивости к заболеваниям и какие области ДНК восприимчивы или устойчивы к эпигенетическому подавлению генов. ^{[ 6 ]}^{[ 7 ]}^{[ 8 ]}^{[ 9 ]} Поскольку эмбриональные стволовые клетки человека эпигенетически нестабильны, Браун и его коллеги разработали альтернативные модельные системы для изучения инактивации человека, включая индуцибельные трансгены XIST в соматических клетках человека , гибриды соматических клеток человека , сохраняющие активную или неактивную Х-хромосому, и мышиные клетки с Х-хромосомой. сцепленные трансгены ДНК человека. ^{[ 10 ]} Ее лаборатория сотрудничает с другими исследовательскими группами Детской больницы Британской Колумбии и Агентства по борьбе с раком Британской Колумбии с целью изучения клинической значимости Х-сцепленной инактивации и экспрессии в предрасположенности к заболеваниям, прогрессировании рака, а также Х-сцепленных заболеваниях , хромосомных перестройках и анеуплоидиях . ^{[ 11 ]}^{[ 12 ]}^{[ 13 ]}^{[ 14 ]}^{[ 15 ]}^{[ 16 ]}

Награды и почести

1983–1987: NSERC 1967 года. Стипендия к столетнему юбилею выпускников
1988: Премия за презентацию докторской степени в области фундаментальных наук от Американского общества генетики человека.
1995-2000: Стипендия MRC.
1999: Премии факультета преподавания
2001: Научный сотрудник, Институт перспективных исследований Питера Уолла, UBC.
2008: Преподавательская премия UBC Killam
2018: Почетный член Канадского колледжа медицинской генетики.

Ссылки

У Схолии есть авторский профиль Кэролин Дж. Браун .

^ Браун, Кэролин Дж.; Баллабио, Андреа; Руперт, Джеймс Л.; Лафреньер, Рональд Г.; Громпе, Маркус; Тонлоренци, Россана; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Ген из области центра инактивации Х человека экспрессируется исключительно из неактивной Х-хромосомы». Природа . 349 (6304): 38–44. Бибкод : 1991Natur.349...38B . дои : 10.1038/349038a0 . ПМИД 1985261 . S2CID 4332325 .
^ Браун, Кэролин Дж.; Лафреньер, Рональд Г.; Пауэрс, Вики Э.; Себастио, Джанфранко; Баллабио, Андреа; Петтигрю, Анжана Л.; Ледбеттер, Дэвид Х.; Леви, Элейн; Крейг, Ян В.; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Локализация центра инактивации X на X-хромосоме человека в Xq13». Природа . 349 (6304): 82–84. Бибкод : 1991Natur.349...82B . дои : 10.1038/349082a0 . ПМИД 1985270 . S2CID 4360783 .
^ Уиллард, Хантингтон Ф. (2010). «Обращение к премии Уильяма Аллана 2009 года: Жизнь в песочнице: незавершенное дело» . Американский журнал генетики человека . 86 (3): 318–327. дои : 10.1016/j.ajhg.2010.01.037 . ПМЦ 2833390 .
^ Йен, ZC; Мейер, И.М.; Каралич, С.; Браун, CJ (2007). «Межвидовое сравнение инактивации Х-хромосомы у Eutheria» . Геномика . 90 (4): 453–63. дои : 10.1016/j.ygeno.2007.07.002 . ПМИД 17728098 .
^ Чанг, Южная Каролина; Браун, CJ (2010). «Идентификация регуляторных элементов, окружающих XIST человека, выявляет видовые различия» . BMC Молекулярная биология . 11:20 . дои : 10.1186/1471-2199-11-20 . ПМЦ 2841178 . ПМИД 20211024 .
^ Куче, Р.; Браун, CJ (2000). «Определение статуса инактивации Х-хромосомы с использованием X-связанных выраженных полиморфизмов, выявленных путем поиска в базе данных». Геномика . 65 (1): 9–15. дои : 10.1006/geno.2000.6153 . ПМИД 10777660 .
^ Коттон, AM; Лам, Л.; Аффлек, Дж.Г.; Уилсон, И.М.; Пеньяэррера, MS; Макфадден, Делавэр; Кобор, М.С.; Лам, WL; Робинсон, В.П.; Браун, CJ (2011). «Анализ метилирования ДНК по всей хромосоме предсказывает тканеспецифическую инактивацию X человека» . Генетика человека . 130 (2): 187–201. дои : 10.1007/s00439-011-1007-8 . ПМК 3132437 . ПМИД 21597963 .
^ Коттон, AM; Ге, Б.; Свет, Н.; Адуэ, В.; Пастинен, Т.; Браун, CJ (2013). «Анализ экспрессируемых SNP определяет различную степень экспрессии неактивной Х-хромосомы человека» . Геномная биология . 14 (11): 122 р. дои : 10.1186/gb-2013-14-11-r122 . ПМК 4053723 . ПМИД 24176135 .
^ Коттон, AM; Цена, ЕМ; Джонс, MJ; Балатон, БП; Кобор, М.С.; Браун, CJ (2015). «Ландшафт метилирования ДНК на Х-хромосоме отражает плотность CpG, функциональное состояние хроматина и инактивацию Х-хромосомы» . Молекулярная генетика человека . 24 (6): 1528–39. дои : 10.1093/hmg/ddu564 . ПМЦ 4381753 . ПМИД 25381334 .
^ Тинкер, А.В.; Браун, CJ (1998). «Индукция экспрессии XIST из активной Х-хромосомы человека в гибридах соматических клеток мыши и человека путем деметилирования ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (12): 2935–40. дои : 10.1093/нар/26.12.2935 . ПМК 147638 . ПМИД 9611238 .
^ Доусон, Эй Джей; Викстром, Делавэр; Риордан, Д.; Кардуэлл, С.; Кейси, Р.; Болдри, С.; Браун, К. (2004). «Уникальный пациент с вариантом синдрома Ульриха-Тёрнера и мозаицизмом крошечного r(X) и частичной проксимальной дупликации 1q». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 124А (3): 303–6. дои : 10.1002/ajmg.a.20302 . ПМИД 14708105 . S2CID 13408738 .
^ Гибб, Э.А.; Вучич, Э.А.; Энфилд, Канзас; Стюарт, Г.Л.; Лонерган, КМ; Кеннетт, JY; Беккер-Сантос, Д.Д.; Маколей, CE; Лам, С.; Браун, CJ; Лам, WL (2011). «Длинные некодирующие РНК-транскриптомы рака человека» . ПЛОС ОДИН . 6 (10): е25915. Бибкод : 2011PLoSO...625915G . дои : 10.1371/journal.pone.0025915 . ПМК 3185064 . ПМИД 21991387 .
^ Чунг, К.Дж.; Джонсон, Северная Каролина; Аффлек, Дж.Г.; Северсон, Т.; Стейдл, К.; Бен-Нерия, С.; Шейн, Дж.; Морин, РД; Мур, Р.; Шах, СП; Цянь, Х.; Пол, Дж. Э.; Телениус, А.; Реландер, Т.; Лам, В.; Сэвидж, К.; Коннорс, Дж. М.; Браун, К.; Марра, Массачусетс; Гаскойн, РД; Хорсман, Делавэр (2010). «Приобретенные мутации TNFRSF14 при фолликулярной лимфоме связаны с худшим прогнозом» . Исследования рака . 70 (22): 9166–74. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-10-2460 . ПМИД 20884631 .
^ Джонсон, Северная Каролина; Аль-Тура, А.; Браун, CJ; Коннорс, Дж. М.; Гаскойн, РД; Хорсман, Делавэр (2008). «Прогностическое значение вторичных цитогенетических изменений при фолликулярных лимфомах». Гены, хромосомы и рак . 47 (12): 1038–48. дои : 10.1002/gcc.20606 . ПМИД 18720523 . S2CID 20432234 .
^ Хатакеяма, К.; Андерсон, CL; Бивер, CL; Пеньяэррера, MS; Браун, CJ; Робинсон, WP (2004). «Динамика отклонения Х-инактивации с возрастом женщин». Клиническая генетика . 66 (4): 327–32. дои : 10.1111/j.1399-0004.2004.00310.x . ПМИД 15355435 . S2CID 23931974 .
^ Бивер, CL; Стивенсон, доктор медицины; Пеньяэррера, MS; Цзян, Р. Х.; Калоусек, ДК; Хайден, М.; Филд, Л.; Браун, CJ; Робинсон, WP (2003). «Наклонная инактивация Х-хромосомы связана с трисомией у женщин, установленной на основании привычных самопроизвольных абортов или хромосомно-аномальных беременностей» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 399–407. дои : 10.1086/346119 . ПМЦ 379232 . ПМИД 12497247 .

[1] Браун, Кэролин Дж.; Баллабио, Андреа; Руперт, Джеймс Л.; Лафреньер, Рональд Г.; Громпе, Маркус; Тонлоренци, Россана; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Ген из области центра инактивации Х человека экспрессируется исключительно из неактивной Х-хромосомы». Природа . 349 (6304): 38–44. Бибкод : 1991Natur.349...38B . дои : 10.1038/349038a0 . ПМИД 1985261 . S2CID 4332325 .

[2] Браун, Кэролин Дж.; Лафреньер, Рональд Г.; Пауэрс, Вики Э.; Себастио, Джанфранко; Баллабио, Андреа; Петтигрю, Анжана Л.; Ледбеттер, Дэвид Х.; Леви, Элейн; Крейг, Ян В.; Уиллард, Хантингтон Ф. (1991). «Локализация центра инактивации X на X-хромосоме человека в Xq13». Природа . 349 (6304): 82–84. Бибкод : 1991Natur.349...82B . дои : 10.1038/349082a0 . ПМИД 1985270 . S2CID 4360783 .

[3] Уиллард, Хантингтон Ф. (2010). «Обращение к премии Уильяма Аллана 2009 года: Жизнь в песочнице: незавершенное дело» . Американский журнал генетики человека . 86 (3): 318–327. дои : 10.1016/j.ajhg.2010.01.037 . ПМЦ 2833390 .

[4] Йен, ZC; Мейер, И.М.; Каралич, С.; Браун, CJ (2007). «Межвидовое сравнение инактивации Х-хромосомы у Eutheria» . Геномика . 90 (4): 453–63. дои : 10.1016/j.ygeno.2007.07.002 . ПМИД 17728098 .

[5] Чанг, Южная Каролина; Браун, CJ (2010). «Идентификация регуляторных элементов, окружающих XIST человека, выявляет видовые различия» . BMC Молекулярная биология . 11:20 . дои : 10.1186/1471-2199-11-20 . ПМЦ 2841178 . ПМИД 20211024 .

[6] Куче, Р.; Браун, CJ (2000). «Определение статуса инактивации Х-хромосомы с использованием X-связанных выраженных полиморфизмов, выявленных путем поиска в базе данных». Геномика . 65 (1): 9–15. дои : 10.1006/geno.2000.6153 . ПМИД 10777660 .

[7] Коттон, AM; Лам, Л.; Аффлек, Дж.Г.; Уилсон, И.М.; Пеньяэррера, MS; Макфадден, Делавэр; Кобор, М.С.; Лам, WL; Робинсон, В.П.; Браун, CJ (2011). «Анализ метилирования ДНК по всей хромосоме предсказывает тканеспецифическую инактивацию X человека» . Генетика человека . 130 (2): 187–201. дои : 10.1007/s00439-011-1007-8 . ПМК 3132437 . ПМИД 21597963 .

[8] Коттон, AM; Ге, Б.; Свет, Н.; Адуэ, В.; Пастинен, Т.; Браун, CJ (2013). «Анализ экспрессируемых SNP определяет различную степень экспрессии неактивной Х-хромосомы человека» . Геномная биология . 14 (11): 122 р. дои : 10.1186/gb-2013-14-11-r122 . ПМК 4053723 . ПМИД 24176135 .

[9] Коттон, AM; Цена, ЕМ; Джонс, MJ; Балатон, БП; Кобор, М.С.; Браун, CJ (2015). «Ландшафт метилирования ДНК на Х-хромосоме отражает плотность CpG, функциональное состояние хроматина и инактивацию Х-хромосомы» . Молекулярная генетика человека . 24 (6): 1528–39. дои : 10.1093/hmg/ddu564 . ПМЦ 4381753 . ПМИД 25381334 .

[10] Тинкер, А.В.; Браун, CJ (1998). «Индукция экспрессии XIST из активной Х-хромосомы человека в гибридах соматических клеток мыши и человека путем деметилирования ДНК» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (12): 2935–40. дои : 10.1093/нар/26.12.2935 . ПМК 147638 . ПМИД 9611238 .

[11] Доусон, Эй Джей; Викстром, Делавэр; Риордан, Д.; Кардуэлл, С.; Кейси, Р.; Болдри, С.; Браун, К. (2004). «Уникальный пациент с вариантом синдрома Ульриха-Тёрнера и мозаицизмом крошечного r(X) и частичной проксимальной дупликации 1q». Американский журнал медицинской генетики. Часть А. 124А (3): 303–6. дои : 10.1002/ajmg.a.20302 . ПМИД 14708105 . S2CID 13408738 .

[12] Гибб, Э.А.; Вучич, Э.А.; Энфилд, Канзас; Стюарт, Г.Л.; Лонерган, КМ; Кеннетт, JY; Беккер-Сантос, Д.Д.; Маколей, CE; Лам, С.; Браун, CJ; Лам, WL (2011). «Длинные некодирующие РНК-транскриптомы рака человека» . ПЛОС ОДИН . 6 (10): е25915. Бибкод : 2011PLoSO...625915G . дои : 10.1371/journal.pone.0025915 . ПМК 3185064 . ПМИД 21991387 .

[13] Чунг, К.Дж.; Джонсон, Северная Каролина; Аффлек, Дж.Г.; Северсон, Т.; Стейдл, К.; Бен-Нерия, С.; Шейн, Дж.; Морин, РД; Мур, Р.; Шах, СП; Цянь, Х.; Пол, Дж. Э.; Телениус, А.; Реландер, Т.; Лам, В.; Сэвидж, К.; Коннорс, Дж. М.; Браун, К.; Марра, Массачусетс; Гаскойн, РД; Хорсман, Делавэр (2010). «Приобретенные мутации TNFRSF14 при фолликулярной лимфоме связаны с худшим прогнозом» . Исследования рака . 70 (22): 9166–74. дои : 10.1158/0008-5472.CAN-10-2460 . ПМИД 20884631 .

[14] Джонсон, Северная Каролина; Аль-Тура, А.; Браун, CJ; Коннорс, Дж. М.; Гаскойн, РД; Хорсман, Делавэр (2008). «Прогностическое значение вторичных цитогенетических изменений при фолликулярных лимфомах». Гены, хромосомы и рак . 47 (12): 1038–48. дои : 10.1002/gcc.20606 . ПМИД 18720523 . S2CID 20432234 .

[15] Хатакеяма, К.; Андерсон, CL; Бивер, CL; Пеньяэррера, MS; Браун, CJ; Робинсон, WP (2004). «Динамика отклонения Х-инактивации с возрастом женщин». Клиническая генетика . 66 (4): 327–32. дои : 10.1111/j.1399-0004.2004.00310.x . ПМИД 15355435 . S2CID 23931974 .

[16] Бивер, CL; Стивенсон, доктор медицины; Пеньяэррера, MS; Цзян, Р. Х.; Калоусек, ДК; Хайден, М.; Филд, Л.; Браун, CJ; Робинсон, WP (2003). «Наклонная инактивация Х-хромосомы связана с трисомией у женщин, установленной на основании привычных самопроизвольных абортов или хромосомно-аномальных беременностей» . Американский журнал генетики человека . 72 (2): 399–407. дои : 10.1086/346119 . ПМЦ 379232 . ПМИД 12497247 .

[ 1 ]

[ 2 ]

[ 3 ]

[ 4 ]

[ 5 ]

[ 6 ]

[ 7 ]

[ 8 ]

[ 9 ]

[ 10 ]

[ 11 ]

[ 12 ]

[ 13 ]

[ 14 ]

[ 15 ]

[ 16 ]

Базы данных авторитетного контроля
Международный	ВИАФ WorldCat
академики	ОРЦИД Давайте опубликуем Идентификатор исследователя Скопус