Пептидный атлас

PeptideAtlas — это ресурс данных по протеомике , который собирает наборы данных тандемной масс-спектрометрии со всего мира, повторно обрабатывает их с помощью Trans-Proteomic Pipeline и делает объединенные результаты бесплатными для сообщества . Peptide Atlas является одним из основателей консорциума ProteomeXchange .

История

Самая ранняя концепция PeptideAtlas возникла в Институте системной биологии в исследовательской лаборатории Руди Эберсольда Эриком Дойчем и Шэрон Чен в базе данных аннотированных пептидов (APD). Концепция была расширена благодаря дополнительным усилиям Парага Маллика и Фрэнка Дезиера. Первый экземпляр множества экспериментов на людях был опубликован в 2004 году под названием Human PeptideAtlas. ^[1]

С течением времени эта концепция была расширена на многие другие виды благодаря усилиям Николь Кинг, Чжи Сан, Терри Фарры и Дэйва Кэмпбелла.

Текущий статус

PeptideAtlas до сих пор поддерживается и развивается в Институте системной биологии в исследовательской лаборатории Роберта Морица под руководством Эрика Дойча и при значительных усилиях Чжи Сана и Дэйва Кэмпбелла.

См. также

Внешние ссылки

Веб-сайт PeptideAtlas (www.peptideatlas.org)

Ссылки

^ Дезиер, Фрэнк; Дойч, Эрик В.; Несвижский, Алексей Иванович; Маллик, Параг; Кинг, Николь Л.; Энг, Джимми К.; Адерем, Алан; Бойл, Роуз; Бруннер, Эрих; Донохью, Сэмюэл; Фаусто, Нельсон; Хафен, Эрнст; Худ, Ли; Катце, Майкл Г.; Кеннеди, Кэтлин А.; Крегенов, Флойд; Ли, Хукеун; Линь, Бяоян; Мартин, Дэн; Раниш, Джеффри А.; Роулингс, Дэвид Дж.; Самельсон, Лоуренс Э.; Шио, Юдзуру; Уоттс, Джулиан Д.; Вольшайд, Бернд; Райт, Майкл Э.; Ян, Вэй; Ян, Лихун; Йи, Юджин С.; Чжан, Хуэй; Эберсольд, Руди (2005). «Интеграция с геномом человека пептидных последовательностей, полученных методом высокопроизводительной масс-спектрометрии» . Геномная биология . 6 (1): –9. дои : 10.1186/gb-2004-6-1-r9 . ISSN 1474-760X . ПМК 549070 . ПМИД 15642101 .

[1] Дезиер, Фрэнк; Дойч, Эрик В.; Несвижский, Алексей Иванович; Маллик, Параг; Кинг, Николь Л.; Энг, Джимми К.; Адерем, Алан; Бойл, Роуз; Бруннер, Эрих; Донохью, Сэмюэл; Фаусто, Нельсон; Хафен, Эрнст; Худ, Ли; Катце, Майкл Г.; Кеннеди, Кэтлин А.; Крегенов, Флойд; Ли, Хукеун; Линь, Бяоян; Мартин, Дэн; Раниш, Джеффри А.; Роулингс, Дэвид Дж.; Самельсон, Лоуренс Э.; Шио, Юдзуру; Уоттс, Джулиан Д.; Вольшайд, Бернд; Райт, Майкл Э.; Ян, Вэй; Ян, Лихун; Йи, Юджин С.; Чжан, Хуэй; Эберсольд, Руди (2005). «Интеграция с геномом человека пептидных последовательностей, полученных методом высокопроизводительной масс-спектрометрии» . Геномная биология . 6 (1): –9. дои : 10.1186/gb-2004-6-1-r9 . ISSN 1474-760X . ПМК 549070 . ПМИД 15642101 .

[1]