Jump to content

Последовательность активации вверх по течению

Вышестоящая активирующая последовательность или вышестоящая активационная последовательность (UAS) представляет собой цис-действующую регуляторную последовательность, обнаруженную у дрожжей , таких как Saccharomyces cerevisiae . Он отличается от промотора и увеличивает экспрессию соседнего гена . Из-за своей важной роли в активации транскрипции вышестоящую активирующую последовательность часто считают аналогичной функции энхансера у многоклеточных эукариот. [1] Вышестоящие последовательности активации являются важной частью индукции, усиливая экспрессию интересующего белка за счет повышения транскрипционной активности. [2] Вышестоящая последовательность активации находится рядом с минимальным промотором ( ТАТА-бокс ) и служит местом связывания для трансактиваторов . Если транскрипционный трансактиватор не связывается с UAS в правильной ориентации, транскрипция не может начаться. [3] Чтобы лучше понять функцию вышестоящей последовательности активации, полезно увидеть ее роль в каскаде событий, которые приводят к активации транскрипции. Путь начинается, когда активаторы связываются со своей мишенью в UAS, рекрутируя медиатора . Субъединица ТАТА-связывающего белка фактора транскрипции затем связывается с ТАТА-боксом, рекрутируя дополнительные факторы транскрипции. Затем медиатор рекрутирует РНК-полимеразу II в преинициаторный комплекс. После инициации РНК-полимераза II высвобождается из комплекса и начинается транскрипция. [4]

GAL1-GAL10 Межгенная область (UAS G )

[ редактировать ]

Свойство GAL1-GAL10 связываться с белком GAL4 используется в методе GAL4/UAS для контролируемой неправильной экспрессии генов у дрозофилы. Это самая популярная форма бинарной экспрессии у Drosophila melanogaster , системы, которая была адаптирована для многих целей, чтобы сделать Drosophila melanogaster одним из наиболее генетически поддающихся многоклеточным организмам. [5] В этом методе четыре родственных сайта связывания между локусами GAL10 и GAL1 в Saccharomyces cerevisiae служат элементом восходящих активирующих последовательностей (UAS) посредством связывания GAL4 . [6] Несколько исследований было проведено с Saccharomyces cerevisiae для изучения точной функции вышележащих последовательностей активации, часто сосредотачиваясь на вышеупомянутой межгенной области GAL1-GAL10 . [7] Консенсус: 5'-CGG-N 11 -CCG-3'. [8]

В одном исследовании изучалась восходящая активационная последовательность, реагирующая на галактозу (UAS G ), рассматривая влияние близости к этой UAS на позиционирование нуклеосом. Близость к UAS была выбрана потому, что делеции ДНК, фланкирующие UAS, оставили массив нуклеосом неизменным, что указывает на то, что расположение нуклеосом не связано со специфичными для последовательности взаимодействиями гистона и ДНК. Роль конкретных участков UAS G была проанализирована путем вставки олигонуклеотидов с различными свойствами связывания, что привело к успешной идентификации участка, ответственного за создание упорядоченного массива. Идентифицированная последовательность перекрывает сайт связывания белка GAL4 , который является положительным регулятором транскрипции, что совпадает с функцией вышестоящих активирующих последовательностей. [9]

В другом исследовании изучался эффект вставки UAS G в промоторную область гена глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы (GPD) [1] . Этот гибридный промотор затем был использован для экспрессии человеческого иммунного интерферона, токсичного вещества для дрожжей, что приводит к уменьшению числа копий и низкой стабильности плазмиды. По сравнению с нативным промотором экспрессия гибридного промотора индуцировалась в культурах примерно в 150-200 раз за счет роста галактозы, причем индукция не была очевидна при использовании глюкозы в качестве источника углерода. По сравнению с нативным промотором GPD присутствие UAS G приводило к тому, что транскрипционная активность оставалась эквивалентно повышенной в индуцированных условиях. [10]

Восходящая последовательность активации, чувствительная к инозитолу (UAS INO )

[ редактировать ]

Чувствительная к инозитолу восходящая активационная последовательность (UAS INO ) имеет консенсусную последовательность 5'-CATGTGAAAT-3' и присутствует в промоторных областях генов, кодирующих ферменты биосинтеза фосфолипидов. Эти ферменты регулируются инозитолом и холином, которые являются предшественниками фосфолипидов. В этой консенсусной последовательности первые шесть оснований гомологичны каноническому мотиву связывания для белков внутри bHLH или основного семейства спираль-петля-спираль . Исследования показали, что Ino2p и Ino4p, два регуляторных белка bHLH из Saccharomyces cerevisiae , связываются с фрагментами промотора, содержащими этот элемент консенсусной последовательности. Дополнительные исследования были разработаны для более детального изучения функции UAS INO , в основном потому, что большое количество активностей ферментов биосинтеза фосфолипидов в модельном организме Saccharomyces cerevisiae демонстрируют этот общий образец экспрессии. [11]

В одном исследовании более подробно изучалось взаимодействие между Ino4p и Ino2p, изучая димеризацию, которая происходит между ними до связывания с промотором гена INO 1 и активации транскрипции. Выделив 31 рецессивный супрессор мутанта ino 4-8 дрожжей и определив, что 29 из них принадлежат к одному и тому же локусу, исследователи идентифицировали этот локус как REG1 [2] . Один аллель REG1 , мутант-супрессор sia1-1 , был способен подавлять ауксотрофию инозитола, открывая возможный путь репрессии чувствительных к инозитолу расположенных выше активирующих последовательностей генов дрожжей. [12]

  1. ^ Вебстер, Ноколас; Джин, Цзя Руй; Грин, Стивен; Холлис, Мелвин; Шамбон, Пьер (29 января 1988 г.). «Дрожжевой UAS G является усилителем транскрипции в клетках hela человека в присутствии транс-активатора GAL4». Клетка . 52 (2): 169–178. дои : 10.1016/0092-8674(88)90505-3 . ПМИД   2830022 . S2CID   26819676 .
  2. ^ Уэст-младший, Роберт В.; Йокум, Р. Роджерс; Пташне, Марк (ноябрь 1984 г.). « Дивергенетный промоторный регион Saccharomyces cerevisiae GAL1-GAL10: расположение и функция восходящей активирующей последовательности UAS G » . Молекулярная и клеточная биология . 4 (11): 2467–2478. дои : 10.1128/MCB.4.11.2467 . ПМК   369078 . ПМИД   6392852 .
  3. ^ Левандоски, Марк (октябрь 2001 г.). «Условный контроль экспрессии генов у мышей» . Обзоры природы Генетика . 2 (10): 743–755. дои : 10.1038/35093537 . ПМИД   11584291 . S2CID   27099914 .
  4. ^ Вион, Дидье; Казадезус, Хосеп (март 2006 г.). 6 -метиладенин: эпигенетический сигнал для взаимодействий ДНК-белок» . Nature Reviews Microbiology . 4 (3): 183–192. : 10.1038 /nrmicro1350 . PMC   2755769. . PMID   16489347 doi
  5. ^ Виммер, Эрнст А. (март 2003 г.). «Применение трансгенеза насекомых». Обзоры природы Генетика . 4 (3): 225–232. дои : 10.1038/nrg1021 . ПМИД   12610527 . S2CID   7668484 .
  6. ^ Даффи, Джозеф Б. (2002). «Система GAL4 при дрозофилии: швейцарский армейский нож генетика мух» . Бытие . 34 (1–2): 1–15. дои : 10.1002/gen.10150 . ПМИД   12324939 .
  7. ^ «ГАЛ10» . WikiGenes — Совместное издательство . Проверено 8 апреля 2019 г.
  8. ^ Травен, А; Еличич, Б; Сопта, М. (май 2006 г.). «Дрожжи Gal4: новый взгляд на транскрипционную парадигму» . Отчеты ЭМБО . 7 (5): 496–9. дои : 10.1038/sj.embor.7400679 . ПМЦ   1479557 . ПМИД   16670683 .
  9. ^ Федор, Марта Дж.; Лю, Нил Ф.; Корнберг, Роджер Д. (5 ноября 1988 г.). «Статистическое позиционирование нуклеосом путем специфического связывания белка с расположенной выше активирующей последовательностью у дрожжей». Журнал молекулярной биологии . 204 (1): 109–127. дои : 10.1016/0022-2836(88)90603-1 . ПМИД   3063825 .
  10. ^ Биттер, Грант А.; Иган, Кевин М. (30 сентября 1988 г.). «Экспрессия гамма-интерферона из гибридных дрожжевых промоторов GPD, содержащих восходящие регуляторные последовательности из межгенной области GAL1-GAL10». Джин . 69 (2): 193–207. дои : 10.1016/0378-1119(88)90430-1 . ПМИД   2853097 .
  11. ^ Баххават, Нандита; Оуян, Цянь; Генри, Сьюзен А. (20 октября 1995 г.). «Функциональная характеристика инозитол-чувствительной восходящей последовательности активации у дрожжей: цис-регуляторный элемент, ответственный за инозитолхолин-опосредованную регуляцию биосинтеза фосфолипидов» . Журнал биологической химии . 270 (42): 25087–25095. дои : 10.1074/jbc.270.42.25087 . ПМИД   7559640 .
  12. ^ Оуян, Цянь; Руис-Норьега, Моника; Генри, Сьюзен А. (1 мая 1999 г.). « Продукт гена REG1 необходим для репрессии INO1 и других генов дрожжей, содержащих восходящие активирующие последовательности инозитола» . Генетика . 152 (1): 89–100. ПМК   1460607 . ПМИД   10224245 .
Arc.Ask3.Ru: конец переведенного документа.
Arc.Ask3.Ru
Номер скриншота №: 4354cdd6a3f0962d74c9b0988ee0fdd5__1717094460
URL1:https://arc.ask3.ru/arc/aa/43/d5/4354cdd6a3f0962d74c9b0988ee0fdd5.html
Заголовок, (Title) документа по адресу, URL1:
Upstream activating sequence - Wikipedia
Данный printscreen веб страницы (снимок веб страницы, скриншот веб страницы), визуально-программная копия документа расположенного по адресу URL1 и сохраненная в файл, имеет: квалифицированную, усовершенствованную (подтверждены: метки времени, валидность сертификата), открепленную ЭЦП (приложена к данному файлу), что может быть использовано для подтверждения содержания и факта существования документа в этот момент времени. Права на данный скриншот принадлежат администрации Ask3.ru, использование в качестве доказательства только с письменного разрешения правообладателя скриншота. Администрация Ask3.ru не несет ответственности за информацию размещенную на данном скриншоте. Права на прочие зарегистрированные элементы любого права, изображенные на снимках принадлежат их владельцам. Качество перевода предоставляется как есть. Любые претензии, иски не могут быть предъявлены. Если вы не согласны с любым пунктом перечисленным выше, вы не можете использовать данный сайт и информация размещенную на нем (сайте/странице), немедленно покиньте данный сайт. В случае нарушения любого пункта перечисленного выше, штраф 55! (Пятьдесят пять факториал, Денежную единицу (имеющую самостоятельную стоимость) можете выбрать самостоятельно, выплаичвается товарами в течение 7 дней с момента нарушения.)