Атипичные SLC
 | Эта статья может быть слишком технической для понимания большинства читателей . ( Август 2017 г. ) |
Семейства атипичных переносчиков растворенных веществ (атипичные SLC) представляют собой новые вероятные вторичные активные или облегчающие белки-переносчики, которые имеют общее предковое происхождение с известными семействами переносчиков растворенных веществ (SLC) . Однако им не было присвоено имя в соответствии с корневой системой SLC и они не были отнесены ни к одному из существующих семейств SLC. [ 1 ] [ 2 ]
Атипичные транспортные семейства суперсемейства основных посредников
[ редактировать ]Большинство атипичных SLC представляют собой семьи внутри суперсемейства основных фасилитаторов (MFS). [ 3 ] Эти атипичные SLC являются вероятными вторичными активными или вспомогательными белками-переносчиками, которые имеют общее происхождение с известными растворенными переносчиками . [ 1 ] [ 2 ] [ 4 ] Однако они не названы в соответствии с корневой системой SLC и не отнесены ни к одному из существующих семейств SLC. [ 1 ] ATMF классифицируются на основе сходства их последовательностей и филогенетической близости. [ 3 ]
| АМТФ | Члены семьи | Семья SLC |
|---|---|---|
| АМТФ1 | МФСД9, МФСД10, МФСД14А, МФСД14Б | SLC46 |
| АМТФ2 | МФСД8 | |
| АМТФ3 | МФСД4А, МФСД4Б | |
| АМТФ4 | CLN3 | |
| АМТФ5 | МФСД7 | SLC49 |
| АМТФ6 | МФСД1, МФСД5 | |
| АМТФ7 | МФСД12 | |
| АМТФ8 | МФСД2А, МФСД2Б | |
| АМТФ9 | SV2A, SV2B, SV2C, SVOP, SVOPL | SLC22 |
| АМТФ10 | МФСД11, UNC93A, UNC93B1 | |
| АМТФ11 | СПНС1, СПНС2, СПНС3 | |
| АМТФ12 | МФСД13А | |
| АМТФ13 | МФСД6 | |
| АМТФ14 | МФСД6Л | |
| АМТФ15 | МФСД3 |
Некоторые атипичные SLC типа MFS: OCA2 , CLN3 , SPNS1, SPNS2 , SPNS3 SV2A , , SV2B , SV2C, SVOP, SVOPL, MFSD1 , MFSD2A , MFSD2B, MFSD3 , MFSD4A, [ 5 ] МФСД4Б, МФСД5 , МФСД6, МФСД6Л, МФСД8 , МФСД9 , [ 5 ] MFSD10, MFSD11 , MFSD12, MFSD13A, MFSD14A , MFSD14B , UNC93A [ 6 ] и UNC93B1 . Все это атипичные SLC, обнаруженные в суперсемействе основных фасилитаторов . Также атипичными SLC у человека являются TMEM104 (клан APC), OCA2 (клан IT) и CLN3 (не имеющий клана). [ 7 ] [ 8 ] [ 9 ]
Семейства транспорта без MFS
[ редактировать ]Хотя большинство атипичных SLC относятся к суперсемейству основных фасилитаторов, есть исключения: TMEM104 ( суперсемейство APC ), OCA2 (суперсемейство IT) и CLN3 (неизвестное суперсемейство). [ 1 ]
Ссылки
[ редактировать ]- ^ Перейти обратно: а б с д Перланд Э., Фредрикссон Р. (март 2017 г.). «Системы классификации вторичных активных транспортеров». Тенденции в фармакологических науках . 38 (3): 305–315. дои : 10.1016/j.tips.2016.11.008 . ПМИД 27939446 .
- ^ Перейти обратно: а б Сридхаран С., Стефанссон О., Шит Х.Б., Фредрикссон Р. (июнь 2011 г.). «Длительная эволюционная консервация и значительная тканевая специфичность нескольких атипичных переносчиков растворенных веществ». Джин . 478 (1–2): 11–18. дои : 10.1016/j.gene.2010.10.011 . ПМИД 21044875 .
- ^ Перейти обратно: а б Перланд Э., Багчи С., Клаессон А., Фредрикссон Р. (сентябрь 2017 г.). «Характеристики 29 новых атипичных носителей растворенных веществ типа суперсемейства основных посредников: эволюционная консервация, предсказанная структура и совместная экспрессия нейронов» . Открытая биология . 7 (9): 170142. doi : 10.1098/rsob.170142 . ПМК 5627054 . ПМИД 28878041 .
- ^ Хёглунд П.Дж., Нордстрем К.Дж., Шиот Х.Б., Фредрикссон Р. (апрель 2011 г.). «Семейства растворенных носителей имеют удивительно долгую эволюционную историю: большинство человеческих семейств существовало до дивергенции билатерийных видов» . Молекулярная биология и эволюция . 28 (4): 1531–1541. дои : 10.1093/molbev/msq350 . ПМЦ 3058773 . ПМИД 21186191 .
- ^ Перейти обратно: а б Перланд Э., Хеллстен С.В., Швейцер Н., Арапи В., Резайи Ф., Бушра М., Фредрикссон Р. (2017). «Структурное предсказание двух новых атипичных переносчиков SLC человека, MFSD4A и MFSD9, и их нейроанатомическое распределение у мышей» . ПЛОС ОДИН . 12 (10): e0186325. Бибкод : 2017PLoSO..1286325P . дои : 10.1371/journal.pone.0186325 . ПМЦ 5648162 . ПМИД 29049335 .
- ^ Седер М.М., Лекхольм Э., Хеллстен С.В., Перланд Э., Фредрикссон Р. (2017). «Нейрональные и периферически экспрессируемые мембраносвязанные UNC93A реагируют на доступность питательных веществ у мышей» . Границы молекулярной нейронауки . 10 :351. doi : 10.3389/fnmol.2017.00351 . ПМК 5671512 . ПМИД 29163028 .
- ^ «Трансмембранный белок 104 TMEM104 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «OCA2 Меланосомный трансмембранный белок OCA2 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 14 марта 2022 г.
- ^ «CLN3 CLN3 лизосомальный/эндосомальный трансмембранный белок, баттенин [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI» . www.ncbi.nlm.nih.gov . Проверено 14 марта 2022 г.
 | Эта о генетике статья незавершена . Вы можете помочь Википедии, расширив ее . |